MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

< Previous12...32333435363738394041424344Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_018722	AGA	2	6	888132	888137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502669
17003	NC_018722	AC	3	6	888156	888161	50 %	0 %	0 %	50 %	408502669
17004	NC_018722	ACC	2	6	888246	888251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502669
17005	NC_018722	TCA	2	6	888253	888258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502669
17006	NC_018722	CGG	2	6	888281	888286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502669
17007	NC_018722	TAT	2	6	888392	888397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502669
17008	NC_018722	C	6	6	888408	888413	0 %	0 %	0 %	100 %	408502669
17009	NC_018722	CAC	2	6	888458	888463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502669
17010	NC_018722	AG	3	6	888476	888481	50 %	0 %	50 %	0 %	408502669
17011	NC_018722	GCA	3	9	888499	888507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502669
17012	NC_018722	AGCAT	2	10	888532	888541	40 %	20 %	20 %	20 %	408502669
17013	NC_018722	ATCT	2	8	888594	888601	25 %	50 %	0 %	25 %	408502669
17014	NC_018722	AC	3	6	888757	888762	50 %	0 %	0 %	50 %	408502669
17015	NC_018722	GAT	2	6	888828	888833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502669
17016	NC_018722	CG	3	6	888836	888841	0 %	0 %	50 %	50 %	408502669
17017	NC_018722	ATGC	2	8	888847	888854	25 %	25 %	25 %	25 %	408502669
17018	NC_018722	TCAC	2	8	888859	888866	25 %	25 %	0 %	50 %	408502669
17019	NC_018722	CCT	2	6	888873	888878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502670
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17021	NC_018722	CT	4	8	888928	888935	0 %	50 %	0 %	50 %	408502670
17022	NC_018722	CGC	2	6	888948	888953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502670
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17025	NC_018722	CTGC	2	8	889209	889216	0 %	25 %	25 %	50 %	408502671
17026	NC_018722	CTG	2	6	889239	889244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502671
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17028	NC_018722	ACTGC	2	10	889416	889425	20 %	20 %	20 %	40 %	408502671
17029	NC_018722	CG	4	8	889483	889490	0 %	0 %	50 %	50 %	408502671
17030	NC_018722	AAT	2	6	889624	889629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502671
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17032	NC_018722	GGA	2	6	889691	889696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502671
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17035	NC_018722	TGA	2	6	889788	889793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502671
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17045	NC_018722	CG	3	6	890253	890258	0 %	0 %	50 %	50 %	408502672
17046	NC_018722	A	6	6	890314	890319	100 %	0 %	0 %	0 %	408502672
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17051	NC_018722	GCT	2	6	890588	890593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502672
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17053	NC_018722	CCT	2	6	890699	890704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502672
17054	NC_018722	ACGCG	2	10	890751	890760	20 %	0 %	40 %	40 %	408502672
17055	NC_018722	TACG	2	8	890914	890921	25 %	25 %	25 %	25 %	408502673
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17057	NC_018722	CG	3	6	890960	890965	0 %	0 %	50 %	50 %	408502673
17058	NC_018722	ACC	2	6	890989	890994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502673
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17089	NC_018722	GC	3	6	892579	892584	0 %	0 %	50 %	50 %	408502674
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17111	NC_018722	TCG	2	6	894177	894182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502676
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17153	NC_018722	GC	3	6	896591	896596	0 %	0 %	50 %	50 %	408502679
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17233	NC_018722	CGC	2	6	900360	900365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502683
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17235	NC_018722	GCAC	2	8	900506	900513	25 %	0 %	25 %	50 %	408502683
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17241	NC_018722	AC	3	6	900932	900937	50 %	0 %	0 %	50 %	408502683
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17243	NC_018722	CA	3	6	900993	900998	50 %	0 %	0 %	50 %	408502683
17244	NC_018722	TCT	2	6	901007	901012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502683
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17250	NC_018722	GAAC	2	8	901253	901260	50 %	0 %	25 %	25 %	408502684
17251	NC_018722	TCAA	2	8	901323	901330	50 %	25 %	0 %	25 %	408502684
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17343	NC_018722	CACG	2	8	906119	906126	25 %	0 %	25 %	50 %	408502687
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17361	NC_018722	GAG	2	6	906953	906958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502687
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17487	NC_018722	ACT	2	6	914421	914426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502692
17488	NC_018722	GGC	2	6	914435	914440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502692
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17490	NC_018722	TCG	2	6	914518	914523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502692
17491	NC_018722	GCAC	2	8	914544	914551	25 %	0 %	25 %	50 %	408502692
17492	NC_018722	AC	3	6	914550	914555	50 %	0 %	0 %	50 %	408502692
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