MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 78359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_019902	ATG	2	6	2314029	2314034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761548
45002	NC_019902	CTCG	2	8	2314125	2314132	0 %	25 %	25 %	50 %	430761548
45003	NC_019902	ACC	2	6	2314145	2314150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761548
45004	NC_019902	TCC	2	6	2314274	2314279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430761548
45005	NC_019902	CGCC	2	8	2314291	2314298	0 %	0 %	25 %	75 %	430761548
45006	NC_019902	CA	3	6	2314300	2314305	50 %	0 %	0 %	50 %	430761548
45007	NC_019902	GAC	2	6	2314312	2314317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761548
45008	NC_019902	CCGCG	2	10	2315265	2315274	0 %	0 %	40 %	60 %	430761549
45009	NC_019902	CAA	2	6	2315283	2315288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430761549
45010	NC_019902	CCT	3	9	2315374	2315382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430761549
45011	NC_019902	TGCGG	2	10	2319161	2319170	0 %	20 %	60 %	20 %	430761550
45012	NC_019902	TCGG	2	8	2319225	2319232	0 %	25 %	50 %	25 %	430761550
45013	NC_019902	GCC	2	6	2319233	2319238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761550
45014	NC_019902	AGGG	2	8	2319239	2319246	25 %	0 %	75 %	0 %	430761550
45015	NC_019902	GTC	2	6	2319248	2319253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761550
45016	NC_019902	TCG	2	6	2319363	2319368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761550
45017	NC_019902	GCCGAC	2	12	2319398	2319409	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	430761550
45018	NC_019902	CGT	2	6	2319448	2319453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761550
45019	NC_019902	TTC	2	6	2319515	2319520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430761550
45020	NC_019902	CGA	2	6	2319544	2319549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761550
45021	NC_019902	GGC	2	6	2319574	2319579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761550
45022	NC_019902	CG	3	6	2319590	2319595	0 %	0 %	50 %	50 %	430761550
45023	NC_019902	ACG	2	6	2319823	2319828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761550
45024	NC_019902	ATC	2	6	2320017	2320022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761550
45025	NC_019902	TAA	2	6	2320041	2320046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430761550
45026	NC_019902	AGTC	2	8	2320078	2320085	25 %	25 %	25 %	25 %	430761550
45027	NC_019902	CG	4	8	2320104	2320111	0 %	0 %	50 %	50 %	430761550
45028	NC_019902	GTC	2	6	2320160	2320165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761550
45029	NC_019902	TCGAGG	2	12	2320176	2320187	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	430761550
45030	NC_019902	CGT	2	6	2320189	2320194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761550
45031	NC_019902	TTG	2	6	2320200	2320205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430761550
45032	NC_019902	CGA	2	6	2320246	2320251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761550
45033	NC_019902	AG	3	6	2320265	2320270	50 %	0 %	50 %	0 %	430761550
45034	NC_019902	GGC	2	6	2320306	2320311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761550
45035	NC_019902	CTG	2	6	2320325	2320330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761550
45036	NC_019902	TCG	2	6	2320482	2320487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761550
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45038	NC_019902	GTT	2	6	2320510	2320515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430761550
45039	NC_019902	CAT	2	6	2320579	2320584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761550
45040	NC_019902	TCC	2	6	2320596	2320601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430761550
45041	NC_019902	TG	3	6	2320678	2320683	0 %	50 %	50 %	0 %	430761550
45042	NC_019902	GTG	2	6	2320690	2320695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761550
45043	NC_019902	CGC	2	6	2320812	2320817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761550
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45045	NC_019902	GCA	2	6	2321089	2321094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761550
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45048	NC_019902	CGA	2	6	2321323	2321328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761550
45049	NC_019902	TGA	2	6	2321341	2321346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761550
45050	NC_019902	AGC	2	6	2321430	2321435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761550
45051	NC_019902	CTC	2	6	2321459	2321464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430761550
45052	NC_019902	AGT	2	6	2321518	2321523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761550
45053	NC_019902	GGC	2	6	2321539	2321544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761550
45054	NC_019902	GCG	2	6	2321614	2321619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761550
45055	NC_019902	TCGCG	2	10	2321632	2321641	0 %	20 %	40 %	40 %	430761550
45056	NC_019902	GGT	2	6	2321663	2321668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761550
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45060	NC_019902	CGGG	2	8	2321768	2321775	0 %	0 %	75 %	25 %	430761550
45061	NC_019902	AGT	2	6	2321845	2321850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761550
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45064	NC_019902	CAGC	2	8	2321939	2321946	25 %	0 %	25 %	50 %	430761550
45065	NC_019902	TTCG	2	8	2321954	2321961	0 %	50 %	25 %	25 %	430761550
45066	NC_019902	GCT	3	9	2321975	2321983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761550
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45068	NC_019902	GC	3	6	2322024	2322029	0 %	0 %	50 %	50 %	430761550
45069	NC_019902	GTC	2	6	2322059	2322064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761550
45070	NC_019902	GC	3	6	2322070	2322075	0 %	0 %	50 %	50 %	430761550
45071	NC_019902	CGACCG	2	12	2322103	2322114	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	430761550
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45074	NC_019902	CGC	2	6	2322205	2322210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761550
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45095	NC_019902	CGGG	2	8	2323100	2323107	0 %	0 %	75 %	25 %	430761550
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45099	NC_019902	GC	4	8	2323205	2323212	0 %	0 %	50 %	50 %	430761550
45100	NC_019902	GCG	2	6	2323233	2323238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761550
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45115	NC_019902	GGC	2	6	2323780	2323785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761550
45116	NC_019902	TGGTAG	2	12	2323791	2323802	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	430761550
