MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermacetogenium phaeum DSM 12270 chromosome

Total Repeats: 52859

< Previous12345678910111213...105106Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_018870	T	6	6	105411	105416	0 %	100 %	0 %	0 %	410666490
2003	NC_018870	CTT	2	6	105485	105490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410666490
2004	NC_018870	GAT	2	6	105537	105542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410666490
2005	NC_018870	GAA	2	6	105562	105567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410666490
2006	NC_018870	TC	3	6	105586	105591	0 %	50 %	0 %	50 %	410666490
2007	NC_018870	CGA	2	6	105638	105643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666490
2008	NC_018870	CGGT	2	8	105703	105710	0 %	25 %	50 %	25 %	410666490
2009	NC_018870	TGT	2	6	105734	105739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410666490
2010	NC_018870	GAA	2	6	105740	105745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410666490
2011	NC_018870	T	7	7	105769	105775	0 %	100 %	0 %	0 %	410666490
2012	NC_018870	AAT	2	6	105823	105828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410666490
2013	NC_018870	TACA	2	8	106181	106188	50 %	25 %	0 %	25 %	410666491
2014	NC_018870	GCA	2	6	106249	106254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666491
2015	NC_018870	TGA	2	6	106290	106295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410666491
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2017	NC_018870	GGT	2	6	106302	106307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410666491
2018	NC_018870	CAG	2	6	106323	106328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666491
2019	NC_018870	GGA	2	6	106387	106392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666492
2020	NC_018870	GGAGA	2	10	106484	106493	40 %	0 %	60 %	0 %	410666492
2021	NC_018870	GAA	2	6	106531	106536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410666492
2022	NC_018870	GCC	2	6	106552	106557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410666492
2023	NC_018870	CGG	2	6	106596	106601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666492
2024	NC_018870	TGG	3	9	106605	106613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410666492
2025	NC_018870	TG	3	6	106635	106640	0 %	50 %	50 %	0 %	410666492
2026	NC_018870	CT	3	6	106644	106649	0 %	50 %	0 %	50 %	410666492
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2030	NC_018870	A	6	6	106748	106753	100 %	0 %	0 %	0 %	410666492
2031	NC_018870	AGGC	2	8	106775	106782	25 %	0 %	50 %	25 %	410666492
2032	NC_018870	AGA	2	6	106822	106827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410666492
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2042	NC_018870	TTA	2	6	107062	107067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410666492
2043	NC_018870	GGA	2	6	107114	107119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410666492
2044	NC_018870	GAA	2	6	107164	107169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410666492
2045	NC_018870	ATT	2	6	107193	107198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410666492
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2048	NC_018870	GCA	2	6	107326	107331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666492
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2050	NC_018870	CAA	2	6	107398	107403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410666492
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2053	NC_018870	TAA	2	6	107590	107595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410666492
2054	NC_018870	TGG	2	6	107640	107645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410666492
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2057	NC_018870	CGAT	2	8	107787	107794	25 %	25 %	25 %	25 %	410666492
2058	NC_018870	GCC	2	6	107797	107802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410666492
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2062	NC_018870	GGC	2	6	107846	107851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666492
2063	NC_018870	AAG	2	6	107885	107890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410666492
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2070	NC_018870	CGG	2	6	108495	108500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666493
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2089	NC_018870	GGC	2	6	109300	109305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666493
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2119	NC_018870	TGC	2	6	111263	111268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666495
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2121	NC_018870	ATTT	2	8	111294	111301	25 %	75 %	0 %	0 %	410666495
2122	NC_018870	T	6	6	111367	111372	0 %	100 %	0 %	0 %	410666495
2123	NC_018870	CTG	2	6	111445	111450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666495
2124	NC_018870	CGG	2	6	111536	111541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666495
2125	NC_018870	CCT	2	6	111605	111610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410666495
2126	NC_018870	CTG	2	6	111622	111627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666495
2127	NC_018870	TCC	2	6	111724	111729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410666495
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2132	NC_018870	GAT	2	6	112014	112019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410666495
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2134	NC_018870	TAG	2	6	112103	112108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410666495
2135	NC_018870	CTG	2	6	112123	112128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666495
2136	NC_018870	GCTC	2	8	112141	112148	0 %	25 %	25 %	50 %	410666495
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2141	NC_018870	CTGT	2	8	112340	112347	0 %	50 %	25 %	25 %	410666496
2142	NC_018870	GAC	2	6	112370	112375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666496
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2152	NC_018870	TTA	2	6	113151	113156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410666497
2153	NC_018870	CAG	2	6	113200	113205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666497
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2155	NC_018870	TCCT	2	8	113385	113392	0 %	50 %	0 %	50 %	410666497
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2230	NC_018870	TCA	2	6	116979	116984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410666500
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2232	NC_018870	GCGAA	2	10	117144	117153	40 %	0 %	40 %	20 %	410666500
2233	NC_018870	TCC	2	6	117154	117159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410666500
2234	NC_018870	GCG	2	6	117206	117211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410666500
2235	NC_018870	GCT	2	6	117286	117291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666500
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2237	NC_018870	CCTG	2	8	117343	117350	0 %	25 %	25 %	50 %	410666500
2238	NC_018870	CCT	2	6	117354	117359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410666500
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2242	NC_018870	GAA	2	6	117578	117583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410666500
2243	NC_018870	GAA	2	6	117676	117681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410666500
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2261	NC_018870	CTG	2	6	118650	118655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410666501
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2264	NC_018870	TGCA	2	8	118798	118805	25 %	25 %	25 %	25 %	410666501
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2355	NC_018870	GAC	2	6	123664	123669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410666504
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2360	NC_018870	TGCA	2	8	123921	123928	25 %	25 %	25 %	25 %	410666505
2361	NC_018870	GAA	2	6	123933	123938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410666505
2362	NC_018870	A	7	7	124009	124015	100 %	0 %	0 %	0 %	410666505
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