MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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20119	NC_018722	AAG	2	6	1045376	1045381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502809
20120	NC_018722	AAC	2	6	1045414	1045419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502809
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20122	NC_018722	CTG	2	6	1045531	1045536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502809
20123	NC_018722	TTG	2	6	1045542	1045547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502809
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20125	NC_018722	AAT	2	6	1046042	1046047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502809
20126	NC_018722	GCAA	2	8	1046054	1046061	50 %	0 %	25 %	25 %	408502809
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20138	NC_018722	ACT	2	6	1046710	1046715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502810
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20144	NC_018722	ATA	2	6	1046968	1046973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502810
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20147	NC_018722	GA	3	6	1047197	1047202	50 %	0 %	50 %	0 %	408502810
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20224	NC_018722	A	8	8	1050666	1050673	100 %	0 %	0 %	0 %	408502813
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20235	NC_018722	CAC	2	6	1051125	1051130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502813
20236	NC_018722	ACG	2	6	1051133	1051138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502813
20237	NC_018722	GC	4	8	1051149	1051156	0 %	0 %	50 %	50 %	408502813
20238	NC_018722	TGCG	2	8	1051166	1051173	0 %	25 %	50 %	25 %	408502813
20239	NC_018722	CATGTT	2	12	1051220	1051231	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408502814
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20250	NC_018722	CAGC	2	8	1051860	1051867	25 %	0 %	25 %	50 %	408502814
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20353	NC_018722	AGA	2	6	1055997	1056002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502816
20354	NC_018722	A	7	7	1056021	1056027	100 %	0 %	0 %	0 %	408502816
20355	NC_018722	ATC	2	6	1056184	1056189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502817
20356	NC_018722	GCTC	2	8	1056207	1056214	0 %	25 %	25 %	50 %	408502817
20357	NC_018722	TCA	2	6	1056242	1056247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502817
20358	NC_018722	TCA	2	6	1056263	1056268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502817
20359	NC_018722	GTAC	2	8	1056301	1056308	25 %	25 %	25 %	25 %	408502817
20360	NC_018722	GGA	2	6	1056411	1056416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502817
20361	NC_018722	CAA	2	6	1056420	1056425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502817
20362	NC_018722	CTTC	2	8	1056519	1056526	0 %	50 %	0 %	50 %	408502817
20363	NC_018722	TCA	2	6	1056626	1056631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502817
20364	NC_018722	GCC	2	6	1056638	1056643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502817
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20366	NC_018722	CAT	2	6	1056673	1056678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502817
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20368	NC_018722	A	6	6	1056720	1056725	100 %	0 %	0 %	0 %	408502817
20369	NC_018722	TTC	2	6	1056771	1056776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502817
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20372	NC_018722	CCG	2	6	1056971	1056976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502818
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20374	NC_018722	CCA	2	6	1056992	1056997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502818
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20377	NC_018722	A	7	7	1057173	1057179	100 %	0 %	0 %	0 %	408502818
20378	NC_018722	AC	3	6	1057223	1057228	50 %	0 %	0 %	50 %	408502818
20379	NC_018722	CCA	2	6	1057229	1057234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502818
20380	NC_018722	CA	3	6	1057264	1057269	50 %	0 %	0 %	50 %	408502818
20381	NC_018722	GCC	2	6	1057274	1057279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502818
20382	NC_018722	GAAA	2	8	1057307	1057314	75 %	0 %	25 %	0 %	408502818
20383	NC_018722	ACCG	2	8	1057390	1057397	25 %	0 %	25 %	50 %	408502818
20384	NC_018722	ACA	2	6	1057448	1057453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502818
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20387	NC_018722	CAC	2	6	1057526	1057531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502818
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20390	NC_018722	CGCAG	2	10	1057611	1057620	20 %	0 %	40 %	40 %	408502818
