MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_018722	AGCA	2	8	939881	939888	50 %	0 %	25 %	25 %	408502712
18003	NC_018722	GGT	2	6	939898	939903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502712
18004	NC_018722	AGC	2	6	939950	939955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502712
18005	NC_018722	CG	3	6	940100	940105	0 %	0 %	50 %	50 %	408502712
18006	NC_018722	ACG	2	6	940109	940114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502712
18007	NC_018722	TCC	2	6	940298	940303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502712
18008	NC_018722	GAA	2	6	940334	940339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502712
18009	NC_018722	GCT	2	6	940380	940385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502712
18010	NC_018722	AAC	2	6	940456	940461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502712
18011	NC_018722	CGT	2	6	940488	940493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502712
18012	NC_018722	TCCT	2	8	940531	940538	0 %	50 %	0 %	50 %	408502712
18013	NC_018722	A	6	6	940547	940552	100 %	0 %	0 %	0 %	408502712
18014	NC_018722	GCGCAA	2	12	940566	940577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502712
18015	NC_018722	GCA	2	6	940643	940648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502712
18016	NC_018722	T	7	7	940717	940723	0 %	100 %	0 %	0 %	408502712
18017	NC_018722	AGG	2	6	940733	940738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502712
18018	NC_018722	TGAA	2	8	940798	940805	50 %	25 %	25 %	0 %	408502712
18019	NC_018722	A	7	7	940804	940810	100 %	0 %	0 %	0 %	408502712
18020	NC_018722	CAA	2	6	940854	940859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502712
18021	NC_018722	GC	3	6	940989	940994	0 %	0 %	50 %	50 %	408502712
18022	NC_018722	GAC	2	6	941091	941096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502712
18023	NC_018722	CAAG	2	8	941106	941113	50 %	0 %	25 %	25 %	408502712
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18025	NC_018722	CA	3	6	941154	941159	50 %	0 %	0 %	50 %	408502712
18026	NC_018722	GAA	2	6	941506	941511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502713
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18030	NC_018722	CTT	2	6	941751	941756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502713
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18032	NC_018722	TTC	2	6	941794	941799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502713
18033	NC_018722	ACGC	2	8	941828	941835	25 %	0 %	25 %	50 %	408502713
18034	NC_018722	ACTG	2	8	941883	941890	25 %	25 %	25 %	25 %	408502713
18035	NC_018722	TCT	2	6	941891	941896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502713
18036	NC_018722	CTT	2	6	941988	941993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502713
18037	NC_018722	GCG	2	6	941999	942004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502713
18038	NC_018722	TCT	2	6	942005	942010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502713
18039	NC_018722	GCTCCT	2	12	942014	942025	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408502713
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18044	NC_018722	CTT	2	6	942173	942178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502713
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18051	NC_018722	CCT	2	6	942556	942561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502714
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18053	NC_018722	AAC	2	6	942935	942940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502714
18054	NC_018722	ACC	2	6	942952	942957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502714
18055	NC_018722	CG	3	6	942983	942988	0 %	0 %	50 %	50 %	408502714
18056	NC_018722	CAC	2	6	943029	943034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502714
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18059	NC_018722	TGCG	2	8	943154	943161	0 %	25 %	50 %	25 %	408502714
18060	NC_018722	CTT	2	6	943171	943176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502714
18061	NC_018722	AGA	2	6	943327	943332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502714
18062	NC_018722	TC	3	6	943344	943349	0 %	50 %	0 %	50 %	408502714
18063	NC_018722	CTG	2	6	943360	943365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502714
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18069	NC_018722	TGC	2	6	943521	943526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502714
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18081	NC_018722	GACT	2	8	944132	944139	25 %	25 %	25 %	25 %	408502715
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18086	NC_018722	TACG	2	8	944366	944373	25 %	25 %	25 %	25 %	408502715
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18089	NC_018722	CCT	2	6	944462	944467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502715
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18094	NC_018722	CGC	2	6	944613	944618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502715
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18097	NC_018722	GC	3	6	944700	944705	0 %	0 %	50 %	50 %	408502715
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18101	NC_018722	C	6	6	944748	944753	0 %	0 %	0 %	100 %	408502715
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18106	NC_018722	ACT	2	6	945048	945053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502715
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18108	NC_018722	AC	3	6	945090	945095	50 %	0 %	0 %	50 %	408502715
18109	NC_018722	GGC	2	6	945223	945228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502715
18110	NC_018722	CAG	2	6	945237	945242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502715
18111	NC_018722	AC	3	6	945289	945294	50 %	0 %	0 %	50 %	408502715
18112	NC_018722	GAA	2	6	945347	945352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502716
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18116	NC_018722	A	6	6	945561	945566	100 %	0 %	0 %	0 %	408502716
18117	NC_018722	GCAGGA	2	12	945734	945745	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	408502716
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18122	NC_018722	CAC	3	9	946041	946049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502716
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