MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 30012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020892	TGG	2	6	246292	246297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933865
5002	NC_020892	TCC	2	6	246311	246316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933865
5003	NC_020892	GCC	2	6	246321	246326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933865
5004	NC_020892	TCA	2	6	246355	246360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933865
5005	NC_020892	GAG	2	6	246362	246367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933865
5006	NC_020892	CTT	2	6	246437	246442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933865
5007	NC_020892	CGC	2	6	246592	246597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933865
5008	NC_020892	GGA	2	6	246634	246639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933865
5009	NC_020892	AGGT	2	8	246732	246739	25 %	25 %	50 %	0 %	474933865
5010	NC_020892	CGA	2	6	246757	246762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933865
5011	NC_020892	GTC	2	6	246788	246793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933865
5012	NC_020892	CGG	2	6	246808	246813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933865
5013	NC_020892	CGG	2	6	246826	246831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933865
5014	NC_020892	CTC	3	9	246851	246859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933865
5015	NC_020892	GCAT	2	8	246994	247001	25 %	25 %	25 %	25 %	474933866
5016	NC_020892	GA	3	6	247023	247028	50 %	0 %	50 %	0 %	474933866
5017	NC_020892	TCG	2	6	247039	247044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933866
5018	NC_020892	GGC	2	6	247050	247055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933866
5019	NC_020892	GAGG	2	8	247074	247081	25 %	0 %	75 %	0 %	474933866
5020	NC_020892	ATG	2	6	247092	247097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933866
5021	NC_020892	GTGC	2	8	247121	247128	0 %	25 %	50 %	25 %	474933866
5022	NC_020892	TCGA	2	8	247158	247165	25 %	25 %	25 %	25 %	474933866
5023	NC_020892	TG	3	6	247200	247205	0 %	50 %	50 %	0 %	474933866
5024	NC_020892	CAGG	2	8	247331	247338	25 %	0 %	50 %	25 %	474933866
5025	NC_020892	GGA	2	6	247361	247366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933866
5026	NC_020892	TTC	2	6	247422	247427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933866
5027	NC_020892	GAAGA	2	10	247433	247442	60 %	0 %	40 %	0 %	474933866
5028	NC_020892	CTG	2	6	247453	247458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933867
5029	NC_020892	G	6	6	247479	247484	0 %	0 %	100 %	0 %	474933867
5030	NC_020892	GAG	2	6	247539	247544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933867
5031	NC_020892	CGC	2	6	247598	247603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933867
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5033	NC_020892	GATG	2	8	247664	247671	25 %	25 %	50 %	0 %	474933867
5034	NC_020892	GTG	2	6	247759	247764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933867
5035	NC_020892	GGA	2	6	247769	247774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933867
5036	NC_020892	CTG	2	6	247783	247788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933867
5037	NC_020892	TGG	2	6	247880	247885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933867
5038	NC_020892	GAT	2	6	247953	247958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933867
5039	NC_020892	GAG	2	6	247963	247968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933867
5040	NC_020892	GAT	2	6	247982	247987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933867
5041	NC_020892	CTT	2	6	248058	248063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933867
5042	NC_020892	CCG	2	6	248068	248073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933867
5043	NC_020892	GGAG	2	8	248094	248101	25 %	0 %	75 %	0 %	474933867
5044	NC_020892	AGT	2	6	248108	248113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933867
5045	NC_020892	CGT	2	6	248225	248230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933867
5046	NC_020892	TGG	2	6	248270	248275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933867
5047	NC_020892	GAC	2	6	248279	248284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933867
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5049	NC_020892	TCA	2	6	248810	248815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933868
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5051	NC_020892	TCA	2	6	248909	248914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933868
5052	NC_020892	TCA	2	6	248924	248929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933868
5053	NC_020892	ACACCC	2	12	248930	248941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933868
5054	NC_020892	GAC	2	6	248974	248979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933868
5055	NC_020892	CTC	2	6	248980	248985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933868
5056	NC_020892	CGA	3	9	249033	249041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933868
5057	NC_020892	GAT	2	6	249075	249080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933868
5058	NC_020892	ACC	3	9	249091	249099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933868
5059	NC_020892	TAC	2	6	249112	249117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933868
5060	NC_020892	ATC	2	6	249127	249132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933868
5061	NC_020892	AGG	2	6	249146	249151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933868
5062	NC_020892	G	6	6	249161	249166	0 %	0 %	100 %	0 %	474933868
5063	NC_020892	CTG	3	9	249168	249176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933868