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45215	NC_019902	CG	3	6	2328158	2328163	0 %	0 %	50 %	50 %	430761552
45216	NC_019902	CCCGCG	2	12	2328210	2328221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761552
45217	NC_019902	CG	3	6	2328270	2328275	0 %	0 %	50 %	50 %	430761552
45218	NC_019902	CGTG	2	8	2328428	2328435	0 %	25 %	50 %	25 %	430761553
45219	NC_019902	C	6	6	2328442	2328447	0 %	0 %	0 %	100 %	430761553
45220	NC_019902	ACC	2	6	2328478	2328483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761553
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45222	NC_019902	CTC	2	6	2328550	2328555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430761553
45223	NC_019902	CG	4	8	2328584	2328591	0 %	0 %	50 %	50 %	430761553
45224	NC_019902	AC	3	6	2328594	2328599	50 %	0 %	0 %	50 %	430761553
45225	NC_019902	TCG	2	6	2328741	2328746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761554
45226	NC_019902	GCC	2	6	2328760	2328765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761554
45227	NC_019902	GCA	2	6	2328783	2328788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761554
45228	NC_019902	GCA	2	6	2328863	2328868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761554
45229	NC_019902	CGA	2	6	2328936	2328941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761554
45230	NC_019902	TGGC	2	8	2329116	2329123	0 %	25 %	50 %	25 %	430761554
45231	NC_019902	CGA	2	6	2329134	2329139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761554
45232	NC_019902	CGCC	2	8	2329195	2329202	0 %	0 %	25 %	75 %	430761554
45233	NC_019902	CGA	2	6	2329217	2329222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761554
45234	NC_019902	CCG	2	6	2329255	2329260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761554
45235	NC_019902	CCT	2	6	2329346	2329351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430761554
45236	NC_019902	CGGC	2	8	2329393	2329400	0 %	0 %	50 %	50 %	430761554
45237	NC_019902	CGA	2	6	2329485	2329490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761554
45238	NC_019902	AGG	2	6	2329496	2329501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430761554
45239	NC_019902	GTG	2	6	2329540	2329545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761554
45240	NC_019902	CGC	2	6	2329620	2329625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761554
45241	NC_019902	CTC	2	6	2329629	2329634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430761554
45242	NC_019902	C	6	6	2329640	2329645	0 %	0 %	0 %	100 %	430761554
45243	NC_019902	TGC	2	6	2329712	2329717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761554
45244	NC_019902	GC	3	6	2329725	2329730	0 %	0 %	50 %	50 %	430761554
45245	NC_019902	GATCGA	2	12	2329743	2329754	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	430761554
45246	NC_019902	GCT	2	6	2329881	2329886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761554
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45249	NC_019902	CGA	2	6	2330100	2330105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761554
45250	NC_019902	ACA	2	6	2330129	2330134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430761554
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45252	NC_019902	CGC	2	6	2330195	2330200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761554
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45254	NC_019902	CGA	2	6	2330292	2330297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761554
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45259	NC_019902	TGC	2	6	2330456	2330461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761554
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45265	NC_019902	GC	3	6	2330646	2330651	0 %	0 %	50 %	50 %	430761554
45266	NC_019902	CCG	2	6	2330760	2330765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761554
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45274	NC_019902	CTG	2	6	2331025	2331030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761554
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45290	NC_019902	GCAC	2	8	2331971	2331978	25 %	0 %	25 %	50 %	430761555
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45312	NC_019902	CACC	2	8	2332865	2332872	25 %	0 %	0 %	75 %	430761555
45313	NC_019902	CGA	2	6	2332883	2332888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761555
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45317	NC_019902	GCA	2	6	2332946	2332951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761555
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45332	NC_019902	GTA	2	6	2334604	2334609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761556
45333	NC_019902	CGG	2	6	2334655	2334660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761556
45334	NC_019902	GCG	2	6	2334667	2334672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761556
45335	NC_019902	GCCG	2	8	2334676	2334683	0 %	0 %	50 %	50 %	430761556
45336	NC_019902	GCGG	2	8	2334685	2334692	0 %	0 %	75 %	25 %	430761556
45337	NC_019902	TGA	2	6	2334744	2334749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761556
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45340	NC_019902	GCC	2	6	2335522	2335527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761557
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45342	NC_019902	GCC	2	6	2335809	2335814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761558
45343	NC_019902	CCGG	2	8	2335966	2335973	0 %	0 %	50 %	50 %	430761558
45344	NC_019902	CG	3	6	2335993	2335998	0 %	0 %	50 %	50 %	430761558
45345	NC_019902	GGC	2	6	2336134	2336139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761558
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45464	NC_019902	TGC	2	6	2346405	2346410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761564
45465	NC_019902	TCG	2	6	2346440	2346445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761564
45466	NC_019902	TGC	2	6	2346510	2346515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761564
45467	NC_019902	CGG	2	6	2346641	2346646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761564
45468	NC_019902	GTC	2	6	2346649	2346654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761564
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45471	NC_019902	CAG	5	15	2346772	2346786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761564
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45490	NC_019902	GCG	2	6	2347541	2347546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761565
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45497	NC_019902	CGT	2	6	2347778	2347783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761565
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45499	NC_019902	GTCC	2	8	2347826	2347833	0 %	25 %	25 %	50 %	430761565
45500	NC_019902	CGG	2	6	2347848	2347853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761565

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