MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermobacillus composti KWC4 plasmid pTHECO01

Total Repeats: 2372

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019898	TCC	2	6	34846	34851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748238
502	NC_019898	T	10	10	34943	34952	0 %	100 %	0 %	0 %	430748238
503	NC_019898	CTTC	2	8	35108	35115	0 %	50 %	0 %	50 %	430748238
504	NC_019898	TCT	2	6	35116	35121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748238
505	NC_019898	T	7	7	35246	35252	0 %	100 %	0 %	0 %	430748238
506	NC_019898	CCA	2	6	35304	35309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748238
507	NC_019898	TTTC	2	8	35396	35403	0 %	75 %	0 %	25 %	430748238
508	NC_019898	GAA	2	6	35483	35488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748238
509	NC_019898	TGT	2	6	35609	35614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748238
510	NC_019898	GTT	2	6	35616	35621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748238
511	NC_019898	TTC	2	6	35631	35636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748238
512	NC_019898	AT	3	6	35647	35652	50 %	50 %	0 %	0 %	430748238
513	NC_019898	TTC	2	6	35653	35658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748238
514	NC_019898	CTT	2	6	35664	35669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748238
515	NC_019898	T	6	6	35801	35806	0 %	100 %	0 %	0 %	430748238
516	NC_019898	GCT	2	6	35807	35812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748238
517	NC_019898	AACG	2	8	35829	35836	50 %	0 %	25 %	25 %	430748238
518	NC_019898	CTT	2	6	35934	35939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748238
519	NC_019898	TG	3	6	36007	36012	0 %	50 %	50 %	0 %	430748239
520	NC_019898	TAC	2	6	36026	36031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748239
521	NC_019898	TGT	2	6	36047	36052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748239
522	NC_019898	GCAA	2	8	36109	36116	50 %	0 %	25 %	25 %	430748239
523	NC_019898	AGAA	2	8	36208	36215	75 %	0 %	25 %	0 %	430748239
524	NC_019898	A	6	6	36242	36247	100 %	0 %	0 %	0 %	430748239
525	NC_019898	CGA	2	6	36257	36262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748239
526	NC_019898	CCCAGT	2	12	36326	36337	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	430748239
527	NC_019898	TTCG	2	8	36378	36385	0 %	50 %	25 %	25 %	430748239
528	NC_019898	TCA	2	6	36392	36397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748239
529	NC_019898	ACC	2	6	36401	36406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748240
530	NC_019898	CGA	2	6	36487	36492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748240
531	NC_019898	TCA	2	6	36496	36501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748240
532	NC_019898	TGT	2	6	36574	36579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748240
533	NC_019898	GCA	2	6	36633	36638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748240
534	NC_019898	CAT	2	6	36641	36646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748240
535	NC_019898	GAAAC	2	10	36661	36670	60 %	0 %	20 %	20 %	430748240
536	NC_019898	TCTT	2	8	36684	36691	0 %	75 %	0 %	25 %	430748240
537	NC_019898	TTCA	2	8	36693	36700	25 %	50 %	0 %	25 %	430748240
538	NC_019898	TTCA	2	8	36712	36719	25 %	50 %	0 %	25 %	430748241
539	NC_019898	TGA	2	6	36722	36727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748241
540	NC_019898	GTTG	2	8	36729	36736	0 %	50 %	50 %	0 %	430748241
541	NC_019898	AGAA	2	8	36815	36822	75 %	0 %	25 %	0 %	430748241
542	NC_019898	TAG	2	6	37026	37031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748241
543	NC_019898	CAT	2	6	37054	37059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748241
544	NC_019898	GATG	2	8	37121	37128	25 %	25 %	50 %	0 %	430748241
545	NC_019898	C	6	6	37295	37300	0 %	0 %	0 %	100 %	430748241
546	NC_019898	TGT	2	6	37312	37317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748241
547	NC_019898	CGG	2	6	37338	37343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748241
548	NC_019898	TTC	2	6	37380	37385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748241
549	NC_019898	TGAAA	2	10	37466	37475	60 %	20 %	20 %	0 %	430748241
550	NC_019898	ATC	2	6	37508	37513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748241
551	NC_019898	CGAAG	2	10	37532	37541	40 %	0 %	40 %	20 %	430748241
552	NC_019898	CAG	2	6	37543	37548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748241
553	NC_019898	TCG	2	6	37566	37571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430748241
554	NC_019898	TGG	2	6	37605	37610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748241
555	NC_019898	ACC	2	6	37611	37616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748241
556	NC_019898	TGA	2	6	37648	37653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748241
557	NC_019898	A	7	7	37675	37681	100 %	0 %	0 %	0 %	430748241
558	NC_019898	T	7	7	37748	37754	0 %	100 %	0 %	0 %	430748241
559	NC_019898	T	7	7	37795	37801	0 %	100 %	0 %	0 %	430748241
560	NC_019898	CCA	2	6	37806	37811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748241
561	NC_019898	TGA	2	6	37853	37858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748242
562	NC_019898	TTTTTG	2	12	37859	37870	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	430748242
563	NC_019898	ATG	2	6	37889	37894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748242
564	NC_019898	AAT	2	6	37915	37920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430748242
