MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_018722	ACC	2	6	860315	860320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502646
16503	NC_018722	GGC	2	6	860356	860361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502646
16504	NC_018722	AGA	2	6	860380	860385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502646
16505	NC_018722	TC	3	6	860409	860414	0 %	50 %	0 %	50 %	408502646
16506	NC_018722	GCCA	2	8	860441	860448	25 %	0 %	25 %	50 %	408502646
16507	NC_018722	CG	3	6	860488	860493	0 %	0 %	50 %	50 %	408502646
16508	NC_018722	TAA	2	6	860698	860703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502646
16509	NC_018722	GC	3	6	860707	860712	0 %	0 %	50 %	50 %	408502646
16510	NC_018722	AGC	2	6	860785	860790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502646
16511	NC_018722	A	6	6	861032	861037	100 %	0 %	0 %	0 %	408502647
16512	NC_018722	CTC	2	6	861191	861196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502647
16513	NC_018722	TAT	2	6	861203	861208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502647
16514	NC_018722	GCTC	2	8	861259	861266	0 %	25 %	25 %	50 %	408502647
16515	NC_018722	AGA	2	6	861267	861272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502647
16516	NC_018722	ATT	2	6	861293	861298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502647
16517	NC_018722	T	6	6	861301	861306	0 %	100 %	0 %	0 %	408502647
16518	NC_018722	CGC	3	9	861307	861315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502647
16519	NC_018722	TC	3	6	861386	861391	0 %	50 %	0 %	50 %	408502647
16520	NC_018722	GCT	2	6	861445	861450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502647
16521	NC_018722	GA	3	6	861456	861461	50 %	0 %	50 %	0 %	408502647
16522	NC_018722	CAT	2	6	861484	861489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502647
16523	NC_018722	TCT	2	6	861515	861520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502647
16524	NC_018722	CA	3	6	861543	861548	50 %	0 %	0 %	50 %	408502647
16525	NC_018722	CG	3	6	861549	861554	0 %	0 %	50 %	50 %	408502647
16526	NC_018722	GAT	2	6	861725	861730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502647
16527	NC_018722	CAG	2	6	861760	861765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502647
16528	NC_018722	TTCA	2	8	861795	861802	25 %	50 %	0 %	25 %	408502647
16529	NC_018722	TAC	2	6	861881	861886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502647
16530	NC_018722	GTG	2	6	861894	861899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502647
16531	NC_018722	GC	3	6	861935	861940	0 %	0 %	50 %	50 %	408502647
16532	NC_018722	CAT	3	9	861959	861967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502647
16533	NC_018722	A	6	6	861977	861982	100 %	0 %	0 %	0 %	408502647
16534	NC_018722	TCT	2	6	862004	862009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502647
16535	NC_018722	GC	3	6	862019	862024	0 %	0 %	50 %	50 %	408502647
16536	NC_018722	CGG	2	6	862029	862034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502647
16537	NC_018722	AAGA	2	8	862061	862068	75 %	0 %	25 %	0 %	408502647
16538	NC_018722	CTTC	2	8	862079	862086	0 %	50 %	0 %	50 %	408502647
16539	NC_018722	A	6	6	862100	862105	100 %	0 %	0 %	0 %	408502647
16540	NC_018722	CACAA	2	10	862163	862172	60 %	0 %	0 %	40 %	408502647
16541	NC_018722	AC	3	6	862214	862219	50 %	0 %	0 %	50 %	408502647
16542	NC_018722	AGG	2	6	862266	862271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502647
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16544	NC_018722	TTC	2	6	862379	862384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502647
16545	NC_018722	CG	4	8	862451	862458	0 %	0 %	50 %	50 %	408502647
16546	NC_018722	AGA	2	6	862471	862476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502647
16547	NC_018722	CAG	2	6	862547	862552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502647
16548	NC_018722	ATC	2	6	862592	862597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502647
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16550	NC_018722	CA	3	6	862798	862803	50 %	0 %	0 %	50 %	408502648
16551	NC_018722	GT	3	6	862859	862864	0 %	50 %	50 %	0 %	408502648
16552	NC_018722	TG	3	6	862867	862872	0 %	50 %	50 %	0 %	408502648
16553	NC_018722	GC	4	8	862881	862888	0 %	0 %	50 %	50 %	408502648
