MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Thermus oshimai JL-2 plasmid pTHEOS02

Total Repeats: 1222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019388	GATGAG	2	12	21	32	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	410731196
2	NC_019388	CTC	2	6	58	63	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731196
3	NC_019388	TGG	2	6	86	91	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731196
4	NC_019388	GTG	2	6	103	108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731196
5	NC_019388	CCTG	2	8	182	189	0 %	25 %	25 %	50 %	410731196
6	NC_019388	GCCCTG	2	12	204	215	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410731196
7	NC_019388	GGCG	2	8	221	228	0 %	0 %	75 %	25 %	410731196
8	NC_019388	GCGGGA	2	12	279	290	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	410731196
9	NC_019388	CGGG	2	8	297	304	0 %	0 %	75 %	25 %	410731196
10	NC_019388	GCTG	2	8	344	351	0 %	25 %	50 %	25 %	410731196
11	NC_019388	GGGCT	2	10	360	369	0 %	20 %	60 %	20 %	410731196
12	NC_019388	CCAGGC	2	12	417	428	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	410731196
13	NC_019388	C	6	6	463	468	0 %	0 %	0 %	100 %	410731196
14	NC_019388	GGCGG	2	10	531	540	0 %	0 %	80 %	20 %	410731196
15	NC_019388	TCC	2	6	570	575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731196
16	NC_019388	TCC	2	6	626	631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731196
17	NC_019388	C	6	6	630	635	0 %	0 %	0 %	100 %	410731196
18	NC_019388	GGGACG	2	12	656	667	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	410731196
19	NC_019388	AGGA	2	8	711	718	50 %	0 %	50 %	0 %	410731197
20	NC_019388	ACC	2	6	727	732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731197
21	NC_019388	GAG	2	6	747	752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731197
22	NC_019388	TGG	2	6	766	771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731197
23	NC_019388	GGA	3	9	806	814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731197
24	NC_019388	CCT	2	6	821	826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731197
25	NC_019388	GAG	2	6	885	890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731197
26	NC_019388	CCG	2	6	896	901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731197
27	NC_019388	AGG	2	6	928	933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731197
28	NC_019388	CGG	2	6	943	948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731197
29	NC_019388	AGGGC	2	10	964	973	20 %	0 %	60 %	20 %	410731197
30	NC_019388	CCA	2	6	1000	1005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731198
31	NC_019388	C	6	6	1043	1048	0 %	0 %	0 %	100 %	410731198
32	NC_019388	GGGGCC	2	12	1050	1061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731198
33	NC_019388	GCG	2	6	1070	1075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731198
34	NC_019388	GAG	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731198
35	NC_019388	GGA	2	6	1087	1092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731198
36	NC_019388	CAC	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731198
37	NC_019388	AGG	3	9	1182	1190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731198
38	NC_019388	GAG	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731198
39	NC_019388	CCGT	2	8	1281	1288	0 %	25 %	25 %	50 %	410731198
40	NC_019388	GGA	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731198
41	NC_019388	CCTT	2	8	1329	1336	0 %	50 %	0 %	50 %	410731198
42	NC_019388	CGC	2	6	1397	1402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731198
43	NC_019388	G	6	6	1411	1416	0 %	0 %	100 %	0 %	410731198
44	NC_019388	ACC	2	6	1425	1430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731198
45	NC_019388	C	6	6	1429	1434	0 %	0 %	0 %	100 %	410731198
46	NC_019388	GTC	2	6	1462	1467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410731199
47	NC_019388	GGCG	2	8	1473	1480	0 %	0 %	75 %	25 %	410731199
48	NC_019388	ACC	2	6	1496	1501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731199
49	NC_019388	GGC	2	6	1503	1508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731199
50	NC_019388	G	6	6	1555	1560	0 %	0 %	100 %	0 %	410731199
51	NC_019388	AGG	2	6	1571	1576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731199
52	NC_019388	G	6	6	1581	1586	0 %	0 %	100 %	0 %	410731199
53	NC_019388	AGG	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731199
54	NC_019388	CTC	2	6	1660	1665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731199
55	NC_019388	CGG	2	6	1674	1679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731199
56	NC_019388	GGC	2	6	1683	1688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731199
57	NC_019388	CGTC	2	8	1776	1783	0 %	25 %	25 %	50 %	410731199
58	NC_019388	GTA	2	6	1885	1890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410731199
59	NC_019388	CTT	3	9	1909	1917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410731199
60	NC_019388	GCG	2	6	1955	1960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731199
61	NC_019388	TAG	2	6	1961	1966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410731199
62	NC_019388	CCT	2	6	1971	1976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731199
63	NC_019388	CCA	2	6	2089	2094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731200
64	NC_019388	AAGG	2	8	2117	2124	50 %	0 %	50 %	0 %	410731200
65	NC_019388	TCC	2	6	2128	2133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731200