565	NC_019898	CCA	2	6	37975	37980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430748242
566	NC_019898	CGC	2	6	38002	38007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748242
567	NC_019898	TCA	2	6	38015	38020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748242
568	NC_019898	TTG	2	6	38083	38088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748242
569	NC_019898	GGT	2	6	38111	38116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748242
570	NC_019898	GACA	2	8	38164	38171	50 %	0 %	25 %	25 %	430748242
571	NC_019898	GCAA	2	8	38180	38187	50 %	0 %	25 %	25 %	430748242
572	NC_019898	T	6	6	38212	38217	0 %	100 %	0 %	0 %	430748242
573	NC_019898	A	7	7	38321	38327	100 %	0 %	0 %	0 %	430748243
574	NC_019898	AGAT	2	8	38370	38377	50 %	25 %	25 %	0 %	430748243
575	NC_019898	TCCT	2	8	38426	38433	0 %	50 %	0 %	50 %	430748244
576	NC_019898	TTA	2	6	38435	38440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430748244
577	NC_019898	CTA	2	6	38449	38454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748244
578	NC_019898	CAG	4	12	38468	38479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748244
579	NC_019898	TGA	2	6	38486	38491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748244
580	NC_019898	AAC	2	6	38517	38522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748244
581	NC_019898	GA	3	6	38782	38787	50 %	0 %	50 %	0 %	430748244
582	NC_019898	ATG	2	6	38799	38804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748244
583	NC_019898	CTT	2	6	38848	38853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430748244
584	NC_019898	TCCTC	2	10	38885	38894	0 %	40 %	0 %	60 %	430748244
585	NC_019898	CGTTTA	2	12	38971	38982	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	430748244
586	NC_019898	TCAA	2	8	39025	39032	50 %	25 %	0 %	25 %	430748244
587	NC_019898	CCG	2	6	39060	39065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748244
588	NC_019898	TCC	2	6	39118	39123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430748244
589	NC_019898	TAG	2	6	39172	39177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748244
590	NC_019898	AGC	2	6	39226	39231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748244
591	NC_019898	GAG	2	6	39283	39288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748244
592	NC_019898	GCTTCC	2	12	39296	39307	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	430748244
593	NC_019898	T	6	6	40000	40005	0 %	100 %	0 %	0 %	430748245
594	NC_019898	TGGA	2	8	40047	40054	25 %	25 %	50 %	0 %	430748245
595	NC_019898	GAC	2	6	40112	40117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748245
596	NC_019898	AGA	2	6	40128	40133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748245
597	NC_019898	ATCG	2	8	40165	40172	25 %	25 %	25 %	25 %	430748245
598	NC_019898	AC	3	6	40229	40234	50 %	0 %	0 %	50 %	430748245
599	NC_019898	AAC	2	6	40268	40273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748245
600	NC_019898	GA	3	6	40337	40342	50 %	0 %	50 %	0 %	430748245
601	NC_019898	ACA	2	6	40414	40419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748245
602	NC_019898	CA	3	6	40418	40423	50 %	0 %	0 %	50 %	430748245
603	NC_019898	CAAG	2	8	40498	40505	50 %	0 %	25 %	25 %	430748245
604	NC_019898	C	7	7	40554	40560	0 %	0 %	0 %	100 %	430748245
605	NC_019898	AAC	2	6	40600	40605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748245
606	NC_019898	ACG	2	6	40736	40741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748245
607	NC_019898	GCG	2	6	40758	40763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748245
608	NC_019898	AATC	2	8	40792	40799	50 %	25 %	0 %	25 %	430748245
609	NC_019898	GCA	2	6	40879	40884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748245
610	NC_019898	TGG	2	6	41056	41061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430748245
611	NC_019898	GA	3	6	41077	41082	50 %	0 %	50 %	0 %	430748245
612	NC_019898	GCC	2	6	41562	41567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430748246
613	NC_019898	C	6	6	41601	41606	0 %	0 %	0 %	100 %	430748246
614	NC_019898	GCA	2	6	41613	41618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430748246
615	NC_019898	AAC	2	6	41619	41624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748246
616	NC_019898	CAA	2	6	41649	41654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430748246
617	NC_019898	ATG	2	6	43470	43475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430748247
618	NC_019898	CGG	2	6	43479	43484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430748247
619	NC_019898	GTT	2	6	43486	43491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430748247
620	NC_019898	GGA	2	6	43498	43503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748247
621	NC_019898	AGA	2	6	43507	43512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748247
622	NC_019898	GAA	2	6	43523	43528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430748247
623	NC_019898	GGCT	2	8	43595	43602	0 %	25 %	50 %	25 %	430748247
624	NC_019898	CT	3	6	43628	43633	0 %	50 %	0 %	50 %	430748247
625	NC_019898	AC	3	6	43685	43690	50 %	0 %	0 %	50 %	430748247
626	NC_019898	TA	3	6	43770	43775	50 %	50 %	0 %	0 %	430748247
627	NC_019898	TA	3	6	43784	43789	50 %	50 %	0 %	0 %	430748247
628	NC_019898	GGA	2	6	43874	43879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430748247
629	NC_019898	TCA	2	6	43975	43980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430748247
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