20391	NC_018722	CAA	2	6	1057652	1057657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502818
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20394	NC_018722	GCCC	2	8	1057743	1057750	0 %	0 %	25 %	75 %	408502818
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20418	NC_018722	C	6	6	1058711	1058716	0 %	0 %	0 %	100 %	408502819
20419	NC_018722	AGG	2	6	1058806	1058811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502819
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20432	NC_018722	TGG	2	6	1059322	1059327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502819
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20450	NC_018722	CTC	2	6	1060506	1060511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502821
20451	NC_018722	CAC	2	6	1060539	1060544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502821
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20454	NC_018722	GC	3	6	1060650	1060655	0 %	0 %	50 %	50 %	408502821
20455	NC_018722	GGTGA	2	10	1060670	1060679	20 %	20 %	60 %	0 %	408502821
20456	NC_018722	AGT	2	6	1060734	1060739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502821
20457	NC_018722	ACC	2	6	1060765	1060770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502821
20458	NC_018722	CG	3	6	1060791	1060796	0 %	0 %	50 %	50 %	408502821
20459	NC_018722	TGCG	2	8	1060860	1060867	0 %	25 %	50 %	25 %	408502821
20460	NC_018722	CA	3	6	1060874	1060879	50 %	0 %	0 %	50 %	408502821
20461	NC_018722	GCAGC	2	10	1060913	1060922	20 %	0 %	40 %	40 %	408502821
20462	NC_018722	CG	3	6	1060960	1060965	0 %	0 %	50 %	50 %	408502821
20463	NC_018722	CTGC	2	8	1060968	1060975	0 %	25 %	25 %	50 %	408502821
20464	NC_018722	GA	4	8	1060991	1060998	50 %	0 %	50 %	0 %	408502821
20465	NC_018722	A	6	6	1061020	1061025	100 %	0 %	0 %	0 %	408502821
20466	NC_018722	CGC	2	6	1061040	1061045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502821
20467	NC_018722	TG	3	6	1061057	1061062	0 %	50 %	50 %	0 %	408502821
20468	NC_018722	GGT	2	6	1061277	1061282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502822
20469	NC_018722	CTCA	2	8	1061284	1061291	25 %	25 %	0 %	50 %	408502822
20470	NC_018722	CTT	2	6	1061392	1061397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502822
20471	NC_018722	CTG	2	6	1061440	1061445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502822
20472	NC_018722	ACCTT	2	10	1061504	1061513	20 %	40 %	0 %	40 %	408502822
20473	NC_018722	AGTCT	2	10	1061515	1061524	20 %	40 %	20 %	20 %	408502822
20474	NC_018722	GTG	2	6	1061533	1061538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502822
20475	NC_018722	CTC	2	6	1061629	1061634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502822
20476	NC_018722	CGTAG	2	10	1061701	1061710	20 %	20 %	40 %	20 %	408502822
20477	NC_018722	CATCT	2	10	1061792	1061801	20 %	40 %	0 %	40 %	408502822
20478	NC_018722	CG	4	8	1061843	1061850	0 %	0 %	50 %	50 %	408502822
20479	NC_018722	GTT	2	6	1061884	1061889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502822
20480	NC_018722	A	6	6	1061892	1061897	100 %	0 %	0 %	0 %	408502822
20481	NC_018722	TGC	2	6	1062021	1062026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502822
20482	NC_018722	CT	3	6	1062058	1062063	0 %	50 %	0 %	50 %	408502822
20483	NC_018722	ATT	2	6	1062165	1062170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502822
20484	NC_018722	CAA	2	6	1062256	1062261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502822
20485	NC_018722	CATG	2	8	1062268	1062275	25 %	25 %	25 %	25 %	408502822
20486	NC_018722	T	6	6	1062286	1062291	0 %	100 %	0 %	0 %	408502822
20487	NC_018722	TCCT	2	8	1062293	1062300	0 %	50 %	0 %	50 %	408502822
20488	NC_018722	GC	3	6	1062310	1062315	0 %	0 %	50 %	50 %	408502822
20489	NC_018722	C	6	6	1062352	1062357	0 %	0 %	0 %	100 %	408502822
20490	NC_018722	CTG	2	6	1062380	1062385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502822
20491	NC_018722	GCA	2	6	1062436	1062441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502822
20492	NC_018722	GGC	2	6	1062444	1062449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502822
20493	NC_018722	TCA	2	6	1062615	1062620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502822
20494	NC_018722	GGGA	2	8	1062633	1062640	25 %	0 %	75 %	0 %	408502822
20495	NC_018722	T	6	6	1062679	1062684	0 %	100 %	0 %	0 %	408502823
20496	NC_018722	GCC	2	6	1062806	1062811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502823
20497	NC_018722	T	6	6	1062849	1062854	0 %	100 %	0 %	0 %	408502823
20498	NC_018722	TGC	2	6	1062985	1062990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502823
20499	NC_018722	GGT	2	6	1063010	1063015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502823
20500	NC_018722	ACC	2	6	1063073	1063078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502823

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