MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 78359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25114	NC_019902	GGT	2	6	1318856	1318861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430760651
25115	NC_019902	AGC	2	6	1318884	1318889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760651
25116	NC_019902	CTGGC	2	10	1318898	1318907	0 %	20 %	40 %	40 %	430760651
25117	NC_019902	AGC	2	6	1318908	1318913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760651
25118	NC_019902	GCA	2	6	1318975	1318980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760651
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25120	NC_019902	TGC	2	6	1319066	1319071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760652
25121	NC_019902	GC	3	6	1319086	1319091	0 %	0 %	50 %	50 %	430760652
25122	NC_019902	CAG	2	6	1319110	1319115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760652
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25125	NC_019902	GCA	2	6	1319178	1319183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760652
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25127	NC_019902	GGT	2	6	1319224	1319229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430760652
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25138	NC_019902	GCA	3	9	1319721	1319729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760652
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25199	NC_019902	TCGA	2	8	1322532	1322539	25 %	25 %	25 %	25 %	430760654
25200	NC_019902	GC	4	8	1322588	1322595	0 %	0 %	50 %	50 %	430760654
25201	NC_019902	GAT	2	6	1322777	1322782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430760655
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25206	NC_019902	AGT	2	6	1322977	1322982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430760655
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25216	NC_019902	CG	3	6	1326111	1326116	0 %	0 %	50 %	50 %	430760657
25217	NC_019902	GCT	2	6	1326128	1326133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760657
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25222	NC_019902	TGT	2	6	1326352	1326357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430760657
25223	NC_019902	CGT	2	6	1326461	1326466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760657
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25225	NC_019902	CGC	2	6	1326518	1326523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760657
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25228	NC_019902	GTC	2	6	1326567	1326572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760657
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25230	NC_019902	GGT	2	6	1326635	1326640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430760657
25231	NC_019902	GCA	2	6	1326704	1326709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760657
25232	NC_019902	CGGCG	2	10	1326718	1326727	0 %	0 %	60 %	40 %	430760657
25233	NC_019902	GTC	2	6	1326741	1326746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760657
25234	NC_019902	GTC	2	6	1326882	1326887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760657
25235	NC_019902	TCG	2	6	1326907	1326912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760657
25236	NC_019902	TGC	2	6	1326979	1326984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760657
25237	NC_019902	AGC	2	6	1327012	1327017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760657
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25239	NC_019902	ATCGC	2	10	1327081	1327090	20 %	20 %	20 %	40 %	430760657
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25242	NC_019902	CGG	2	6	1327159	1327164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760657
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25244	NC_019902	GC	3	6	1327258	1327263	0 %	0 %	50 %	50 %	430760657
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25259	NC_019902	CG	4	8	1328022	1328029	0 %	0 %	50 %	50 %	430760658
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25338	NC_019902	GAAGTC	2	12	1332324	1332335	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	430760662
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25340	NC_019902	GCCGTA	2	12	1332420	1332431	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430760662
25341	NC_019902	GCC	2	6	1332438	1332443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760662
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25343	NC_019902	GCC	2	6	1332496	1332501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760662
25344	NC_019902	CCG	2	6	1332892	1332897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760663
25345	NC_019902	TCC	2	6	1332918	1332923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430760663
25346	NC_019902	GGCC	2	8	1332998	1333005	0 %	0 %	50 %	50 %	430760664
25347	NC_019902	AGA	2	6	1333256	1333261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430760664
25348	NC_019902	GCCG	2	8	1333268	1333275	0 %	0 %	50 %	50 %	430760664
25349	NC_019902	GCC	2	6	1333282	1333287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760664
25350	NC_019902	GC	3	6	1333300	1333305	0 %	0 %	50 %	50 %	430760664
25351	NC_019902	CCG	2	6	1333343	1333348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760664
25352	NC_019902	GAT	2	6	1333382	1333387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430760664
25353	NC_019902	CGG	2	6	1333400	1333405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760664
25354	NC_019902	CCA	2	6	1333427	1333432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430760664
25355	NC_019902	TCG	2	6	1333465	1333470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760664
25356	NC_019902	GCA	2	6	1333511	1333516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760664
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25358	NC_019902	CTCGAT	2	12	1333578	1333589	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	430760665
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25361	NC_019902	TGT	2	6	1333723	1333728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430760665
25362	NC_019902	GGT	2	6	1333770	1333775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430760665
25363	NC_019902	CGG	2	6	1333798	1333803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760665
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25365	NC_019902	CAG	2	6	1333884	1333889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760665
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25371	NC_019902	GCCG	2	8	1334099	1334106	0 %	0 %	50 %	50 %	430760665
25372	NC_019902	TCC	2	6	1334137	1334142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430760665
25373	NC_019902	CG	3	6	1334169	1334174	0 %	0 %	50 %	50 %	430760665
25374	NC_019902	CCG	2	6	1334204	1334209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760665
25375	NC_019902	GGC	2	6	1334210	1334215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760665
25376	NC_019902	CGA	2	6	1334219	1334224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760665
25377	NC_019902	GAT	2	6	1334253	1334258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430760665
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25381	NC_019902	GCG	2	6	1334399	1334404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760665
25382	NC_019902	GCC	2	6	1334508	1334513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760665
25383	NC_019902	GC	3	6	1334568	1334573	0 %	0 %	50 %	50 %	430760665
25384	NC_019902	GCG	2	6	1334662	1334667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760665
