MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 78359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_019902	GC	4	8	2209839	2209846	0 %	0 %	50 %	50 %	430761458
43002	NC_019902	CGA	2	6	2209872	2209877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761458
43003	NC_019902	CGC	2	6	2209884	2209889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761458
43004	NC_019902	GCC	2	6	2209891	2209896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761458
43005	NC_019902	GAT	2	6	2209929	2209934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761458
43006	NC_019902	GAT	2	6	2209976	2209981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761458
43007	NC_019902	TGA	2	6	2210009	2210014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761459
43008	NC_019902	CTG	2	6	2210020	2210025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761459
43009	NC_019902	ATC	2	6	2210026	2210031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761459
43010	NC_019902	TGG	2	6	2210050	2210055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761459
43011	NC_019902	CAG	2	6	2210061	2210066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761459
43012	NC_019902	GAA	2	6	2210086	2210091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430761459
43013	NC_019902	GCC	2	6	2210092	2210097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761459
43014	NC_019902	ACC	2	6	2210123	2210128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761459
43015	NC_019902	TGG	2	6	2210196	2210201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761460
43016	NC_019902	ACA	2	6	2210329	2210334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430761460
43017	NC_019902	TGG	2	6	2210349	2210354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761460
43018	NC_019902	GCT	2	6	2210432	2210437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761460
43019	NC_019902	CGC	2	6	2210528	2210533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761460
43020	NC_019902	GAC	2	6	2210582	2210587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761460
43021	NC_019902	CGG	2	6	2210592	2210597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761460
43022	NC_019902	ACT	2	6	2210608	2210613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761460
43023	NC_019902	GC	3	6	2210637	2210642	0 %	0 %	50 %	50 %	430761460
43024	NC_019902	GGC	2	6	2210688	2210693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761460
43025	NC_019902	AAG	2	6	2210709	2210714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430761460
43026	NC_019902	CGC	2	6	2210757	2210762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761460
43027	NC_019902	ACA	2	6	2210890	2210895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430761460
43028	NC_019902	CGG	2	6	2210981	2210986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761460
43029	NC_019902	GGA	2	6	2210993	2210998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430761460
43030	NC_019902	CGC	2	6	2211014	2211019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761460
43031	NC_019902	CTG	2	6	2211054	2211059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761460
43032	NC_019902	AC	3	6	2211238	2211243	50 %	0 %	0 %	50 %	430761461
43033	NC_019902	AGA	2	6	2211310	2211315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430761461
43034	NC_019902	GCT	2	6	2211365	2211370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761461
43035	NC_019902	TGC	2	6	2211373	2211378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761461
43036	NC_019902	CTA	2	6	2211386	2211391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761461
43037	NC_019902	CGGC	2	8	2211416	2211423	0 %	0 %	50 %	50 %	430761461
43038	NC_019902	CTG	2	6	2211510	2211515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761461
43039	NC_019902	CGCTG	2	10	2211521	2211530	0 %	20 %	40 %	40 %	430761461
43040	NC_019902	GTT	2	6	2211533	2211538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430761461
43041	NC_019902	CTT	2	6	2211539	2211544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430761461
43042	NC_019902	TCG	2	6	2211754	2211759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761461
43043	NC_019902	TTC	2	6	2211795	2211800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430761461
43044	NC_019902	ATC	2	6	2211951	2211956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761461
43045	NC_019902	ACG	2	6	2211961	2211966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761461
43046	NC_019902	AAG	2	6	2211996	2212001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430761461
43047	NC_019902	GCT	2	6	2212114	2212119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761461
43048	NC_019902	ACC	2	6	2212188	2212193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761461
43049	NC_019902	GGCA	2	8	2212205	2212212	25 %	0 %	50 %	25 %	430761461
43050	NC_019902	CG	3	6	2212234	2212239	0 %	0 %	50 %	50 %	430761461
43051	NC_019902	TGC	3	9	2212255	2212263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761461
43052	NC_019902	TGC	2	6	2212267	2212272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761461
43053	NC_019902	CGGT	2	8	2212309	2212316	0 %	25 %	50 %	25 %	430761461
43054	NC_019902	GCA	2	6	2212405	2212410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761461
