MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_018722	CTG	2	6	914982	914987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502692
17502	NC_018722	GC	3	6	915013	915018	0 %	0 %	50 %	50 %	408502692
17503	NC_018722	C	6	6	915149	915154	0 %	0 %	0 %	100 %	408502693
17504	NC_018722	CCTC	2	8	915213	915220	0 %	25 %	0 %	75 %	408502693
17505	NC_018722	CACG	2	8	915249	915256	25 %	0 %	25 %	50 %	408502693
17506	NC_018722	ACT	2	6	915284	915289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502693
17507	NC_018722	CCG	2	6	915294	915299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502693
17508	NC_018722	CAC	2	6	915354	915359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502693
17509	NC_018722	AGT	2	6	915438	915443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502693
17510	NC_018722	T	6	6	915453	915458	0 %	100 %	0 %	0 %	408502693
17511	NC_018722	CAC	2	6	915498	915503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502693
17512	NC_018722	CTG	2	6	915522	915527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502693
17513	NC_018722	GC	3	6	915543	915548	0 %	0 %	50 %	50 %	408502693
17514	NC_018722	CTT	2	6	915582	915587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502693
17515	NC_018722	C	6	6	915626	915631	0 %	0 %	0 %	100 %	408502693
17516	NC_018722	CCG	2	6	915660	915665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502693
17517	NC_018722	CCA	2	6	915726	915731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502693
17518	NC_018722	ACC	2	6	915744	915749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502693
17519	NC_018722	ATT	2	6	915799	915804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502693
17520	NC_018722	GAG	2	6	915845	915850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502693
17521	NC_018722	TTG	2	6	915956	915961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502693
17522	NC_018722	CAC	2	6	916149	916154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502693
17523	NC_018722	TCT	2	6	916260	916265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502693
17524	NC_018722	ACC	2	6	916336	916341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502693
17525	NC_018722	GAAA	2	8	916374	916381	75 %	0 %	25 %	0 %	408502693
17526	NC_018722	CCA	2	6	916431	916436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502693
17527	NC_018722	ACT	2	6	916448	916453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502693
17528	NC_018722	GCA	2	6	916458	916463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502693
17529	NC_018722	C	6	6	916552	916557	0 %	0 %	0 %	100 %	408502693
17530	NC_018722	GGCA	2	8	917003	917010	25 %	0 %	50 %	25 %	408502694
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17532	NC_018722	A	6	6	917113	917118	100 %	0 %	0 %	0 %	408502694
17533	NC_018722	CTC	2	6	917163	917168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502694
17534	NC_018722	TGC	2	6	917229	917234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502694
17535	NC_018722	GC	3	6	917260	917265	0 %	0 %	50 %	50 %	408502694
17536	NC_018722	CG	3	6	917267	917272	0 %	0 %	50 %	50 %	408502694
17537	NC_018722	CGGCA	2	10	917276	917285	20 %	0 %	40 %	40 %	408502694
17538	NC_018722	TTGA	2	8	917479	917486	25 %	50 %	25 %	0 %	408502694
17539	NC_018722	AGC	2	6	917493	917498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502694
17540	NC_018722	CAGG	2	8	917521	917528	25 %	0 %	50 %	25 %	408502694
17541	NC_018722	ACC	2	6	917532	917537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502694
17542	NC_018722	GC	3	6	917625	917630	0 %	0 %	50 %	50 %	408502694
17543	NC_018722	TCT	2	6	917831	917836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502695
17544	NC_018722	GC	6	12	917936	917947	0 %	0 %	50 %	50 %	408502695
17545	NC_018722	A	7	7	918030	918036	100 %	0 %	0 %	0 %	408502695
17546	NC_018722	TTC	2	6	918060	918065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502695
17547	NC_018722	CG	3	6	918219	918224	0 %	0 %	50 %	50 %	408502695
17548	NC_018722	CCA	2	6	918272	918277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502695
17549	NC_018722	CG	3	6	918352	918357	0 %	0 %	50 %	50 %	408502695
17550	NC_018722	AGG	2	6	918361	918366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502695
17551	NC_018722	CG	3	6	918375	918380	0 %	0 %	50 %	50 %	408502695
17552	NC_018722	AG	3	6	918393	918398	50 %	0 %	50 %	0 %	408502695
17553	NC_018722	GC	3	6	918430	918435	0 %	0 %	50 %	50 %	408502695
17554	NC_018722	CG	3	6	918437	918442	0 %	0 %	50 %	50 %	408502695
17555	NC_018722	CTT	2	6	918504	918509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502695
17556	NC_018722	AC	3	6	918551	918556	50 %	0 %	0 %	50 %	408502695
17557	NC_018722	TAA	2	6	918568	918573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502695
17558	NC_018722	CAAT	2	8	918741	918748	50 %	25 %	0 %	25 %	408502696
17559	NC_018722	GGC	2	6	918823	918828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502696
17560	NC_018722	GC	3	6	918851	918856	0 %	0 %	50 %	50 %	408502696
17561	NC_018722	GGGC	2	8	918943	918950	0 %	0 %	75 %	25 %	408502696
17562	NC_018722	GT	3	6	918961	918966	0 %	50 %	50 %	0 %	408502696
17563	NC_018722	GGT	2	6	919021	919026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502696