25385	NC_019902	GCC	2	6	1334697	1334702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760665
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25400	NC_019902	GGCGAC	2	12	1335450	1335461	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430760666
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25402	NC_019902	GGT	2	6	1335569	1335574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430760666
25403	NC_019902	CAG	3	9	1335636	1335644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760666
25404	NC_019902	CAG	2	6	1335661	1335666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760666
25405	NC_019902	CA	3	6	1335677	1335682	50 %	0 %	0 %	50 %	430760666
25406	NC_019902	GCG	2	6	1335695	1335700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760666
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25411	NC_019902	GC	3	6	1336264	1336269	0 %	0 %	50 %	50 %	430760666
25412	NC_019902	GCC	4	12	1336341	1336352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760666
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25414	NC_019902	ATC	2	6	1336465	1336470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430760666
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25416	NC_019902	CGA	2	6	1336526	1336531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760666
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25423	NC_019902	G	6	6	1337068	1337073	0 %	0 %	100 %	0 %	430760667
25424	NC_019902	GCA	2	6	1337162	1337167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760667
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25429	NC_019902	TCG	2	6	1337317	1337322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760667
25430	NC_019902	GAG	2	6	1337418	1337423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430760667
25431	NC_019902	ACC	2	6	1337565	1337570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430760668
25432	NC_019902	GCG	2	6	1337588	1337593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760668
25433	NC_019902	ACG	2	6	1337599	1337604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760668
25434	NC_019902	ATCG	2	8	1337624	1337631	25 %	25 %	25 %	25 %	430760668
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25441	NC_019902	GCG	2	6	1338066	1338071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760669
25442	NC_019902	GCTGGT	2	12	1338104	1338115	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	430760669
25443	NC_019902	CGA	2	6	1338119	1338124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760669
25444	NC_019902	CGC	2	6	1338134	1338139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760669
25445	NC_019902	GGA	2	6	1338212	1338217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430760669
25446	NC_019902	CGG	2	6	1338223	1338228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760669
25447	NC_019902	CAA	2	6	1338239	1338244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430760669
25448	NC_019902	CTC	2	6	1338251	1338256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430760669
25449	NC_019902	CCGC	2	8	1338340	1338347	0 %	0 %	25 %	75 %	430760669
25450	NC_019902	ATGTCG	2	12	1338445	1338456	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	430760669
25451	NC_019902	ACA	2	6	1338514	1338519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430760669
25452	NC_019902	ACG	2	6	1338520	1338525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760669
25453	NC_019902	CTG	2	6	1338540	1338545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760669
25454	NC_019902	GGC	2	6	1338590	1338595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760669
25455	NC_019902	TCG	2	6	1338612	1338617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760669
25456	NC_019902	TCG	2	6	1338634	1338639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760669
25457	NC_019902	GTG	2	6	1338672	1338677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430760669
25458	NC_019902	TCG	2	6	1338691	1338696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760669
25459	NC_019902	GAT	2	6	1338734	1338739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430760669
25460	NC_019902	GCT	2	6	1338863	1338868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760669
25461	NC_019902	TCA	2	6	1338886	1338891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430760669
25462	NC_019902	CGG	2	6	1338899	1338904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760669
25463	NC_019902	CGCA	2	8	1338941	1338948	25 %	0 %	25 %	50 %	430760669
25464	NC_019902	AGG	2	6	1338949	1338954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430760669
25465	NC_019902	CTG	2	6	1338999	1339004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760669
25466	NC_019902	AGG	2	6	1339009	1339014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430760669
25467	NC_019902	CGG	2	6	1339202	1339207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760670
25468	NC_019902	GGC	2	6	1339216	1339221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760670
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25470	NC_019902	CGA	3	9	1339260	1339268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760670
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25472	NC_019902	CGG	2	6	1339324	1339329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760670
25473	NC_019902	CCG	2	6	1339386	1339391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760670
25474	NC_019902	GCC	2	6	1339416	1339421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760670
25475	NC_019902	TGG	2	6	1339428	1339433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430760670
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25478	NC_019902	ATC	2	6	1339544	1339549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430760670
25479	NC_019902	CCAC	2	8	1339551	1339558	25 %	0 %	0 %	75 %	430760670
25480	NC_019902	GCT	2	6	1339585	1339590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760670
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25483	NC_019902	GC	3	6	1339651	1339656	0 %	0 %	50 %	50 %	430760670
25484	NC_019902	CAT	2	6	1339771	1339776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430760670
25485	NC_019902	CGT	2	6	1339816	1339821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760670
25486	NC_019902	GCA	2	6	1339853	1339858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760670
25487	NC_019902	CGG	3	9	1339936	1339944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760670
25488	NC_019902	GCG	2	6	1339958	1339963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760670
25489	NC_019902	GGTGCG	2	12	1340148	1340159	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	430760671
25490	NC_019902	CGA	2	6	1340244	1340249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760671
25491	NC_019902	CG	4	8	1340250	1340257	0 %	0 %	50 %	50 %	430760671
25492	NC_019902	TGC	2	6	1340258	1340263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760671
25493	NC_019902	CGA	2	6	1340265	1340270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760671
25494	NC_019902	ATC	2	6	1340284	1340289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430760671
25495	NC_019902	ACC	2	6	1340321	1340326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430760671
25496	NC_019902	CGA	2	6	1340337	1340342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760671
25497	NC_019902	TCG	2	6	1340369	1340374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760671
25498	NC_019902	CG	3	6	1340409	1340414	0 %	0 %	50 %	50 %	430760671
25499	NC_019902	GGCT	2	8	1340419	1340426	0 %	25 %	50 %	25 %	430760671
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