66	NC_019388	CCCG	2	8	2164	2171	0 %	0 %	25 %	75 %	410731200
67	NC_019388	GGA	2	6	2182	2187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731200
68	NC_019388	GAG	2	6	2233	2238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731200
69	NC_019388	GCGG	2	8	2285	2292	0 %	0 %	75 %	25 %	410731200
70	NC_019388	C	6	6	2317	2322	0 %	0 %	0 %	100 %	410731200
71	NC_019388	AGGGCC	2	12	2331	2342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	410731200
72	NC_019388	GGA	2	6	2344	2349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731200
73	NC_019388	C	6	6	2356	2361	0 %	0 %	0 %	100 %	410731200
74	NC_019388	GGC	2	6	2396	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731200
75	NC_019388	C	6	6	2449	2454	0 %	0 %	0 %	100 %	410731200
76	NC_019388	CCCG	2	8	2460	2467	0 %	0 %	25 %	75 %	410731200
77	NC_019388	GCC	2	6	2475	2480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731200
78	NC_019388	GGC	2	6	2558	2563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731200
79	NC_019388	CTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410731200
80	NC_019388	CTT	2	6	2623	2628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410731200
81	NC_019388	CCT	2	6	2629	2634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731200
82	NC_019388	GGGT	3	12	2641	2652	0 %	25 %	75 %	0 %	410731200
83	NC_019388	TTC	2	6	2672	2677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410731200
84	NC_019388	T	6	6	2688	2693	0 %	100 %	0 %	0 %	410731200
85	NC_019388	CCGCCT	2	12	2736	2747	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	410731200
86	NC_019388	TCCACC	2	12	2838	2849	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	410731200
87	NC_019388	GC	3	6	2882	2887	0 %	0 %	50 %	50 %	410731200
88	NC_019388	AGG	2	6	2907	2912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731200
89	NC_019388	GGCCAG	2	12	2963	2974	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	410731200
90	NC_019388	GGCG	2	8	2983	2990	0 %	0 %	75 %	25 %	410731200
91	NC_019388	CTTC	2	8	3072	3079	0 %	50 %	0 %	50 %	410731200
92	NC_019388	CAC	2	6	3408	3413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731201
93	NC_019388	CCAG	2	8	3431	3438	25 %	0 %	25 %	50 %	410731201
94	NC_019388	GAGG	2	8	3447	3454	25 %	0 %	75 %	0 %	410731201
95	NC_019388	TCCCC	2	10	3515	3524	0 %	20 %	0 %	80 %	410731201
96	NC_019388	GTG	2	6	3619	3624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731201
97	NC_019388	ACC	2	6	3626	3631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731201
98	NC_019388	G	6	6	3675	3680	0 %	0 %	100 %	0 %	410731201
99	NC_019388	TCC	2	6	3715	3720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731201
100	NC_019388	TCG	2	6	3730	3735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410731201
101	NC_019388	GAG	3	9	3753	3761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731201
102	NC_019388	CCTC	2	8	3778	3785	0 %	25 %	0 %	75 %	410731201
103	NC_019388	AGG	2	6	3799	3804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731201
104	NC_019388	CAC	2	6	3840	3845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731201
105	NC_019388	CGG	2	6	3851	3856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731201
106	NC_019388	C	6	6	3878	3883	0 %	0 %	0 %	100 %	410731201
107	NC_019388	TGG	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731201
108	NC_019388	CCA	2	6	3968	3973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731201
109	NC_019388	G	7	7	3986	3992	0 %	0 %	100 %	0 %	410731201
110	NC_019388	TGG	2	6	5224	5229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731202
111	NC_019388	TGG	2	6	5329	5334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731202
112	NC_019388	AGG	2	6	5335	5340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731202
113	NC_019388	GGTG	2	8	5341	5348	0 %	25 %	75 %	0 %	410731202
114	NC_019388	GGA	2	6	5354	5359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731202
115	NC_019388	GGT	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731202
116	NC_019388	GC	3	6	5445	5450	0 %	0 %	50 %	50 %	410731202
117	NC_019388	GGT	2	6	5456	5461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731202
118	NC_019388	TGG	2	6	5514	5519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731203
119	NC_019388	CTC	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731203
120	NC_019388	CCT	2	6	5560	5565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731203
121	NC_019388	ACT	2	6	5577	5582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410731203
122	NC_019388	GCGG	2	8	5629	5636	0 %	0 %	75 %	25 %	410731203
123	NC_019388	AGG	2	6	5640	5645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731203
124	NC_019388	AGG	2	6	5658	5663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731203
125	NC_019388	AGG	2	6	5667	5672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731203
126	NC_019388	AGG	2	6	5679	5684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731203
127	NC_019388	CCTAGC	2	12	5764	5775	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	410731204
128	NC_019388	CCT	2	6	5776	5781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731204
129	NC_019388	GCC	2	6	5858	5863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731204
130	NC_019388	GGC	2	6	5938	5943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731204
