MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_018722	CA	3	6	964774	964779	50 %	0 %	0 %	50 %	408502736
18502	NC_018722	TCC	2	6	964828	964833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502736
18503	NC_018722	GAA	2	6	964836	964841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502736
18504	NC_018722	AAG	2	6	964890	964895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502736
18505	NC_018722	TCG	2	6	964931	964936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502737
18506	NC_018722	ATCA	2	8	965007	965014	50 %	25 %	0 %	25 %	408502737
18507	NC_018722	CA	3	6	965019	965024	50 %	0 %	0 %	50 %	408502737
18508	NC_018722	GCA	2	6	965042	965047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502737
18509	NC_018722	TCCT	2	8	965100	965107	0 %	50 %	0 %	50 %	408502737
18510	NC_018722	CCCT	2	8	965171	965178	0 %	25 %	0 %	75 %	408502737
18511	NC_018722	CAC	2	6	965202	965207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502737
18512	NC_018722	C	6	6	965322	965327	0 %	0 %	0 %	100 %	408502737
18513	NC_018722	GC	3	6	965339	965344	0 %	0 %	50 %	50 %	408502737
18514	NC_018722	T	6	6	965348	965353	0 %	100 %	0 %	0 %	408502737
18515	NC_018722	GCG	2	6	965381	965386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502737
18516	NC_018722	AGAA	2	8	965436	965443	75 %	0 %	25 %	0 %	408502737
18517	NC_018722	CCTA	2	8	965451	965458	25 %	25 %	0 %	50 %	408502737
18518	NC_018722	TGC	2	6	965467	965472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502737
18519	NC_018722	CCT	2	6	965477	965482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502737
18520	NC_018722	TCA	2	6	965483	965488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502737
18521	NC_018722	CATC	2	8	965516	965523	25 %	25 %	0 %	50 %	408502737
18522	NC_018722	TCC	2	6	965584	965589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502737
18523	NC_018722	TGA	2	6	965633	965638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502737
18524	NC_018722	GAGAA	2	10	965688	965697	60 %	0 %	40 %	0 %	408502737
18525	NC_018722	CA	3	6	965710	965715	50 %	0 %	0 %	50 %	408502737
18526	NC_018722	GGA	2	6	965724	965729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502737
18527	NC_018722	CACG	2	8	965762	965769	25 %	0 %	25 %	50 %	408502737
18528	NC_018722	AGG	2	6	965886	965891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502737
18529	NC_018722	GTC	2	6	965937	965942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502737
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18532	NC_018722	C	6	6	965999	966004	0 %	0 %	0 %	100 %	408502737
18533	NC_018722	GTA	2	6	966122	966127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502737
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18537	NC_018722	CTG	2	6	966201	966206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502737
18538	NC_018722	AGA	2	6	966330	966335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502737
18539	NC_018722	CA	3	6	966362	966367	50 %	0 %	0 %	50 %	408502737
18540	NC_018722	GC	3	6	966428	966433	0 %	0 %	50 %	50 %	408502737
18541	NC_018722	CAC	2	6	966464	966469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502737
18542	NC_018722	CCA	2	6	966473	966478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502737
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18544	NC_018722	TAA	2	6	966551	966556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502737
18545	NC_018722	GCA	2	6	966589	966594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502737
18546	NC_018722	CAA	2	6	966644	966649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502737
18547	NC_018722	CGA	2	6	966681	966686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502737
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18549	NC_018722	TGA	2	6	966806	966811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502737
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18553	NC_018722	CGA	3	9	967258	967266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502738
18554	NC_018722	CCA	2	6	967271	967276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502738
18555	NC_018722	GTCA	2	8	967329	967336	25 %	25 %	25 %	25 %	408502738
18556	NC_018722	CTG	2	6	967410	967415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502738
18557	NC_018722	TTCTCC	2	12	967451	967462	0 %	50 %	0 %	50 %	408502738
18558	NC_018722	ACTCGA	2	12	967469	967480	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502739
18559	NC_018722	GA	3	6	967539	967544	50 %	0 %	50 %	0 %	408502739
