MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Thermobacillus composti KWC4 plasmid pTHECO01

Total Repeats: 2372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019898	TCA	2	6	147	152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748200
2	NC_019898	ACA	2	6	158	163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748200
3	NC_019898	GC	3	6	287	292	0 %	0 %	50 %	50 %	430748200
4	NC_019898	AAC	2	6	365	370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748200
5	NC_019898	ATAA	2	8	480	487	75 %	25 %	0 %	0 %	430748200
6	NC_019898	CTT	2	6	516	521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748200
7	NC_019898	CAA	2	6	600	605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748200
8	NC_019898	GGA	2	6	722	727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748200
9	NC_019898	ATG	3	9	820	828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748200
10	NC_019898	ACAA	2	8	868	875	75 %	0 %	0 %	25 %	430748200
11	NC_019898	AT	3	6	926	931	50 %	50 %	0 %	0 %	430748200
12	NC_019898	CAACG	2	10	936	945	40 %	0 %	20 %	40 %	430748200
13	NC_019898	TTC	2	6	946	951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748200
14	NC_019898	ATT	2	6	974	979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748200
15	NC_019898	TAC	2	6	1041	1046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748200
16	NC_019898	CTT	2	6	1084	1089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748200
17	NC_019898	GGA	2	6	1112	1117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748200
18	NC_019898	CGTC	2	8	1123	1130	0 %	25 %	25 %	50 %	430748200
19	NC_019898	GAA	2	6	1140	1145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748200
20	NC_019898	AGCA	2	8	1226	1233	50 %	0 %	25 %	25 %	430748200
21	NC_019898	AAAAT	2	10	1238	1247	80 %	20 %	0 %	0 %	430748200
22	NC_019898	CAA	2	6	1274	1279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748201
23	NC_019898	TTTTG	2	10	1342	1351	0 %	80 %	20 %	0 %	430748201
24	NC_019898	CTG	2	6	1539	1544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748201
25	NC_019898	AC	3	6	1645	1650	50 %	0 %	0 %	50 %	430748201
26	NC_019898	ATTA	2	8	1667	1674	50 %	50 %	0 %	0 %	430748201
27	NC_019898	CGA	2	6	1754	1759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748201
28	NC_019898	TTTC	2	8	1766	1773	0 %	75 %	0 %	25 %	430748201
29	NC_019898	TGT	2	6	1774	1779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748201
30	NC_019898	ACT	2	6	1806	1811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748201
31	NC_019898	TCA	2	6	1830	1835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748201
32	NC_019898	ATA	2	6	1845	1850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430748201
33	NC_019898	TTC	2	6	1868	1873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748201
34	NC_019898	GTT	2	6	1894	1899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748201
35	NC_019898	TG	3	6	1914	1919	0 %	50 %	50 %	0 %	430748201
36	NC_019898	TTC	2	6	2073	2078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748201
37	NC_019898	TTTAAC	2	12	2079	2090	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	430748201
38	NC_019898	GCG	2	6	2107	2112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748201
39	NC_019898	TGA	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748201
40	NC_019898	TAC	2	6	2171	2176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748201
41	NC_019898	CGC	2	6	2188	2193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748201
42	NC_019898	GCT	2	6	2212	2217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748201
43	NC_019898	CAA	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748201
44	NC_019898	TAA	2	6	2256	2261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430748201
45	NC_019898	T	7	7	2262	2268	0 %	100 %	0 %	0 %	430748201
46	NC_019898	TCCTCG	2	12	2325	2336	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	430748201
47	NC_019898	GTT	2	6	2473	2478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748201
48	NC_019898	CTA	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748201
49	NC_019898	TAT	2	6	4095	4100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748202
50	NC_019898	ACAT	2	8	4158	4165	50 %	25 %	0 %	25 %	430748202
51	NC_019898	A	6	6	4167	4172	100 %	0 %	0 %	0 %	430748202
52	NC_019898	GAA	3	9	4197	4205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748202
53	NC_019898	TTTC	2	8	4305	4312	0 %	75 %	0 %	25 %	430748202
54	NC_019898	CT	3	6	4327	4332	0 %	50 %	0 %	50 %	430748202
55	NC_019898	ACT	2	6	4369	4374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748202
56	NC_019898	A	6	6	4402	4407	100 %	0 %	0 %	0 %	430748202
57	NC_019898	AC	3	6	4423	4428	50 %	0 %	0 %	50 %	430748202
58	NC_019898	A	7	7	4431	4437	100 %	0 %	0 %	0 %	430748202
59	NC_019898	ACA	2	6	4501	4506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748202
60	NC_019898	GGA	2	6	4508	4513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748202
61	NC_019898	A	7	7	4535	4541	100 %	0 %	0 %	0 %	430748202
62	NC_019898	CCGA	2	8	4578	4585	25 %	0 %	25 %	50 %	430748202
63	NC_019898	GCA	2	6	4613	4618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748202
64	NC_019898	TAG	2	6	4621	4626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748202