16554	NC_018722	T	6	6	862989	862994	0 %	100 %	0 %	0 %	408502648
16555	NC_018722	CCT	2	6	863061	863066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502648
16556	NC_018722	GGC	2	6	863071	863076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502648
16557	NC_018722	GAT	2	6	863099	863104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502648
16558	NC_018722	A	7	7	863171	863177	100 %	0 %	0 %	0 %	408502648
16559	NC_018722	TGC	2	6	863277	863282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502648
16560	NC_018722	GCA	2	6	863397	863402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502648
16561	NC_018722	GC	3	6	863419	863424	0 %	0 %	50 %	50 %	408502648
16562	NC_018722	G	6	6	863431	863436	0 %	0 %	100 %	0 %	408502648
16563	NC_018722	TGA	3	9	863562	863570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502648
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16565	NC_018722	CTCA	2	8	863819	863826	25 %	25 %	0 %	50 %	408502648
16566	NC_018722	A	6	6	863840	863845	100 %	0 %	0 %	0 %	408502648
16567	NC_018722	GCGCT	2	10	863930	863939	0 %	20 %	40 %	40 %	408502649
16568	NC_018722	CGCA	2	8	863978	863985	25 %	0 %	25 %	50 %	408502649
16569	NC_018722	CA	4	8	863991	863998	50 %	0 %	0 %	50 %	408502649
16570	NC_018722	ATG	2	6	864001	864006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502649
16571	NC_018722	T	6	6	864024	864029	0 %	100 %	0 %	0 %	408502649
16572	NC_018722	AC	3	6	864030	864035	50 %	0 %	0 %	50 %	408502649
16573	NC_018722	CACG	2	8	864087	864094	25 %	0 %	25 %	50 %	408502650
16574	NC_018722	GC	3	6	864116	864121	0 %	0 %	50 %	50 %	408502650
16575	NC_018722	GCATCT	2	12	864224	864235	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408502650
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16577	NC_018722	GAT	2	6	864304	864309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502650
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16582	NC_018722	TTCCA	2	10	864440	864449	20 %	40 %	0 %	40 %	408502650
16583	NC_018722	GCT	2	6	864461	864466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502650
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16587	NC_018722	GC	3	6	864662	864667	0 %	0 %	50 %	50 %	408502650
16588	NC_018722	CCT	2	6	864702	864707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502650
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16593	NC_018722	GCA	2	6	864890	864895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502650
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16595	NC_018722	TGT	3	9	864935	864943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502650
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16598	NC_018722	CAG	3	9	864981	864989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502650
16599	NC_018722	CG	3	6	865059	865064	0 %	0 %	50 %	50 %	408502650
16600	NC_018722	CA	3	6	865089	865094	50 %	0 %	0 %	50 %	408502650
16601	NC_018722	GAA	2	6	865207	865212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502651
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16603	NC_018722	CTC	2	6	865260	865265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502651
16604	NC_018722	TG	3	6	865376	865381	0 %	50 %	50 %	0 %	408502651
16605	NC_018722	CG	3	6	865403	865408	0 %	0 %	50 %	50 %	408502651
16606	NC_018722	AGCG	2	8	865434	865441	25 %	0 %	50 %	25 %	408502651
16607	NC_018722	CCA	2	6	865514	865519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502651
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16609	NC_018722	GTG	2	6	865572	865577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502651
16610	NC_018722	GC	3	6	865587	865592	0 %	0 %	50 %	50 %	408502651
16611	NC_018722	C	6	6	865607	865612	0 %	0 %	0 %	100 %	408502651
16612	NC_018722	TGA	2	6	865663	865668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502651
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16616	NC_018722	A	8	8	866155	866162	100 %	0 %	0 %	0 %	408502652
16617	NC_018722	CGG	2	6	866204	866209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502652
16618	NC_018722	CAATT	2	10	866261	866270	40 %	40 %	0 %	20 %	408502652
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16991	NC_018722	CA	3	6	887321	887326	50 %	0 %	0 %	50 %	408502668
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