18560	NC_018722	ACCC	2	8	967572	967579	25 %	0 %	0 %	75 %	408502739
18561	NC_018722	C	6	6	967671	967676	0 %	0 %	0 %	100 %	408502739
18562	NC_018722	CTG	2	6	967680	967685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502739
18563	NC_018722	ACGC	2	8	967715	967722	25 %	0 %	25 %	50 %	408502739
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18567	NC_018722	GCGCA	2	10	967753	967762	20 %	0 %	40 %	40 %	408502739
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18570	NC_018722	ACG	2	6	968005	968010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502739
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18572	NC_018722	AAG	2	6	968075	968080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502739
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18575	NC_018722	TGC	2	6	968229	968234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502739
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18583	NC_018722	ACGC	2	8	968654	968661	25 %	0 %	25 %	50 %	408502740
18584	NC_018722	CGAGA	2	10	968684	968693	40 %	0 %	40 %	20 %	408502740
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18588	NC_018722	GCAC	2	8	968797	968804	25 %	0 %	25 %	50 %	408502740
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18591	NC_018722	GCAC	2	8	968842	968849	25 %	0 %	25 %	50 %	408502740
18592	NC_018722	AGATCA	2	12	968857	968868	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	408502740
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18594	NC_018722	AC	3	6	968954	968959	50 %	0 %	0 %	50 %	408502740
18595	NC_018722	CGC	2	6	968989	968994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502740
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18598	NC_018722	AGTGA	2	10	969066	969075	40 %	20 %	40 %	0 %	408502740
18599	NC_018722	CGCA	2	8	969084	969091	25 %	0 %	25 %	50 %	408502740
18600	NC_018722	CG	3	6	969092	969097	0 %	0 %	50 %	50 %	408502740
18601	NC_018722	TCA	2	6	969203	969208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502740
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18603	NC_018722	T	6	6	969292	969297	0 %	100 %	0 %	0 %	408502740
18604	NC_018722	AGA	2	6	969304	969309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502740
18605	NC_018722	CCG	2	6	969398	969403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502740
18606	NC_018722	ATCC	2	8	969438	969445	25 %	25 %	0 %	50 %	408502741
18607	NC_018722	C	6	6	969613	969618	0 %	0 %	0 %	100 %	408502741
18608	NC_018722	AG	3	6	969640	969645	50 %	0 %	50 %	0 %	408502741
18609	NC_018722	ATA	2	6	969683	969688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502741
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18611	NC_018722	CCT	2	6	969809	969814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502742
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18615	NC_018722	CCG	2	6	970067	970072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502742
18616	NC_018722	GCTC	2	8	970120	970127	0 %	25 %	25 %	50 %	408502742
18617	NC_018722	TCC	2	6	970132	970137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502742
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18620	NC_018722	CGA	2	6	970293	970298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502742
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18622	NC_018722	TAA	3	9	970385	970393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502742
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18627	NC_018722	ACGT	2	8	970672	970679	25 %	25 %	25 %	25 %	408502742
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18988	NC_018722	TC	3	6	988392	988397	0 %	50 %	0 %	50 %	408502753
18989	NC_018722	TAC	2	6	988444	988449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502753
18990	NC_018722	CTGCA	2	10	988510	988519	20 %	20 %	20 %	40 %	408502754
18991	NC_018722	CTC	2	6	988578	988583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502754
18992	NC_018722	GT	3	6	988665	988670	0 %	50 %	50 %	0 %	408502754
18993	NC_018722	GGA	2	6	988678	988683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502754
18994	NC_018722	A	6	6	988711	988716	100 %	0 %	0 %	0 %	408502754
18995	NC_018722	AAG	2	6	988726	988731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502754
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18997	NC_018722	CG	4	8	988761	988768	0 %	0 %	50 %	50 %	408502755
18998	NC_018722	GA	3	6	988773	988778	50 %	0 %	50 %	0 %	408502755
18999	NC_018722	GAA	2	6	988792	988797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502755
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