65	NC_019898	AT	3	6	4677	4682	50 %	50 %	0 %	0 %	430748202
66	NC_019898	AAAGG	2	10	4698	4707	60 %	0 %	40 %	0 %	430748202
67	NC_019898	CAAA	2	8	4715	4722	75 %	0 %	0 %	25 %	430748202
68	NC_019898	AAG	2	6	4777	4782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748202
69	NC_019898	A	6	6	4820	4825	100 %	0 %	0 %	0 %	430748202
70	NC_019898	CCTT	2	8	4848	4855	0 %	50 %	0 %	50 %	430748202
71	NC_019898	CATA	2	8	4896	4903	50 %	25 %	0 %	25 %	430748202
72	NC_019898	GAT	2	6	5032	5037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748202
73	NC_019898	CGC	2	6	5432	5437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748203
74	NC_019898	TCA	3	9	5446	5454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748203
75	NC_019898	TTA	2	6	5460	5465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748203
76	NC_019898	GTC	2	6	5471	5476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748203
77	NC_019898	CCTG	2	8	5525	5532	0 %	25 %	25 %	50 %	430748203
78	NC_019898	GTTC	2	8	5542	5549	0 %	50 %	25 %	25 %	430748203
79	NC_019898	TTCT	3	12	5575	5586	0 %	75 %	0 %	25 %	430748203
80	NC_019898	C	6	6	5601	5606	0 %	0 %	0 %	100 %	430748203
81	NC_019898	AG	3	6	5628	5633	50 %	0 %	50 %	0 %	430748203
82	NC_019898	CCA	2	6	5658	5663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748204
83	NC_019898	TTC	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748204
84	NC_019898	CAA	2	6	5768	5773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748204
85	NC_019898	AAT	2	6	5933	5938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430748204
86	NC_019898	TGAT	2	8	5965	5972	25 %	50 %	25 %	0 %	430748204
87	NC_019898	CAGC	2	8	5993	6000	25 %	0 %	25 %	50 %	430748204
88	NC_019898	TTG	2	6	6004	6009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748204
89	NC_019898	TCA	2	6	6128	6133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748204
90	NC_019898	GTTC	2	8	6179	6186	0 %	50 %	25 %	25 %	430748204
91	NC_019898	CCA	3	9	6280	6288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748204
92	NC_019898	GTTAA	2	10	6298	6307	40 %	40 %	20 %	0 %	430748204
93	NC_019898	GCA	2	6	6472	6477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748204
94	NC_019898	TTG	2	6	6541	6546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748204
95	NC_019898	TCGA	2	8	6559	6566	25 %	25 %	25 %	25 %	430748204
96	NC_019898	CTT	2	6	6578	6583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748204
97	NC_019898	TC	3	6	6594	6599	0 %	50 %	0 %	50 %	430748204
98	NC_019898	CTTT	2	8	6639	6646	0 %	75 %	0 %	25 %	430748204
99	NC_019898	TGC	2	6	6870	6875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748204
100	NC_019898	TCC	2	6	6886	6891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748204
101	NC_019898	CT	3	6	6945	6950	0 %	50 %	0 %	50 %	430748204
102	NC_019898	ATC	2	6	6963	6968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748204
103	NC_019898	GGA	2	6	7020	7025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748204
104	NC_019898	CAT	2	6	7031	7036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748204
105	NC_019898	AGC	2	6	7066	7071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748204
106	NC_019898	TTC	2	6	7179	7184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748204
107	NC_019898	T	6	6	7203	7208	0 %	100 %	0 %	0 %	430748204
108	NC_019898	ATTT	2	8	7242	7249	25 %	75 %	0 %	0 %	430748204
109	NC_019898	GATT	2	8	7255	7262	25 %	50 %	25 %	0 %	430748204
110	NC_019898	AGT	2	6	7268	7273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748204
111	NC_019898	GCT	2	6	7286	7291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748204
112	NC_019898	CCA	2	6	7292	7297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748204
113	NC_019898	GCC	2	6	7486	7491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748205
114	NC_019898	TCA	2	6	7550	7555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748205
115	NC_019898	GA	3	6	7620	7625	50 %	0 %	50 %	0 %	430748205
116	NC_019898	TC	3	6	7658	7663	0 %	50 %	0 %	50 %	430748205
117	NC_019898	T	6	6	7963	7968	0 %	100 %	0 %	0 %	430748206
118	NC_019898	ATCG	2	8	8019	8026	25 %	25 %	25 %	25 %	430748206
119	NC_019898	GCC	2	6	8085	8090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748206
120	NC_019898	CATCC	2	10	8212	8221	20 %	20 %	0 %	60 %	430748206
121	NC_019898	CAT	2	6	8241	8246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748206
122	NC_019898	CTT	2	6	8378	8383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748206
123	NC_019898	TACC	2	8	8423	8430	25 %	25 %	0 %	50 %	430748206
124	NC_019898	TCC	2	6	8449	8454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748206
125	NC_019898	CG	3	6	8567	8572	0 %	0 %	50 %	50 %	430748206
126	NC_019898	GACG	2	8	8613	8620	25 %	0 %	50 %	25 %	430748206
127	NC_019898	AAT	2	6	8640	8645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430748206
128	NC_019898	AGG	2	6	8653	8658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748206
129	NC_019898	AG	3	6	8714	8719	50 %	0 %	50 %	0 %	430748206
130	NC_019898	TCT	2	6	8741	8746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748206
131	NC_019898	CAA	2	6	8762	8767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748206
