MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 78359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_019902	TCGGC	2	10	2257434	2257443	0 %	20 %	40 %	40 %	430761505
44003	NC_019902	ATGCCC	2	12	2257466	2257477	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	430761505
44004	NC_019902	AAC	2	6	2257484	2257489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430761505
44005	NC_019902	GTC	2	6	2257525	2257530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761505
44006	NC_019902	CCAG	2	8	2257569	2257576	25 %	0 %	25 %	50 %	430761505
44007	NC_019902	CCCAG	2	10	2257617	2257626	20 %	0 %	20 %	60 %	430761505
44008	NC_019902	GTC	2	6	2257673	2257678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761505
44009	NC_019902	ATGACC	2	12	2257709	2257720	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	430761505
44010	NC_019902	GAA	2	6	2257756	2257761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430761505
44011	NC_019902	CGG	2	6	2257840	2257845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761506
44012	NC_019902	GCC	2	6	2257898	2257903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761506
44013	NC_019902	ACC	2	6	2257924	2257929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761506
44014	NC_019902	CGGG	2	8	2257992	2257999	0 %	0 %	75 %	25 %	430761506
44015	NC_019902	GGC	2	6	2258090	2258095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761506
44016	NC_019902	CCAG	2	8	2258106	2258113	25 %	0 %	25 %	50 %	430761506
44017	NC_019902	GCG	2	6	2258130	2258135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761506
44018	NC_019902	GC	3	6	2258167	2258172	0 %	0 %	50 %	50 %	430761506
44019	NC_019902	GCC	2	6	2258248	2258253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761506
44020	NC_019902	CGTAC	2	10	2258520	2258529	20 %	20 %	20 %	40 %	430761507
44021	NC_019902	ATG	2	6	2258530	2258535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761507
44022	NC_019902	CAG	2	6	2258562	2258567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761507
44023	NC_019902	AG	3	6	2258638	2258643	50 %	0 %	50 %	0 %	430761507
44024	NC_019902	TGC	2	6	2258685	2258690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761507
44025	NC_019902	TGG	2	6	2258759	2258764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761507
44026	NC_019902	AAG	2	6	2258776	2258781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430761507
44027	NC_019902	GCG	2	6	2258799	2258804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761507
44028	NC_019902	AAC	2	6	2258818	2258823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430761507
44029	NC_019902	CCGT	2	8	2258947	2258954	0 %	25 %	25 %	50 %	430761507
44030	NC_019902	CCA	2	6	2258955	2258960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761507
44031	NC_019902	AGC	2	6	2258962	2258967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761507
44032	NC_019902	GTCAGG	2	12	2258974	2258985	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	430761507
44033	NC_019902	CAC	2	6	2259048	2259053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761507
44034	NC_019902	CAG	2	6	2259081	2259086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761507
44035	NC_019902	C	6	6	2259122	2259127	0 %	0 %	0 %	100 %	430761507
44036	NC_019902	GCA	2	6	2259176	2259181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761507
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44039	NC_019902	ATC	2	6	2259247	2259252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761507
44040	NC_019902	CCGG	2	8	2259741	2259748	0 %	0 %	50 %	50 %	430761508
44041	NC_019902	CCT	2	6	2259751	2259756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430761508
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44043	NC_019902	CAG	2	6	2259791	2259796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761508
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44048	NC_019902	GTC	2	6	2260053	2260058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761508
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44052	NC_019902	CAG	2	6	2260166	2260171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761508
44053	NC_019902	GCA	2	6	2260270	2260275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761508
44054	NC_019902	CGG	2	6	2260447	2260452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761508
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44087	NC_019902	CG	3	6	2262327	2262332	0 %	0 %	50 %	50 %	430761509
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44106	NC_019902	CAG	3	9	2263060	2263068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761509
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44116	NC_019902	GAA	2	6	2263640	2263645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430761510