5064	NC_020892	TGC	2	6	249178	249183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933868
5065	NC_020892	CGA	2	6	249186	249191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933868
5066	NC_020892	ACC	2	6	249199	249204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933868
5067	NC_020892	CAG	2	6	249244	249249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933868
5068	NC_020892	ATC	2	6	249268	249273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933868
5069	NC_020892	CTG	2	6	249300	249305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933868
5070	NC_020892	GAG	2	6	249343	249348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933868
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5080	NC_020892	CTGC	2	8	249730	249737	0 %	25 %	25 %	50 %	474933868
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5083	NC_020892	GACG	2	8	249844	249851	25 %	0 %	50 %	25 %	474933868
5084	NC_020892	CCGC	2	8	249864	249871	0 %	0 %	25 %	75 %	474933868
5085	NC_020892	TCC	2	6	249913	249918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933868
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5088	NC_020892	TCG	2	6	250188	250193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933869
5089	NC_020892	TCG	2	6	250206	250211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933869
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5091	NC_020892	GCC	2	6	250257	250262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933869
5092	NC_020892	CAC	2	6	250319	250324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933869
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5102	NC_020892	TCGTCA	2	12	250829	250840	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	474933870
5103	NC_020892	ATG	2	6	250887	250892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933870
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5105	NC_020892	CGAGGA	2	12	250941	250952	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	474933870
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5108	NC_020892	CGA	2	6	251045	251050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933871
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5111	NC_020892	TCT	2	6	251195	251200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933871
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5119	NC_020892	CTT	2	6	251601	251606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933871
5120	NC_020892	ACGA	2	8	251608	251615	50 %	0 %	25 %	25 %	474933871
5121	NC_020892	ATG	2	6	251683	251688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933871
5122	NC_020892	GGGC	2	8	251693	251700	0 %	0 %	75 %	25 %	474933871
5123	NC_020892	CGA	2	6	251705	251710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933871
5124	NC_020892	CTT	2	6	251721	251726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933871
5125	NC_020892	GAA	2	6	251802	251807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933871
5126	NC_020892	TGA	2	6	251825	251830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933871
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5128	NC_020892	CCGATG	2	12	251938	251949	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	474933871
5129	NC_020892	CCT	2	6	252035	252040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933871
5130	NC_020892	GAGGAA	2	12	252051	252062	50 %	0 %	50 %	0 %	474933871
5131	NC_020892	GAC	2	6	252066	252071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933871
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5133	NC_020892	CCG	2	6	252106	252111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933871
5134	NC_020892	GAC	2	6	252123	252128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933871
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5144	NC_020892	TGA	2	6	252581	252586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933871
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5146	NC_020892	CGT	2	6	252656	252661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933871
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5152	NC_020892	CTT	2	6	253021	253026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933871
5153	NC_020892	CTG	2	6	253074	253079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933871
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5221	NC_020892	GAT	2	6	257260	257265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933878
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5230	NC_020892	AT	3	6	258054	258059	50 %	50 %	0 %	0 %	474933880
5231	NC_020892	GTA	2	6	258069	258074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933880
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5237	NC_020892	ATC	2	6	258358	258363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933880
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5243	NC_020892	GT	3	6	258507	258512	0 %	50 %	50 %	0 %	474933880
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5479	NC_020892	TGA	2	6	270554	270559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933894
5480	NC_020892	TCG	2	6	270580	270585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933894
5481	NC_020892	CGT	2	6	270617	270622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933894
5482	NC_020892	GTG	2	6	270634	270639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933894
5483	NC_020892	GGT	2	6	270678	270683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933894
5484	NC_020892	CGA	2	6	270710	270715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933894
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