43055	NC_019902	GAA	2	6	2212470	2212475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430761461
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43057	NC_019902	GTC	2	6	2212587	2212592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761461
43058	NC_019902	CTG	2	6	2212752	2212757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761462
43059	NC_019902	GGC	2	6	2212758	2212763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761462
43060	NC_019902	CTG	2	6	2212764	2212769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761462
43061	NC_019902	CGGA	2	8	2212792	2212799	25 %	0 %	50 %	25 %	430761462
43062	NC_019902	GTC	2	6	2212803	2212808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761462
43063	NC_019902	AGGA	2	8	2212822	2212829	50 %	0 %	50 %	0 %	430761462
43064	NC_019902	CG	3	6	2212865	2212870	0 %	0 %	50 %	50 %	430761462
43065	NC_019902	ACCCG	2	10	2212978	2212987	20 %	0 %	20 %	60 %	430761462
43066	NC_019902	TGC	2	6	2213155	2213160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761462
43067	NC_019902	GA	4	8	2213173	2213180	50 %	0 %	50 %	0 %	430761462
43068	NC_019902	CCG	2	6	2213328	2213333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761463
43069	NC_019902	CCT	2	6	2213360	2213365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430761463
43070	NC_019902	CGA	2	6	2213397	2213402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761463
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43073	NC_019902	CGCTGT	2	12	2213450	2213461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761463
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43082	NC_019902	CG	3	6	2213747	2213752	0 %	0 %	50 %	50 %	430761463
43083	NC_019902	TGC	2	6	2213777	2213782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761463
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43085	NC_019902	GACA	2	8	2213870	2213877	50 %	0 %	25 %	25 %	430761463
43086	NC_019902	TGC	2	6	2213885	2213890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761463
43087	NC_019902	GGC	2	6	2213892	2213897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761463
43088	NC_019902	GGACC	2	10	2214001	2214010	20 %	0 %	40 %	40 %	430761463
43089	NC_019902	CCCTGC	2	12	2214084	2214095	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	430761463
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43092	NC_019902	TGG	2	6	2214266	2214271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761463
43093	NC_019902	CG	3	6	2214343	2214348	0 %	0 %	50 %	50 %	430761463
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43097	NC_019902	ACT	2	6	2214497	2214502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761463
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43099	NC_019902	ACG	2	6	2214539	2214544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761463
43100	NC_019902	GCC	2	6	2214590	2214595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761463
43101	NC_019902	TGA	2	6	2214596	2214601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761463
43102	NC_019902	CGC	2	6	2214853	2214858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761464
43103	NC_019902	ACGG	2	8	2214922	2214929	25 %	0 %	50 %	25 %	430761464
43104	NC_019902	TCG	2	6	2214955	2214960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761464
43105	NC_019902	CCCGCA	2	12	2215004	2215015	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	430761464
43106	NC_019902	GCCG	2	8	2215019	2215026	0 %	0 %	50 %	50 %	430761464
43107	NC_019902	AGC	2	6	2215054	2215059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761464
43108	NC_019902	CAG	2	6	2215095	2215100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761464
43109	NC_019902	GAT	2	6	2215179	2215184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761464
43110	NC_019902	GC	3	6	2215219	2215224	0 %	0 %	50 %	50 %	430761464
43111	NC_019902	CGA	2	6	2215235	2215240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761464
43112	NC_019902	CCCG	2	8	2215247	2215254	0 %	0 %	25 %	75 %	430761464
43113	NC_019902	GCT	2	6	2215338	2215343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761464
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43115	NC_019902	GC	3	6	2215412	2215417	0 %	0 %	50 %	50 %	430761464
43116	NC_019902	AGC	2	6	2215441	2215446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761464
43117	NC_019902	AGC	2	6	2215474	2215479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761464
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43215	NC_019902	CGA	2	6	2220728	2220733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761468
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43217	NC_019902	ACG	2	6	2220795	2220800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761468
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43220	NC_019902	ACCG	2	8	2220875	2220882	25 %	0 %	25 %	50 %	430761468
43221	NC_019902	TGA	2	6	2220886	2220891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761468
43222	NC_019902	CCG	2	6	2220947	2220952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761468
43223	NC_019902	CG	3	6	2220966	2220971	0 %	0 %	50 %	50 %	430761468
43224	NC_019902	CGA	2	6	2220989	2220994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761468