44117	NC_019902	AGC	2	6	2263662	2263667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761510
44118	NC_019902	GCC	2	6	2263670	2263675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761510
44119	NC_019902	CGC	3	9	2263745	2263753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761510
44120	NC_019902	CTG	2	6	2263779	2263784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761510
44121	NC_019902	CAA	3	9	2263837	2263845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430761510
44122	NC_019902	ACA	2	6	2263855	2263860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430761510
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44149	NC_019902	CT	3	6	2265837	2265842	0 %	50 %	0 %	50 %	430761513
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44152	NC_019902	GGT	2	6	2265925	2265930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761513
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44155	NC_019902	CGACTT	2	12	2266023	2266034	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	430761513
44156	NC_019902	CCGC	2	8	2266037	2266044	0 %	0 %	25 %	75 %	430761513
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44215	NC_019902	AC	3	6	2268531	2268536	50 %	0 %	0 %	50 %	430761515
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44229	NC_019902	CGC	2	6	2270394	2270399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761517
44230	NC_019902	CTG	2	6	2270443	2270448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761517
44231	NC_019902	GAG	2	6	2270455	2270460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430761517
44232	NC_019902	GGT	2	6	2270586	2270591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761517
44233	NC_019902	CGG	2	6	2270619	2270624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761517
44234	NC_019902	TGC	2	6	2270648	2270653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761517
44235	NC_019902	CG	3	6	2270697	2270702	0 %	0 %	50 %	50 %	430761517
44236	NC_019902	GGC	2	6	2270748	2270753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761517
44237	NC_019902	CGG	2	6	2270811	2270816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761517
44238	NC_019902	CGG	2	6	2270835	2270840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761517
44239	NC_019902	GCTCG	2	10	2270922	2270931	0 %	20 %	40 %	40 %	430761517
44240	NC_019902	GCG	2	6	2270932	2270937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761517
44241	NC_019902	ATC	2	6	2270998	2271003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761517
44242	NC_019902	CTG	2	6	2271022	2271027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761517
44243	NC_019902	CGA	2	6	2271066	2271071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761517
44244	NC_019902	GGCC	2	8	2271081	2271088	0 %	0 %	50 %	50 %	430761517
44245	NC_019902	CGGT	2	8	2271092	2271099	0 %	25 %	50 %	25 %	430761517
44246	NC_019902	CAT	2	6	2271102	2271107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761517
44247	NC_019902	CGG	2	6	2271110	2271115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761517
44248	NC_019902	CAT	2	6	2271117	2271122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761517
44249	NC_019902	GAT	2	6	2271138	2271143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761517
44250	NC_019902	CGA	2	6	2271252	2271257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761517
44251	NC_019902	GGC	3	9	2271282	2271290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761517
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44253	NC_019902	CGA	2	6	2271318	2271323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761517
44254	NC_019902	GC	5	10	2271330	2271339	0 %	0 %	50 %	50 %	430761517
44255	NC_019902	CCG	2	6	2271368	2271373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761517
44256	NC_019902	GCC	2	6	2271377	2271382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761517
44257	NC_019902	ACT	3	9	2271392	2271400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761517
44258	NC_019902	GCG	2	6	2271454	2271459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761517
44259	NC_019902	CGG	2	6	2271464	2271469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761517
44260	NC_019902	CCGGC	2	10	2271546	2271555	0 %	0 %	40 %	60 %	430761517
44261	NC_019902	CGG	2	6	2271612	2271617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761517
44262	NC_019902	ATCA	2	8	2271655	2271662	50 %	25 %	0 %	25 %	430761517
44263	NC_019902	CGA	2	6	2271684	2271689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761517
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44265	NC_019902	CA	3	6	2271982	2271987	50 %	0 %	0 %	50 %	430761518
44266	NC_019902	CCGA	2	8	2271993	2272000	25 %	0 %	25 %	50 %	430761518
