MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thalassolituus oleivorans MIL-1 complete genome

Total Repeats: 68281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020888	ATT	2	6	56876	56881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	473827458
1003	NC_020888	AGGGA	2	10	56959	56968	40 %	0 %	60 %	0 %	473827458
1004	NC_020888	TTG	2	6	57289	57294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	473827459
1005	NC_020888	TTC	2	6	57348	57353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	473827459
1006	NC_020888	TGT	2	6	57374	57379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	473827459
1007	NC_020888	GA	3	6	57469	57474	50 %	0 %	50 %	0 %	473827460
1008	NC_020888	GTT	2	6	57566	57571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	473827460
1009	NC_020888	CTAAGC	2	12	57573	57584	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	473827460
1010	NC_020888	ACA	2	6	57597	57602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	473827460
1011	NC_020888	TGA	2	6	57706	57711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473827460
1012	NC_020888	ATC	2	6	57727	57732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473827460
1013	NC_020888	AC	3	6	57783	57788	50 %	0 %	0 %	50 %	473827460
1014	NC_020888	CAT	2	6	57799	57804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473827460
1015	NC_020888	TTCTAA	2	12	57820	57831	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	473827460
1016	NC_020888	AGA	2	6	57860	57865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	473827460
1017	NC_020888	AATA	2	8	58033	58040	75 %	25 %	0 %	0 %	473827460
1018	NC_020888	TGG	2	6	58045	58050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473827460
1019	NC_020888	CAGC	2	8	58072	58079	25 %	0 %	25 %	50 %	473827460
1020	NC_020888	GC	3	6	58164	58169	0 %	0 %	50 %	50 %	473827460
1021	NC_020888	CAT	2	6	58234	58239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473827460
1022	NC_020888	TGC	2	6	58256	58261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473827460
1023	NC_020888	GTC	2	6	58348	58353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473827460
1024	NC_020888	TTG	2	6	58390	58395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	473827460
1025	NC_020888	CAC	2	6	58402	58407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473827460
1026	NC_020888	TAA	2	6	58423	58428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	473827460
1027	NC_020888	TTG	2	6	58483	58488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	473827460
1028	NC_020888	TGC	2	6	58522	58527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473827460
1029	NC_020888	ACC	2	6	58547	58552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473827460
1030	NC_020888	CGTA	2	8	58648	58655	25 %	25 %	25 %	25 %	473827460
1031	NC_020888	TCT	2	6	58658	58663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	473827460
1032	NC_020888	TTGA	2	8	58673	58680	25 %	50 %	25 %	0 %	473827460
1033	NC_020888	TAA	2	6	58727	58732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	473827460
1034	NC_020888	TGG	2	6	58769	58774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473827460
1035	NC_020888	TG	3	6	58981	58986	0 %	50 %	50 %	0 %	473827460
1036	NC_020888	AGAA	2	8	59243	59250	75 %	0 %	25 %	0 %	473827461
1037	NC_020888	CAC	2	6	59365	59370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473827461
1038	NC_020888	CGG	2	6	59375	59380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473827461
1039	NC_020888	CG	3	6	59402	59407	0 %	0 %	50 %	50 %	473827461
1040	NC_020888	TTGG	2	8	59431	59438	0 %	50 %	50 %	0 %	473827461
1041	NC_020888	CAT	2	6	59493	59498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473827461
1042	NC_020888	CAG	2	6	59516	59521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473827461
1043	NC_020888	GAC	2	6	59554	59559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473827461
1044	NC_020888	TTA	2	6	59660	59665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	473827461
1045	NC_020888	TGA	2	6	59772	59777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473827461
1046	NC_020888	GTT	2	6	59799	59804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	473827461
1047	NC_020888	AGA	3	9	59837	59845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	473827461
1048	NC_020888	TGG	2	6	59858	59863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473827461
1049	NC_020888	ACACCA	2	12	59876	59887	50 %	0 %	0 %	50 %	473827461
1050	NC_020888	GGCGC	2	10	59972	59981	0 %	0 %	60 %	40 %	473827461
1051	NC_020888	GAA	2	6	60006	60011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	473827461
1052	NC_020888	CGC	2	6	60078	60083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473827461
1053	NC_020888	TGAT	2	8	60092	60099	25 %	50 %	25 %	0 %	473827461
1054	NC_020888	GAA	2	6	60120	60125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	473827461
1055	NC_020888	ACG	3	9	60179	60187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473827461
1056	NC_020888	TTG	2	6	60215	60220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	473827461
1057	NC_020888	ATC	2	6	60278	60283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473827461
1058	NC_020888	TGAAA	2	10	60297	60306	60 %	20 %	20 %	0 %	473827461
1059	NC_020888	GTG	2	6	60338	60343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473827461
1060	NC_020888	T	6	6	60352	60357	0 %	100 %	0 %	0 %	473827461
1061	NC_020888	CAT	2	6	60378	60383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473827461
1062	NC_020888	GAT	2	6	60415	60420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473827461
1063	NC_020888	GCT	2	6	60421	60426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473827461
1064	NC_020888	T	6	6	60426	60431	0 %	100 %	0 %	0 %	473827461