43225	NC_019902	CCT	2	6	2221027	2221032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430761468
43226	NC_019902	CGG	2	6	2221230	2221235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761469
43227	NC_019902	TCG	2	6	2221255	2221260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761469
43228	NC_019902	ATCGGC	2	12	2221272	2221283	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430761469
43229	NC_019902	GGC	2	6	2221350	2221355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761469
43230	NC_019902	CGC	2	6	2221419	2221424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761469
43231	NC_019902	CGGG	2	8	2221441	2221448	0 %	0 %	75 %	25 %	430761470
43232	NC_019902	CG	3	6	2221527	2221532	0 %	0 %	50 %	50 %	430761470
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43331	NC_019902	CAA	2	6	2225475	2225480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430761472
43332	NC_019902	CCA	2	6	2225486	2225491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761472
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43340	NC_019902	C	6	6	2226237	2226242	0 %	0 %	0 %	100 %	430761473
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43343	NC_019902	GCT	2	6	2226479	2226484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761473
43344	NC_019902	GCA	2	6	2226485	2226490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761473
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43460	NC_019902	ATC	2	6	2232394	2232399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761481
43461	NC_019902	ATCG	2	8	2232418	2232425	25 %	25 %	25 %	25 %	430761481
43462	NC_019902	CGC	2	6	2232438	2232443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761481
43463	NC_019902	CG	3	6	2232480	2232485	0 %	0 %	50 %	50 %	430761481
43464	NC_019902	CGC	2	6	2232490	2232495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761481
43465	NC_019902	AG	3	6	2232556	2232561	50 %	0 %	50 %	0 %	430761481
43466	NC_019902	CGGC	2	8	2232572	2232579	0 %	0 %	50 %	50 %	430761481
43467	NC_019902	GTT	2	6	2232625	2232630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430761481
43468	NC_019902	GGTT	2	8	2232633	2232640	0 %	50 %	50 %	0 %	430761481
43469	NC_019902	CGA	2	6	2232645	2232650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761481
43470	NC_019902	GCC	2	6	2232677	2232682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761481
43471	NC_019902	GCG	2	6	2232721	2232726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761481
43472	NC_019902	CTCG	2	8	2232778	2232785	0 %	25 %	25 %	50 %	430761481
43473	NC_019902	GGA	2	6	2232827	2232832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430761481
43474	NC_019902	TCG	2	6	2232854	2232859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761481
43475	NC_019902	CG	3	6	2232858	2232863	0 %	0 %	50 %	50 %	430761481
43476	NC_019902	CG	3	6	2232891	2232896	0 %	0 %	50 %	50 %	430761481
43477	NC_019902	CCA	2	6	2232918	2232923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761481
43478	NC_019902	GCC	2	6	2232943	2232948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761481
43479	NC_019902	C	6	6	2232967	2232972	0 %	0 %	0 %	100 %	430761481
43480	NC_019902	AGCG	2	8	2232973	2232980	25 %	0 %	50 %	25 %	430761481
43481	NC_019902	AGC	2	6	2232992	2232997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761481
43482	NC_019902	TCA	3	9	2233023	2233031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761481
43483	NC_019902	GCT	2	6	2233092	2233097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761482
43484	NC_019902	CCG	2	6	2233246	2233251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761482
43485	NC_019902	CAC	2	6	2233253	2233258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761482
43486	NC_019902	TCG	2	6	2233290	2233295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761482
43487	NC_019902	CAG	2	6	2233325	2233330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761482
43488	NC_019902	CCA	2	6	2233366	2233371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761482
43489	NC_019902	GTG	2	6	2233391	2233396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761482
43490	NC_019902	AGT	2	6	2233405	2233410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761482
43491	NC_019902	CGA	2	6	2233499	2233504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761482
43492	NC_019902	CTC	2	6	2233568	2233573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430761482
43493	NC_019902	GAA	2	6	2233610	2233615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430761482
43494	NC_019902	GGA	2	6	2233626	2233631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430761482
43495	NC_019902	GAT	2	6	2233709	2233714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761482
43496	NC_019902	TCC	2	6	2233779	2233784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430761482
43497	NC_019902	TCGG	2	8	2233828	2233835	0 %	25 %	50 %	25 %	430761482
43498	NC_019902	GC	3	6	2233850	2233855	0 %	0 %	50 %	50 %	430761482
43499	NC_019902	AGATC	2	10	2233870	2233879	40 %	20 %	20 %	20 %	430761482
43500	NC_019902	GCT	2	6	2233888	2233893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761482

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