MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus oshimai JL-2 plasmid pTHEOS01

Total Repeats: 6455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019387	C	6	6	236	241	0 %	0 %	0 %	100 %	410730942
2	NC_019387	CGGA	2	8	255	262	25 %	0 %	50 %	25 %	410730942
3	NC_019387	CGCC	2	8	269	276	0 %	0 %	25 %	75 %	410730942
4	NC_019387	AGG	2	6	301	306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730942
5	NC_019387	C	7	7	329	335	0 %	0 %	0 %	100 %	410730942
6	NC_019387	CTC	2	6	378	383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730942
7	NC_019387	CGC	2	6	398	403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410730942
8	NC_019387	CGC	2	6	419	424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410730942
9	NC_019387	CGG	2	6	426	431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410730942
10	NC_019387	GAG	2	6	447	452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730942
11	NC_019387	GGT	2	6	461	466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730942
12	NC_019387	GGA	3	9	542	550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730942
13	NC_019387	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730943
14	NC_019387	ACC	2	6	715	720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410730943
15	NC_019387	AGG	2	6	745	750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730943
16	NC_019387	AGG	2	6	787	792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730943
17	NC_019387	GGA	2	6	848	853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730943
18	NC_019387	CTC	2	6	909	914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730943
19	NC_019387	CTA	2	6	926	931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410730943
20	NC_019387	GCG	2	6	1004	1009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410730943
21	NC_019387	CTT	2	6	1058	1063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410730943
22	NC_019387	AGG	2	6	1066	1071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730943
23	NC_019387	G	6	6	1105	1110	0 %	0 %	100 %	0 %	410730943
24	NC_019387	GAG	2	6	1116	1121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730943
25	NC_019387	CCA	2	6	1202	1207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410730943
26	NC_019387	CCT	2	6	1238	1243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730943
27	NC_019387	TGG	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730943
28	NC_019387	ACG	2	6	1270	1275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410730943
29	NC_019387	GGCC	2	8	1286	1293	0 %	0 %	50 %	50 %	410730943
30	NC_019387	CAC	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410730943
31	NC_019387	G	6	6	1344	1349	0 %	0 %	100 %	0 %	410730943
32	NC_019387	GGT	2	6	1409	1414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730943
33	NC_019387	CGG	2	6	1463	1468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410730943
34	NC_019387	C	6	6	1503	1508	0 %	0 %	0 %	100 %	410730943
35	NC_019387	CGG	2	6	1573	1578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410730944
36	NC_019387	CGG	2	6	1689	1694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410730944
37	NC_019387	GGT	2	6	1761	1766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730944
38	NC_019387	GGGGC	2	10	1781	1790	0 %	0 %	80 %	20 %	410730944
39	NC_019387	GCCC	2	8	1816	1823	0 %	0 %	25 %	75 %	410730944
40	NC_019387	CAT	2	6	1842	1847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410730944
41	NC_019387	GGT	2	6	1857	1862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730944
42	NC_019387	GTGG	2	8	1872	1879	0 %	25 %	75 %	0 %	410730944
43	NC_019387	CCT	2	6	1920	1925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730944
44	NC_019387	CCCA	2	8	2119	2126	25 %	0 %	0 %	75 %	410730944
45	NC_019387	GCGGCC	2	12	2131	2142	0 %	0 %	50 %	50 %	410730944
46	NC_019387	G	6	6	2160	2165	0 %	0 %	100 %	0 %	410730944
47	NC_019387	TGGAC	2	10	2300	2309	20 %	20 %	40 %	20 %	410730944
48	NC_019387	CCT	2	6	2315	2320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730944
49	NC_019387	TCA	2	6	2441	2446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410730944
50	NC_019387	GGGCG	2	10	2601	2610	0 %	0 %	80 %	20 %	410730945
51	NC_019387	G	6	6	2646	2651	0 %	0 %	100 %	0 %	410730945
52	NC_019387	CTG	2	6	2680	2685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410730945
53	NC_019387	G	7	7	2685	2691	0 %	0 %	100 %	0 %	410730945
54	NC_019387	TGG	2	6	2696	2701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730945
55	NC_019387	GAG	2	6	2747	2752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730945
56	NC_019387	G	6	6	2752	2757	0 %	0 %	100 %	0 %	410730945
57	NC_019387	GGC	2	6	2802	2807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410730945
58	NC_019387	TCC	2	6	2813	2818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730945
59	NC_019387	TGG	2	6	2834	2839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730945
60	NC_019387	CCG	2	6	2843	2848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410730945
61	NC_019387	CCT	2	6	2850	2855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730945
62	NC_019387	AGGGG	2	10	2882	2891	20 %	0 %	80 %	0 %	410730945
63	NC_019387	GTG	2	6	2917	2922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730945
64	NC_019387	CCT	2	6	2924	2929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730945
65	NC_019387	CTT	2	6	2940	2945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410730945
66	NC_019387	CCT	2	6	2993	2998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730946
67	NC_019387	CTC	2	6	3006	3011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730946
68	NC_019387	CTT	2	6	3029	3034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410730946
69	NC_019387	GGC	2	6	3119	3124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410730946
70	NC_019387	CCG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410730946
71	NC_019387	GGA	2	6	3218	3223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730946
