MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 78359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_019902	CTT	2	6	2672359	2672364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430761848
52003	NC_019902	TCAAA	2	10	2672597	2672606	60 %	20 %	0 %	20 %	430761849
52004	NC_019902	TCG	2	6	2672646	2672651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761849
52005	NC_019902	CCG	2	6	2672665	2672670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761849
52006	NC_019902	TCA	2	6	2672706	2672711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761849
52007	NC_019902	GAT	2	6	2672785	2672790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761849
52008	NC_019902	CGGTA	2	10	2672802	2672811	20 %	20 %	40 %	20 %	430761849
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52011	NC_019902	GCGAT	2	10	2672946	2672955	20 %	20 %	40 %	20 %	430761849
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52114	NC_019902	GGC	2	6	2679202	2679207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761854
52115	NC_019902	CGA	2	6	2679234	2679239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761854
52116	NC_019902	CGG	2	6	2679246	2679251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761854
52117	NC_019902	GAG	2	6	2679335	2679340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430761854
52118	NC_019902	GCTC	2	8	2679435	2679442	0 %	25 %	25 %	50 %	430761854
52119	NC_019902	GAG	2	6	2679476	2679481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430761854
52120	NC_019902	CGG	2	6	2679556	2679561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761854
52121	NC_019902	GAT	2	6	2679671	2679676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761855
52122	NC_019902	CGC	2	6	2679695	2679700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761855
52123	NC_019902	CGG	2	6	2679712	2679717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761855
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52126	NC_019902	GAT	2	6	2679779	2679784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430761855
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52132	NC_019902	GCT	2	6	2680001	2680006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761855
52133	NC_019902	CCG	2	6	2680009	2680014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761855
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52137	NC_019902	GCT	2	6	2680124	2680129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761855
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52144	NC_019902	TGG	2	6	2680378	2680383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761855
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52155	NC_019902	CGC	2	6	2680825	2680830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761856
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52183	NC_019902	CG	4	8	2681983	2681990	0 %	0 %	50 %	50 %	430761857
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52199	NC_019902	CAGCG	2	10	2682713	2682722	20 %	0 %	40 %	40 %	430761858
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52201	NC_019902	ACG	2	6	2682740	2682745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761858
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52213	NC_019902	GC	3	6	2683456	2683461	0 %	0 %	50 %	50 %	430761859
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52215	NC_019902	CGC	2	6	2683501	2683506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761859
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52217	NC_019902	TCGT	2	8	2683536	2683543	0 %	50 %	25 %	25 %	430761859
52218	NC_019902	GCA	2	6	2683609	2683614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761859
52219	NC_019902	GGGA	2	8	2683619	2683626	25 %	0 %	75 %	0 %	430761859
52220	NC_019902	TGG	2	6	2683657	2683662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761859
52221	NC_019902	GCC	2	6	2683745	2683750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761859
52222	NC_019902	GGT	2	6	2683766	2683771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761859
52223	NC_019902	CGC	2	6	2683784	2683789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761859
52224	NC_019902	GCA	2	6	2683891	2683896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761859
52225	NC_019902	GGCG	2	8	2683921	2683928	0 %	0 %	75 %	25 %	430761859
52226	NC_019902	GCA	2	6	2683937	2683942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761859
52227	NC_019902	GCC	2	6	2683950	2683955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761859
52228	NC_019902	CAG	2	6	2684003	2684008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761859
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52230	NC_019902	CGGCG	2	10	2684054	2684063	0 %	0 %	60 %	40 %	430761859
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52334	NC_019902	TCC	2	6	2689049	2689054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430761863
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52336	NC_019902	GATGTC	2	12	2689088	2689099	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	430761863
52337	NC_019902	AGC	2	6	2689104	2689109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761863
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52339	NC_019902	GGCG	2	8	2689138	2689145	0 %	0 %	75 %	25 %	430761863
52340	NC_019902	CAT	2	6	2689175	2689180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761863
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52342	NC_019902	CAG	2	6	2689313	2689318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761863
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52345	NC_019902	GAC	2	6	2689457	2689462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761863
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52462	NC_019902	CGCA	2	8	2694476	2694483	25 %	0 %	25 %	50 %	430761868
52463	NC_019902	AGC	2	6	2694537	2694542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761868
52464	NC_019902	GTC	2	6	2694557	2694562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761868
52465	NC_019902	CG	3	6	2694620	2694625	0 %	0 %	50 %	50 %	430761868
52466	NC_019902	ACG	2	6	2694681	2694686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761868
52467	NC_019902	ATC	2	6	2694690	2694695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430761868
52468	NC_019902	TGCAGG	2	12	2694699	2694710	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	430761868
52469	NC_019902	TCG	2	6	2694726	2694731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761868
52470	NC_019902	CCA	2	6	2694739	2694744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761868
52471	NC_019902	TGGC	2	8	2694771	2694778	0 %	25 %	50 %	25 %	430761868
52472	NC_019902	GCC	2	6	2694790	2694795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761868
52473	NC_019902	C	6	6	2694794	2694799	0 %	0 %	0 %	100 %	430761868
52474	NC_019902	TGG	2	6	2694853	2694858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761868
52475	NC_019902	CG	3	6	2694929	2694934	0 %	0 %	50 %	50 %	430761868
52476	NC_019902	ACC	2	6	2694939	2694944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761868
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52479	NC_019902	CATCGG	2	12	2695015	2695026	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430761868
52480	NC_019902	CGG	2	6	2695080	2695085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761868
52481	NC_019902	GCA	2	6	2695138	2695143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761868
52482	NC_019902	GCC	2	6	2695154	2695159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761868
52483	NC_019902	CCG	2	6	2695170	2695175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761868
52484	NC_019902	CGG	2	6	2695194	2695199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761868
52485	NC_019902	GCG	2	6	2695202	2695207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430761868
52486	NC_019902	CTG	2	6	2695214	2695219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430761868
52487	NC_019902	CGTC	2	8	2695305	2695312	0 %	25 %	25 %	50 %	430761869
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52490	NC_019902	CAG	2	6	2695384	2695389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761869
52491	NC_019902	TGG	2	6	2695463	2695468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761869
52492	NC_019902	GCC	2	6	2695514	2695519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761869
52493	NC_019902	CGGCA	2	10	2695545	2695554	20 %	0 %	40 %	40 %	430761869
52494	NC_019902	CCG	2	6	2695623	2695628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761869
52495	NC_019902	TGG	2	6	2695676	2695681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430761869
52496	NC_019902	GC	3	6	2695693	2695698	0 %	0 %	50 %	50 %	430761869
52497	NC_019902	GCA	2	6	2695707	2695712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430761869
52498	NC_019902	GCC	2	6	2695721	2695726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761869
52499	NC_019902	CAC	2	6	2695729	2695734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430761869
52500	NC_019902	GCC	2	6	2695762	2695767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430761869

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