17564	NC_018722	TCA	3	9	919095	919103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502696
17565	NC_018722	CTG	2	6	919182	919187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502696
17566	NC_018722	GTC	2	6	919196	919201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502696
17567	NC_018722	TGA	2	6	919284	919289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502696
17568	NC_018722	CGCAA	2	10	919309	919318	40 %	0 %	20 %	40 %	408502696
17569	NC_018722	A	6	6	919317	919322	100 %	0 %	0 %	0 %	408502696
17570	NC_018722	CCA	2	6	919389	919394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502696
17571	NC_018722	TGC	2	6	919422	919427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502696
17572	NC_018722	GTG	2	6	919487	919492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502696
17573	NC_018722	AAG	2	6	919550	919555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502696
17574	NC_018722	CGA	2	6	919594	919599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502696
17575	NC_018722	CTC	2	6	919636	919641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502696
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17579	NC_018722	GTG	2	6	919745	919750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502696
17580	NC_018722	AGA	2	6	919782	919787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502696
17581	NC_018722	CGG	2	6	919842	919847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502697
17582	NC_018722	CTC	2	6	919889	919894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502697
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17585	NC_018722	GTT	2	6	919998	920003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502697
17586	NC_018722	TCGC	2	8	920057	920064	0 %	25 %	25 %	50 %	408502697
17587	NC_018722	TCC	2	6	920073	920078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502697
17588	NC_018722	GC	3	6	920114	920119	0 %	0 %	50 %	50 %	408502697
17589	NC_018722	GAC	2	6	920156	920161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502697
17590	NC_018722	GAT	2	6	920186	920191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502697
17591	NC_018722	CA	3	6	920288	920293	50 %	0 %	0 %	50 %	408502697
17592	NC_018722	GC	3	6	920300	920305	0 %	0 %	50 %	50 %	408502697
17593	NC_018722	CG	4	8	920332	920339	0 %	0 %	50 %	50 %	408502697
17594	NC_018722	CCAC	2	8	920356	920363	25 %	0 %	0 %	75 %	408502697
17595	NC_018722	AAG	2	6	920393	920398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502697
17596	NC_018722	CA	3	6	920422	920427	50 %	0 %	0 %	50 %	408502697
17597	NC_018722	CCA	2	6	920438	920443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502698
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17599	NC_018722	CTCTT	2	10	920524	920533	0 %	60 %	0 %	40 %	408502698
17600	NC_018722	TCT	2	6	920603	920608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502698
17601	NC_018722	ACC	2	6	920620	920625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502698
17602	NC_018722	ACA	2	6	920642	920647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502698
17603	NC_018722	GAG	2	6	920659	920664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502698
17604	NC_018722	TGGA	2	8	920677	920684	25 %	25 %	50 %	0 %	408502698
17605	NC_018722	A	6	6	920737	920742	100 %	0 %	0 %	0 %	408502699
17606	NC_018722	TTC	2	6	920768	920773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502699
17607	NC_018722	CGC	2	6	920810	920815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502699
17608	NC_018722	GGT	2	6	920863	920868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502699
17609	NC_018722	TTCC	2	8	920884	920891	0 %	50 %	0 %	50 %	408502699
17610	NC_018722	ATC	2	6	920906	920911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502699
17611	NC_018722	GCT	2	6	920929	920934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502699
17612	NC_018722	CTTC	2	8	920992	920999	0 %	50 %	0 %	50 %	408502699
17613	NC_018722	TCC	2	6	921036	921041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502699
17614	NC_018722	C	6	6	921077	921082	0 %	0 %	0 %	100 %	408502700
17615	NC_018722	GA	3	6	921146	921151	50 %	0 %	50 %	0 %	408502700
17616	NC_018722	CGC	2	6	921328	921333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502700
17617	NC_018722	TAC	2	6	921411	921416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502700
17618	NC_018722	CAC	2	6	921492	921497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502701
17619	NC_018722	TTACC	2	10	921599	921608	20 %	40 %	0 %	40 %	408502701
17620	NC_018722	TGC	3	9	921633	921641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502701
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17622	NC_018722	GACC	2	8	921755	921762	25 %	0 %	25 %	50 %	408502702
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17987	NC_018722	TCGTAT	2	12	938891	938902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	408502711
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17989	NC_018722	GCA	2	6	939079	939084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502711
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17991	NC_018722	GCCGC	2	10	939178	939187	0 %	0 %	40 %	60 %	408502711
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