MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 78359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_019902	GAAA	2	8	651348	651355	75 %	0 %	25 %	0 %	430760021
12503	NC_019902	ACG	2	6	651361	651366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760021
12504	NC_019902	GGC	2	6	651430	651435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760021
12505	NC_019902	CGA	2	6	651665	651670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760022
12506	NC_019902	GGT	2	6	651671	651676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430760022
12507	NC_019902	CGT	2	6	651695	651700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760022
12508	NC_019902	GGC	2	6	651791	651796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760022
12509	NC_019902	CG	3	6	651875	651880	0 %	0 %	50 %	50 %	430760022
12510	NC_019902	GCAC	2	8	651910	651917	25 %	0 %	25 %	50 %	430760022
12511	NC_019902	CGG	2	6	651923	651928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760022
12512	NC_019902	G	6	6	651936	651941	0 %	0 %	100 %	0 %	430760022
12513	NC_019902	CGG	2	6	652092	652097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760022
12514	NC_019902	GGC	2	6	652100	652105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760022
12515	NC_019902	TCT	2	6	652115	652120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430760022
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12517	NC_019902	CTC	2	6	652214	652219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430760022
12518	NC_019902	GTC	2	6	652235	652240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760022
12519	NC_019902	GAG	2	6	652267	652272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430760022
12520	NC_019902	CGG	3	9	652273	652281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760022
12521	NC_019902	GGC	2	6	652286	652291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760022
12522	NC_019902	CGC	2	6	652338	652343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760022
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12526	NC_019902	GCGG	2	8	652472	652479	0 %	0 %	75 %	25 %	430760022
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12529	NC_019902	GGC	2	6	652589	652594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760022
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12531	NC_019902	GAG	2	6	652662	652667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430760022
12532	NC_019902	TGG	2	6	652675	652680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430760022
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12554	NC_019902	CG	3	6	654652	654657	0 %	0 %	50 %	50 %	430760025
12555	NC_019902	CCA	2	6	654916	654921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430760026
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12561	NC_019902	GCA	2	6	655617	655622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760028
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12592	NC_019902	GC	3	6	656793	656798	0 %	0 %	50 %	50 %	430760029
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12621	NC_019902	GCCG	2	8	658742	658749	0 %	0 %	50 %	50 %	430760031
12622	NC_019902	TGC	2	6	658767	658772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760031
12623	NC_019902	ATC	2	6	658778	658783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430760031
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12626	NC_019902	GCT	2	6	658918	658923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760032
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12629	NC_019902	TGCGC	2	10	659098	659107	0 %	20 %	40 %	40 %	430760032
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12631	NC_019902	TGC	2	6	659746	659751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760033
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12634	NC_019902	TGC	2	6	659922	659927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760034
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12645	NC_019902	AGC	2	6	660856	660861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760036
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12647	NC_019902	GGA	2	6	660947	660952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430760036
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12651	NC_019902	ATC	2	6	661360	661365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430760037
12652	NC_019902	AGAA	2	8	661373	661380	75 %	0 %	25 %	0 %	430760037
12653	NC_019902	CGC	2	6	661404	661409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760037
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12657	NC_019902	GTC	2	6	661620	661625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760037
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12703	NC_019902	CGAT	2	8	663836	663843	25 %	25 %	25 %	25 %	430760041
12704	NC_019902	CGGC	2	8	663849	663856	0 %	0 %	50 %	50 %	430760041
12705	NC_019902	TCG	2	6	663869	663874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760041
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12710	NC_019902	GAGC	2	8	664227	664234	25 %	0 %	50 %	25 %	430760042
12711	NC_019902	AG	3	6	664597	664602	50 %	0 %	50 %	0 %	430760043
12712	NC_019902	CGC	2	6	664604	664609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760043
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12720	NC_019902	GCA	2	6	664898	664903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760043
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12722	NC_019902	TGG	2	6	665176	665181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430760043
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12725	NC_019902	CATC	2	8	665288	665295	25 %	25 %	0 %	50 %	430760043
12726	NC_019902	GCC	2	6	665300	665305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760043
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12729	NC_019902	GCT	2	6	665381	665386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760043
12730	NC_019902	GCCA	2	8	665400	665407	25 %	0 %	25 %	50 %	430760043
12731	NC_019902	GC	3	6	665431	665436	0 %	0 %	50 %	50 %	430760043
12732	NC_019902	CGGGC	2	10	665520	665529	0 %	0 %	60 %	40 %	430760043
12733	NC_019902	ATCG	2	8	665547	665554	25 %	25 %	25 %	25 %	430760043
12734	NC_019902	GCG	2	6	666187	666192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760044
12735	NC_019902	GACGC	2	10	666212	666221	20 %	0 %	40 %	40 %	430760044
12736	NC_019902	TGG	2	6	666222	666227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430760044
12737	NC_019902	GGC	2	6	666233	666238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760044
12738	NC_019902	GCC	2	6	666240	666245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760044
12739	NC_019902	CGA	2	6	666250	666255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760044
12740	NC_019902	CGG	2	6	666282	666287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760044
12741	NC_019902	GC	3	6	666296	666301	0 %	0 %	50 %	50 %	430760044
12742	NC_019902	CG	3	6	666857	666862	0 %	0 %	50 %	50 %	430760045
12743	NC_019902	GGA	2	6	666945	666950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430760045
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12842	NC_019902	CGT	2	6	672418	672423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760054
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12850	NC_019902	CGG	2	6	672929	672934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760056
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12852	NC_019902	GTC	2	6	673063	673068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760056
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12855	NC_019902	TTTC	2	8	673236	673243	0 %	75 %	0 %	25 %	430760057
12856	NC_019902	GC	3	6	673340	673345	0 %	0 %	50 %	50 %	430760057
12857	NC_019902	CGGC	2	8	673376	673383	0 %	0 %	50 %	50 %	430760057
12858	NC_019902	GC	3	6	673521	673526	0 %	0 %	50 %	50 %	430760058
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12978	NC_019902	CGAT	2	8	681236	681243	25 %	25 %	25 %	25 %	430760067
12979	NC_019902	GGC	2	6	681279	681284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760067
12980	NC_019902	CCG	2	6	681331	681336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430760067
12981	NC_019902	GGA	2	6	681357	681362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430760067
12982	NC_019902	ATC	2	6	681522	681527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430760068
12983	NC_019902	CGACCG	2	12	681589	681600	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	430760068
12984	NC_019902	CTG	3	9	681776	681784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760069
12985	NC_019902	TCC	2	6	681831	681836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430760069
12986	NC_019902	GGC	2	6	681873	681878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760069
12987	NC_019902	CGG	2	6	681909	681914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760069
12988	NC_019902	CAG	2	6	681935	681940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760069
12989	NC_019902	A	7	7	681944	681950	100 %	0 %	0 %	0 %	430760069
12990	NC_019902	ATG	2	6	682001	682006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430760070
12991	NC_019902	CG	3	6	682060	682065	0 %	0 %	50 %	50 %	430760070
12992	NC_019902	CTC	2	6	682081	682086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430760070
12993	NC_019902	TGT	2	6	682166	682171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430760070
12994	NC_019902	TGC	2	6	682217	682222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430760070
12995	NC_019902	CG	3	6	682323	682328	0 %	0 %	50 %	50 %	430760070
12996	NC_019902	GAC	2	6	682633	682638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430760071
12997	NC_019902	GCG	2	6	682721	682726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760071
12998	NC_019902	GCG	2	6	682770	682775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760071
12999	NC_019902	GCG	2	6	682868	682873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760071
13000	NC_019902	GCG	2	6	682922	682927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430760071

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