44267	NC_019902	GGCA	2	8	2272127	2272134	25 %	0 %	50 %	25 %	430761518
44268	NC_019902	GTGC	2	8	2272200	2272207	0 %	25 %	50 %	25 %	430761518
44269	NC_019902	ACGC	2	8	2272232	2272239	25 %	0 %	25 %	50 %	430761518
44270	NC_019902	GCC	3	9	2272242	2272250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761518
44271	NC_019902	ACC	2	6	2272271	2272276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761518
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44273	NC_019902	CGC	2	6	2272335	2272340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761518
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44275	NC_019902	CGG	2	6	2272415	2272420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761518
44276	NC_019902	TGA	2	6	2272426	2272431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761518
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44278	NC_019902	TGC	2	6	2272516	2272521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761518
44279	NC_019902	CAGCCT	2	12	2272541	2272552	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	430761518
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44283	NC_019902	CGG	2	6	2272700	2272705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761518
44284	NC_019902	TTC	2	6	2272758	2272763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430761518
44285	NC_019902	GGC	2	6	2272789	2272794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761518
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44287	NC_019902	AC	3	6	2272810	2272815	50 %	0 %	0 %	50 %	430761518
44288	NC_019902	CGC	2	6	2272816	2272821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761518
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44290	NC_019902	GCTG	2	8	2272867	2272874	0 %	25 %	50 %	25 %	430761518
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44292	NC_019902	CGC	2	6	2272907	2272912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761518
44293	NC_019902	CGGG	2	8	2272917	2272924	0 %	0 %	75 %	25 %	430761518
44294	NC_019902	CTG	2	6	2272937	2272942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761518
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44300	NC_019902	CGA	2	6	2273197	2273202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761519
44301	NC_019902	TGA	2	6	2273232	2273237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761519
44302	NC_019902	CCG	2	6	2273277	2273282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761519
44303	NC_019902	ACC	2	6	2273330	2273335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761519
44304	NC_019902	GCT	2	6	2273362	2273367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761519
44305	NC_019902	CG	3	6	2273403	2273408	0 %	0 %	50 %	50 %	430761519
44306	NC_019902	CG	3	6	2273420	2273425	0 %	0 %	50 %	50 %	430761519
44307	NC_019902	CTG	2	6	2273435	2273440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761519
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44313	NC_019902	TGC	3	9	2273595	2273603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761519
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44316	NC_019902	GCT	2	6	2273706	2273711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761519
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44318	NC_019902	CGA	2	6	2273875	2273880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761519
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44322	NC_019902	CGG	2	6	2274034	2274039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761519
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44328	NC_019902	GCGAC	2	10	2274746	2274755	20 %	0 %	40 %	40 %	430761520
44329	NC_019902	TGC	2	6	2274757	2274762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761520
44330	NC_019902	CT	3	6	2274813	2274818	0 %	50 %	0 %	50 %	430761520
44331	NC_019902	GAG	2	6	2274837	2274842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430761520
44332	NC_019902	CCG	2	6	2274865	2274870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761520
44333	NC_019902	GGCCG	2	10	2274917	2274926	0 %	0 %	60 %	40 %	430761520
44334	NC_019902	ACG	2	6	2274997	2275002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761520
44335	NC_019902	CGA	3	9	2275028	2275036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761520
44336	NC_019902	CG	4	8	2275094	2275101	0 %	0 %	50 %	50 %	430761520
44337	NC_019902	CTG	2	6	2275104	2275109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761520
44338	NC_019902	CAC	2	6	2275140	2275145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761520
44339	NC_019902	CGA	2	6	2275166	2275171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761520
44340	NC_019902	ACG	3	9	2275198	2275206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761520
