MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 78359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019902	CG	3	6	36250	36255	0 %	0 %	50 %	50 %	430759386
502	NC_019902	GC	3	6	36261	36266	0 %	0 %	50 %	50 %	430759386
503	NC_019902	CGC	2	6	36324	36329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759386
504	NC_019902	CGG	2	6	36347	36352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759386
505	NC_019902	ACG	2	6	36382	36387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759386
506	NC_019902	CGT	2	6	36434	36439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759386
507	NC_019902	CGA	3	9	36440	36448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759386
508	NC_019902	CGA	2	6	36485	36490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759386
509	NC_019902	GCC	2	6	36505	36510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759386
510	NC_019902	ATCG	2	8	36677	36684	25 %	25 %	25 %	25 %	430759387
511	NC_019902	CCT	2	6	36829	36834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759387
512	NC_019902	GC	3	6	36837	36842	0 %	0 %	50 %	50 %	430759387
513	NC_019902	CTG	2	6	36847	36852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759387
514	NC_019902	AGT	2	6	36925	36930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759387
515	NC_019902	TCC	2	6	37023	37028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759388
516	NC_019902	CCT	2	6	37129	37134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759388
517	NC_019902	AAG	2	6	37154	37159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759388
518	NC_019902	GGC	2	6	37189	37194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759388
519	NC_019902	CTTGTG	2	12	37243	37254	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	430759388
520	NC_019902	ATCGC	2	10	37362	37371	20 %	20 %	20 %	40 %	430759388
521	NC_019902	GTT	2	6	37424	37429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430759388
522	NC_019902	CGC	2	6	37454	37459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759388
523	NC_019902	GCC	2	6	37476	37481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759388
524	NC_019902	TTC	2	6	37496	37501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759388
525	NC_019902	TTGCA	2	10	37523	37532	20 %	40 %	20 %	20 %	430759388
526	NC_019902	TCGG	2	8	37548	37555	0 %	25 %	50 %	25 %	430759388
527	NC_019902	GC	3	6	37632	37637	0 %	0 %	50 %	50 %	430759388
528	NC_019902	GTC	2	6	37701	37706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759388
529	NC_019902	GTA	2	6	37847	37852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759388
530	NC_019902	TGA	2	6	37864	37869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759388
531	NC_019902	TGG	2	6	37870	37875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759388
532	NC_019902	CGA	2	6	37891	37896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759388
533	NC_019902	GTC	2	6	38019	38024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759388
534	NC_019902	TCG	2	6	38095	38100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759388
535	NC_019902	GCTC	2	8	38112	38119	0 %	25 %	25 %	50 %	430759388
536	NC_019902	CGGT	2	8	38197	38204	0 %	25 %	50 %	25 %	430759388
537	NC_019902	TCA	2	6	38365	38370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759388
538	NC_019902	GCC	2	6	38424	38429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759388
539	NC_019902	GTG	2	6	38487	38492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759388
540	NC_019902	AAGG	2	8	38498	38505	50 %	0 %	50 %	0 %	430759388
541	NC_019902	AAG	2	6	38531	38536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759388
542	NC_019902	TTTG	2	8	38631	38638	0 %	75 %	25 %	0 %	430759388
543	NC_019902	GAT	2	6	38653	38658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759388
544	NC_019902	AGC	2	6	38853	38858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759388
545	NC_019902	CGT	2	6	39048	39053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759389
546	NC_019902	GCC	2	6	39096	39101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759389
547	NC_019902	GTCG	2	8	39195	39202	0 %	25 %	50 %	25 %	430759389
548	NC_019902	CCGAG	2	10	39243	39252	20 %	0 %	40 %	40 %	430759389
549	NC_019902	GCG	2	6	39256	39261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759389
550	NC_019902	GAT	2	6	39336	39341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759389
551	NC_019902	ATC	2	6	39352	39357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759389
552	NC_019902	GCGT	2	8	39390	39397	0 %	25 %	50 %	25 %	430759389
553	NC_019902	GGA	2	6	40125	40130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759390
554	NC_019902	ATGAGC	2	12	40132	40143	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	430759390
555	NC_019902	GCC	2	6	40147	40152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759390
556	NC_019902	GCGA	2	8	40193	40200	25 %	0 %	50 %	25 %	430759390
557	NC_019902	GCC	2	6	40259	40264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759390
558	NC_019902	GTC	2	6	40276	40281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759390
559	NC_019902	GTT	2	6	40332	40337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430759390
560	NC_019902	CCA	2	6	40362	40367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759390
561	NC_019902	CGA	2	6	40374	40379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759390
562	NC_019902	CTA	2	6	40386	40391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759390
563	NC_019902	GAC	2	6	40420	40425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759390
564	NC_019902	ACT	2	6	40433	40438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759390
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568	NC_019902	CTG	2	6	40552	40557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759390
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570	NC_019902	CT	3	6	40650	40655	0 %	50 %	0 %	50 %	430759390
571	NC_019902	AGC	2	6	40835	40840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759391
572	NC_019902	GGGC	2	8	40892	40899	0 %	0 %	75 %	25 %	430759391
573	NC_019902	CGC	3	9	41001	41009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759391
574	NC_019902	ACT	2	6	41034	41039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759391
575	NC_019902	GAC	2	6	41056	41061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759391
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579	NC_019902	CTA	2	6	41175	41180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759391
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581	NC_019902	CGG	2	6	41203	41208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759391
582	NC_019902	GAC	2	6	41230	41235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759391
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589	NC_019902	GACGGT	2	12	41777	41788	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	430759393
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591	NC_019902	TCG	2	6	41809	41814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759393
592	NC_019902	CGAGC	2	10	41840	41849	20 %	0 %	40 %	40 %	430759393
593	NC_019902	TGA	2	6	41881	41886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759393
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598	NC_019902	GGCG	2	8	42433	42440	0 %	0 %	75 %	25 %	430759394
599	NC_019902	TGGCC	2	10	42442	42451	0 %	20 %	40 %	40 %	430759394
600	NC_019902	GCA	2	6	42460	42465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759394
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606	NC_019902	GC	3	6	42722	42727	0 %	0 %	50 %	50 %	430759394
607	NC_019902	GCCG	2	8	42743	42750	0 %	0 %	50 %	50 %	430759394
608	NC_019902	GCGAGC	2	12	42753	42764	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430759394
609	NC_019902	CCA	2	6	42782	42787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759394
610	NC_019902	ATCG	2	8	42809	42816	25 %	25 %	25 %	25 %	430759394
611	NC_019902	CGC	2	6	42844	42849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759394
612	NC_019902	TCA	2	6	42853	42858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759394
613	NC_019902	GCGA	2	8	42864	42871	25 %	0 %	50 %	25 %	430759394
614	NC_019902	CAG	3	9	42887	42895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759394
615	NC_019902	C	6	6	42918	42923	0 %	0 %	0 %	100 %	430759394
616	NC_019902	GC	3	6	42955	42960	0 %	0 %	50 %	50 %	430759394
617	NC_019902	GTG	2	6	42974	42979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759394
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620	NC_019902	CGA	2	6	43159	43164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759394
621	NC_019902	GT	3	6	43212	43217	0 %	50 %	50 %	0 %	430759394
622	NC_019902	AGCC	2	8	43218	43225	25 %	0 %	25 %	50 %	430759394
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626	NC_019902	AGC	2	6	43353	43358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759394
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