72	NC_019387	CCTT	2	8	3252	3259	0 %	50 %	0 %	50 %	410730946
73	NC_019387	CTC	2	6	3309	3314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730946
74	NC_019387	CTGG	2	8	3344	3351	0 %	25 %	50 %	25 %	410730946
75	NC_019387	CTGG	2	8	3380	3387	0 %	25 %	50 %	25 %	410730946
76	NC_019387	GCG	2	6	3406	3411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410730946
77	NC_019387	TGGGC	2	10	3452	3461	0 %	20 %	60 %	20 %	410730946
78	NC_019387	GCC	2	6	3520	3525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410730946
79	NC_019387	G	6	6	3536	3541	0 %	0 %	100 %	0 %	410730946
80	NC_019387	T	6	6	3570	3575	0 %	100 %	0 %	0 %	410730946
81	NC_019387	G	6	6	3616	3621	0 %	0 %	100 %	0 %	410730946
82	NC_019387	GCC	2	6	3645	3650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410730946
83	NC_019387	CTC	2	6	3678	3683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730946
84	NC_019387	GCTCC	2	10	3710	3719	0 %	20 %	20 %	60 %	410730946
85	NC_019387	CCT	2	6	3722	3727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730946
86	NC_019387	GGGC	2	8	3754	3761	0 %	0 %	75 %	25 %	410730946
87	NC_019387	CGC	2	6	3770	3775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410730946
88	NC_019387	AGG	2	6	3817	3822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730946
89	NC_019387	CAA	2	6	3848	3853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410730946
90	NC_019387	CGC	2	6	3854	3859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410730946
91	NC_019387	CTG	2	6	3924	3929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410730946
92	NC_019387	CCCGG	2	10	3957	3966	0 %	0 %	40 %	60 %	410730946
93	NC_019387	CCT	2	6	3985	3990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730946
94	NC_019387	T	6	6	4013	4018	0 %	100 %	0 %	0 %	410730946
95	NC_019387	TGG	2	6	4045	4050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730946
96	NC_019387	AAC	3	9	4152	4160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410730946
97	NC_019387	CCT	2	6	4175	4180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730946
98	NC_019387	GCC	2	6	4182	4187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410730946
99	NC_019387	TCC	2	6	4207	4212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730946
100	NC_019387	GGCGG	2	10	4213	4222	0 %	0 %	80 %	20 %	410730946
101	NC_019387	GGT	2	6	4238	4243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730946
102	NC_019387	AGC	2	6	4273	4278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410730946
103	NC_019387	CTT	2	6	4322	4327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410730946
104	NC_019387	TCC	2	6	4345	4350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410730946
105	NC_019387	TGG	2	6	4375	4380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730946
106	NC_019387	GGA	2	6	4427	4432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730946
107	NC_019387	GGA	2	6	4472	4477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730947
108	NC_019387	GGAAGG	2	12	4514	4525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730947
109	NC_019387	GGC	2	6	4609	4614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410730947
110	NC_019387	C	7	7	4614	4620	0 %	0 %	0 %	100 %	410730947
111	NC_019387	GTG	2	6	4647	4652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730947
112	NC_019387	GAG	2	6	4653	4658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730947
113	NC_019387	GTGG	2	8	4670	4677	0 %	25 %	75 %	0 %	410730947
114	NC_019387	GCC	2	6	4738	4743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410730947
115	NC_019387	CGGG	2	8	4786	4793	0 %	0 %	75 %	25 %	410730947
116	NC_019387	C	6	6	4849	4854	0 %	0 %	0 %	100 %	410730947
117	NC_019387	G	6	6	4962	4967	0 %	0 %	100 %	0 %	410730947
118	NC_019387	GCT	2	6	4979	4984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410730947
119	NC_019387	CGG	2	6	4986	4991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410730947
120	NC_019387	GGA	2	6	5012	5017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730947
121	NC_019387	TGG	2	6	5044	5049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730947
122	NC_019387	GCC	2	6	5097	5102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410730947
123	NC_019387	G	6	6	5160	5165	0 %	0 %	100 %	0 %	410730947
124	NC_019387	GGT	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730947
125	NC_019387	C	6	6	5200	5205	0 %	0 %	0 %	100 %	410730947
126	NC_019387	GAAC	2	8	5232	5239	50 %	0 %	25 %	25 %	410730947
127	NC_019387	C	6	6	5263	5268	0 %	0 %	0 %	100 %	410730947
128	NC_019387	CGG	2	6	5296	5301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410730947
129	NC_019387	TGG	2	6	5317	5322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730947
130	NC_019387	GGA	2	6	5336	5341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730947
131	NC_019387	GGT	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730947
132	NC_019387	AGG	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730947
133	NC_019387	GGA	2	6	5464	5469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410730948
134	NC_019387	TGG	2	6	5475	5480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410730948
135	NC_019387	CCG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410730948
136	NC_019387	CCTTT	2	10	5584	5593	0 %	60 %	0 %	40 %	410730948
137	NC_019387	C	6	6	5730	5735	0 %	0 %	0 %	100 %	410730948
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139	NC_019387	GCC	2	6	5792	5797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410730948
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171	NC_019387	G	6	6	6905	6910	0 %	0 %	100 %	0 %	410730948
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264	NC_019387	G	6	6	10163	10168	0 %	0 %	100 %	0 %	410730951
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266	NC_019387	GACC	2	8	10221	10228	25 %	0 %	25 %	50 %	410730951
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268	NC_019387	G	6	6	10314	10319	0 %	0 %	100 %	0 %	410730951
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