132	NC_019898	T	6	6	8812	8817	0 %	100 %	0 %	0 %	430748206
133	NC_019898	ATC	2	6	8830	8835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748206
134	NC_019898	GCA	2	6	8840	8845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748206
135	NC_019898	T	7	7	8906	8912	0 %	100 %	0 %	0 %	430748206
136	NC_019898	TCG	2	6	8941	8946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748206
137	NC_019898	CGG	2	6	9090	9095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748206
138	NC_019898	CAA	2	6	9215	9220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748206
139	NC_019898	TCC	2	6	9256	9261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748206
140	NC_019898	A	6	6	9269	9274	100 %	0 %	0 %	0 %	430748206
141	NC_019898	ATG	2	6	9306	9311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748206
142	NC_019898	TCC	2	6	9343	9348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748206
143	NC_019898	ATA	2	6	9381	9386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430748206
144	NC_019898	AAC	2	6	9420	9425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748206
145	NC_019898	GAAACC	2	12	9431	9442	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	430748206
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147	NC_019898	TCC	3	9	9562	9570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748207
148	NC_019898	ATGGAG	2	12	9667	9678	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	430748207
149	NC_019898	TCCCC	2	10	9717	9726	0 %	20 %	0 %	80 %	430748207
150	NC_019898	CTTT	2	8	10267	10274	0 %	75 %	0 %	25 %	430748208
151	NC_019898	CAG	2	6	10300	10305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748208
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153	NC_019898	G	6	6	10799	10804	0 %	0 %	100 %	0 %	430748209
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159	NC_019898	A	6	6	11346	11351	100 %	0 %	0 %	0 %	430748210
160	NC_019898	TTCG	2	8	11364	11371	0 %	50 %	25 %	25 %	430748210
161	NC_019898	TCAC	2	8	11488	11495	25 %	25 %	0 %	50 %	430748210
162	NC_019898	TTCA	2	8	11523	11530	25 %	50 %	0 %	25 %	430748210
163	NC_019898	CGA	2	6	11566	11571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748210
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165	NC_019898	GCG	2	6	11745	11750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748210
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168	NC_019898	GCAT	2	8	11801	11808	25 %	25 %	25 %	25 %	430748210
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172	NC_019898	TCT	2	6	12172	12177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748210
173	NC_019898	CGG	2	6	12197	12202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748210
174	NC_019898	CTC	2	6	12300	12305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748210
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250	NC_019898	TCT	2	6	19062	19067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748218
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252	NC_019898	TCT	2	6	19179	19184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748218
253	NC_019898	C	6	6	19289	19294	0 %	0 %	0 %	100 %	430748219
254	NC_019898	TC	3	6	19323	19328	0 %	50 %	0 %	50 %	430748219
255	NC_019898	TTCA	2	8	19345	19352	25 %	50 %	0 %	25 %	430748219
256	NC_019898	ATG	3	9	19376	19384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748219
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258	NC_019898	AAG	2	6	19439	19444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748219
259	NC_019898	CCATC	2	10	19627	19636	20 %	20 %	0 %	60 %	430748219
260	NC_019898	TCATT	2	10	19674	19683	20 %	60 %	0 %	20 %	430748219
261	NC_019898	CGG	2	6	19704	19709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748219
262	NC_019898	AGC	2	6	19753	19758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748219
263	NC_019898	CGCTT	2	10	20052	20061	0 %	40 %	20 %	40 %	430748221
264	NC_019898	GAT	2	6	20113	20118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748221
265	NC_019898	CTC	2	6	20132	20137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748221
266	NC_019898	AT	3	6	20260	20265	50 %	50 %	0 %	0 %	430748221
267	NC_019898	CTTC	2	8	20355	20362	0 %	50 %	0 %	50 %	430748221
268	NC_019898	TGA	2	6	20467	20472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748221
269	NC_019898	GA	3	6	20518	20523	50 %	0 %	50 %	0 %	430748221
270	NC_019898	GCA	2	6	20602	20607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748221
271	NC_019898	GA	3	6	20628	20633	50 %	0 %	50 %	0 %	430748221
272	NC_019898	AGCTTC	2	12	20823	20834	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	430748222
273	NC_019898	GCTTCC	2	12	20838	20849	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	430748222
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276	NC_019898	GCC	2	6	20900	20905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748222
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390	NC_019898	AG	3	6	28512	28517	50 %	0 %	50 %	0 %	430748235
391	NC_019898	TCTG	2	8	28550	28557	0 %	50 %	25 %	25 %	430748235
392	NC_019898	GTAC	2	8	28608	28615	25 %	25 %	25 %	25 %	430748235
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