1065	NC_020888	ATT	2	6	60436	60441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	473827461
1066	NC_020888	CGC	2	6	60495	60500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473827461
1067	NC_020888	TGT	2	6	60518	60523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	473827461
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1069	NC_020888	GAT	2	6	60631	60636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473827461
1070	NC_020888	TATT	2	8	60685	60692	25 %	75 %	0 %	0 %	473827461
1071	NC_020888	GCG	2	6	60723	60728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473827461
1072	NC_020888	GAT	2	6	60768	60773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473827461
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1074	NC_020888	TGA	2	6	60795	60800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473827461
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1080	NC_020888	GAA	3	9	60997	61005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	473827461
1081	NC_020888	AGC	2	6	61089	61094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473827461
1082	NC_020888	GAT	2	6	61135	61140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473827461
1083	NC_020888	AGC	2	6	61184	61189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473827461
1084	NC_020888	GTC	2	6	61441	61446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473827462
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1088	NC_020888	CAA	2	6	61547	61552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	473827462
1089	NC_020888	AC	3	6	61553	61558	50 %	0 %	0 %	50 %	473827462
1090	NC_020888	CAG	2	6	61655	61660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473827462
1091	NC_020888	CTT	2	6	61715	61720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	473827462
1092	NC_020888	TTTGA	2	10	61779	61788	20 %	60 %	20 %	0 %	473827462
1093	NC_020888	ATTG	2	8	61814	61821	25 %	50 %	25 %	0 %	473827462
1094	NC_020888	TGC	2	6	61826	61831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473827462
1095	NC_020888	ATG	2	6	61843	61848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473827462
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1097	NC_020888	CAT	2	6	61868	61873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473827462
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1099	NC_020888	CGT	2	6	62013	62018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473827462
1100	NC_020888	ATA	2	6	62043	62048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	473827462
1101	NC_020888	CGC	3	9	62057	62065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473827462
1102	NC_020888	ATG	2	6	62080	62085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473827462
1103	NC_020888	GCT	2	6	62146	62151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473827462
1104	NC_020888	AACT	2	8	62160	62167	50 %	25 %	0 %	25 %	473827462
1105	NC_020888	GTC	2	6	62176	62181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473827462
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1107	NC_020888	TCG	3	9	62422	62430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473827462
1108	NC_020888	ACC	2	6	62502	62507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473827462
1109	NC_020888	GGTA	2	8	62600	62607	25 %	25 %	50 %	0 %	473827462
1110	NC_020888	TCT	2	6	62617	62622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	473827462
1111	NC_020888	TGT	2	6	62651	62656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	473827462
1112	NC_020888	TGC	2	6	62684	62689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473827462
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1114	NC_020888	TCA	2	6	62740	62745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473827462
1115	NC_020888	A	6	6	62751	62756	100 %	0 %	0 %	0 %	473827462
1116	NC_020888	TCG	2	6	62836	62841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473827462
1117	NC_020888	ACA	2	6	62890	62895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	473827462
1118	NC_020888	TCA	2	6	62896	62901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473827462
1119	NC_020888	GC	3	6	63084	63089	0 %	0 %	50 %	50 %	473827462
1120	NC_020888	TCA	2	6	63109	63114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473827462
1121	NC_020888	CTA	2	6	63115	63120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473827462
1122	NC_020888	GTC	2	6	63132	63137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473827462
1123	NC_020888	TGG	2	6	63230	63235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473827462
1124	NC_020888	CGA	2	6	63329	63334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473827462
1125	NC_020888	TCG	2	6	63427	63432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473827462
1126	NC_020888	CGTTAT	2	12	63545	63556	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	473827462
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1236	NC_020888	ATGT	2	8	70100	70107	25 %	50 %	25 %	0 %	473827470
1237	NC_020888	A	6	6	70163	70168	100 %	0 %	0 %	0 %	473827471
1238	NC_020888	ATC	2	6	70276	70281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473827471
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1243	NC_020888	ATT	2	6	70696	70701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	473827471
1244	NC_020888	TCAG	2	8	70766	70773	25 %	25 %	25 %	25 %	473827471
1245	NC_020888	AAT	2	6	70840	70845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	473827471
1246	NC_020888	GTTT	2	8	70903	70910	0 %	75 %	25 %	0 %	473827471
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1499	NC_020888	TTG	2	6	83197	83202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	473827482
1500	NC_020888	CCG	2	6	83239	83244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473827482

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