44341	NC_019902	TGC	2	6	2275273	2275278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761520
44342	NC_019902	AAC	2	6	2275281	2275286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430761520
44343	NC_019902	CACC	2	8	2275319	2275326	25 %	0 %	0 %	75 %	430761520
44344	NC_019902	GCC	2	6	2275374	2275379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761520
44345	NC_019902	CAC	2	6	2275382	2275387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761520
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44347	NC_019902	TGA	2	6	2275465	2275470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761520
44348	NC_019902	CGA	2	6	2275502	2275507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761520
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44352	NC_019902	TGA	2	6	2275615	2275620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761520
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44454	NC_019902	TCCG	2	8	2280593	2280600	0 %	25 %	25 %	50 %	430761524
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44461	NC_019902	GCT	2	6	2280768	2280773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761524
44462	NC_019902	CCAG	2	8	2281111	2281118	25 %	0 %	25 %	50 %	430761525
44463	NC_019902	CGA	2	6	2281150	2281155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761525
44464	NC_019902	GCA	2	6	2281201	2281206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761525
44465	NC_019902	GTTC	2	8	2281207	2281214	0 %	50 %	25 %	25 %	430761525
44466	NC_019902	CCT	2	6	2281261	2281266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430761525
44467	NC_019902	CAG	2	6	2281286	2281291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761525
44468	NC_019902	C	6	6	2281292	2281297	0 %	0 %	0 %	100 %	430761525
44469	NC_019902	GCTCCG	2	12	2281372	2281383	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	430761525
44470	NC_019902	CCGA	2	8	2281445	2281452	25 %	0 %	25 %	50 %	430761525
44471	NC_019902	GGC	2	6	2281484	2281489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761525
44472	NC_019902	GCC	2	6	2281526	2281531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761525
44473	NC_019902	GCG	2	6	2281611	2281616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761525
44474	NC_019902	GC	3	6	2281637	2281642	0 %	0 %	50 %	50 %	430761525
44475	NC_019902	GTC	2	6	2281661	2281666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761525
44476	NC_019902	CACCGC	2	12	2281817	2281828	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	430761526
44477	NC_019902	CGGT	2	8	2281902	2281909	0 %	25 %	50 %	25 %	430761526
44478	NC_019902	CCAG	2	8	2281918	2281925	25 %	0 %	25 %	50 %	430761526
44479	NC_019902	CGC	2	6	2281956	2281961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761526
44480	NC_019902	GCG	2	6	2281980	2281985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761526
44481	NC_019902	ACC	2	6	2282007	2282012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761526
44482	NC_019902	CGC	2	6	2282032	2282037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761526
44483	NC_019902	CGGG	2	8	2282049	2282056	0 %	0 %	75 %	25 %	430761526
44484	NC_019902	GAC	2	6	2282063	2282068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761526
44485	NC_019902	G	6	6	2282140	2282145	0 %	0 %	100 %	0 %	430761526
44486	NC_019902	GGC	2	6	2282155	2282160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761526
44487	NC_019902	ATG	2	6	2282315	2282320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761526
44488	NC_019902	CGCGC	2	10	2282329	2282338	0 %	0 %	40 %	60 %	430761526
44489	NC_019902	GAG	2	6	2282622	2282627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430761527
44490	NC_019902	CCG	2	6	2282628	2282633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761527
44491	NC_019902	CGT	2	6	2282653	2282658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761527
44492	NC_019902	CCT	2	6	2282677	2282682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430761527
44493	NC_019902	CG	3	6	2282713	2282718	0 %	0 %	50 %	50 %	430761527
44494	NC_019902	GCT	2	6	2282731	2282736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761527
44495	NC_019902	CG	4	8	2282770	2282777	0 %	0 %	50 %	50 %	430761527
44496	NC_019902	TGA	2	6	2282833	2282838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761527
44497	NC_019902	TTC	3	9	2282904	2282912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430761527
44498	NC_019902	CAG	2	6	2282942	2282947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761527
44499	NC_019902	CG	4	8	2282986	2282993	0 %	0 %	50 %	50 %	430761527
44500	NC_019902	ACCAG	2	10	2283022	2283031	40 %	0 %	20 %	40 %	430761527

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