131	NC_019388	GGC	2	6	5962	5967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731204
132	NC_019388	GGC	2	6	5980	5985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731204
133	NC_019388	GAT	2	6	5989	5994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410731204
134	NC_019388	GCCGAT	2	12	6276	6287	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	410731205
135	NC_019388	GGC	2	6	6449	6454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731205
136	NC_019388	GCC	2	6	6514	6519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731205
137	NC_019388	TCC	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731205
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268	NC_019388	GAG	2	6	11366	11371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731213
269	NC_019388	CTT	2	6	11401	11406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410731213
270	NC_019388	TGG	4	12	11451	11462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731213
271	NC_019388	CCG	3	9	11499	11507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410731213
272	NC_019388	GGC	2	6	11517	11522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731213
273	NC_019388	TCC	2	6	11538	11543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731213
274	NC_019388	TTC	2	6	11561	11566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410731213
275	NC_019388	TCC	2	6	11571	11576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731213
276	NC_019388	TGG	2	6	11579	11584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731213
277	NC_019388	TCC	2	6	11619	11624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731213
278	NC_019388	CGCC	2	8	11632	11639	0 %	0 %	25 %	75 %	410731213
279	NC_019388	C	6	6	11664	11669	0 %	0 %	0 %	100 %	410731213
280	NC_019388	C	6	6	11680	11685	0 %	0 %	0 %	100 %	410731213
281	NC_019388	TCCT	2	8	11690	11697	0 %	50 %	0 %	50 %	410731213
282	NC_019388	GGA	2	6	11722	11727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731213
283	NC_019388	GGA	2	6	11746	11751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731213
284	NC_019388	CAAC	2	8	11913	11920	50 %	0 %	0 %	50 %	410731214
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287	NC_019388	GCGGA	2	10	12010	12019	20 %	0 %	60 %	20 %	410731214
288	NC_019388	TGGAGG	2	12	12080	12091	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	410731214
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291	NC_019388	CGA	2	6	12260	12265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410731215
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299	NC_019388	GGT	2	6	12476	12481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731215
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302	NC_019388	CCA	2	6	12599	12604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731215
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306	NC_019388	AAG	2	6	12973	12978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410731216
307	NC_019388	CCTGGC	2	12	13005	13016	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410731216
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311	NC_019388	GCCCT	2	10	13087	13096	0 %	20 %	20 %	60 %	410731216
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320	NC_019388	AGGCCA	2	12	13323	13334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410731217
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372	NC_019388	ATC	2	6	15603	15608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410731224
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376	NC_019388	G	6	6	15836	15841	0 %	0 %	100 %	0 %	410731224
377	NC_019388	GCGG	2	8	15860	15867	0 %	0 %	75 %	25 %	410731224
378	NC_019388	CGGG	2	8	15884	15891	0 %	0 %	75 %	25 %	410731224
379	NC_019388	CCTG	2	8	16001	16008	0 %	25 %	25 %	50 %	410731224
380	NC_019388	GGC	2	6	16037	16042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731224
381	NC_019388	AGGCG	2	10	16060	16069	20 %	0 %	60 %	20 %	410731224
382	NC_019388	GGC	2	6	16177	16182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410731225
383	NC_019388	GGA	2	6	16221	16226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731225
384	NC_019388	C	6	6	16231	16236	0 %	0 %	0 %	100 %	410731225
385	NC_019388	GGA	2	6	16272	16277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731225
386	NC_019388	TGG	2	6	16298	16303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410731225
387	NC_019388	CGA	2	6	16329	16334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410731225
388	NC_019388	TCC	2	6	16349	16354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410731225
389	NC_019388	GAG	2	6	16399	16404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731225
390	NC_019388	C	7	7	16515	16521	0 %	0 %	0 %	100 %	410731226
391	NC_019388	CCCG	2	8	16609	16616	0 %	0 %	25 %	75 %	410731226
392	NC_019388	AGG	2	6	16635	16640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410731226
393	NC_019388	CCCCCA	2	12	16670	16681	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	410731226
394	NC_019388	CCA	2	6	16700	16705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410731226
395	NC_019388	G	6	6	16734	16739	0 %	0 %	100 %	0 %	410731226
396	NC_019388	TCCAG	2	10	16751	16760	20 %	20 %	20 %	40 %	410731226
397	NC_019388	C	6	6	16765	16770	0 %	0 %	0 %	100 %	410731226
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