MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16122	NC_018722	CGT	2	6	841383	841388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502626
16123	NC_018722	GAC	2	6	841396	841401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502626
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16126	NC_018722	TCA	2	6	841514	841519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502626
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16230	NC_018722	CGTG	2	8	847069	847076	0 %	25 %	50 %	25 %	408502633
16231	NC_018722	A	6	6	847083	847088	100 %	0 %	0 %	0 %	408502633
16232	NC_018722	ACGCG	2	10	847096	847105	20 %	0 %	40 %	40 %	408502633
16233	NC_018722	T	7	7	847106	847112	0 %	100 %	0 %	0 %	408502633
16234	NC_018722	CG	3	6	847123	847128	0 %	0 %	50 %	50 %	408502633
16235	NC_018722	GGA	2	6	847136	847141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502633
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16239	NC_018722	TCA	2	6	847392	847397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502633
16240	NC_018722	CTC	2	6	847411	847416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502633
16241	NC_018722	ACG	2	6	847431	847436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502633
16242	NC_018722	TCC	2	6	847487	847492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502633
16243	NC_018722	ATT	2	6	847568	847573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502633
16244	NC_018722	TCA	2	6	847608	847613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502633
16245	NC_018722	GT	3	6	847644	847649	0 %	50 %	50 %	0 %	408502634
16246	NC_018722	CGG	2	6	847681	847686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502634
16247	NC_018722	CAC	2	6	847728	847733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502634
16248	NC_018722	TAC	2	6	847802	847807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502634
16249	NC_018722	CGT	2	6	847823	847828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502634
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16251	NC_018722	AGC	2	6	847995	848000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502634
16252	NC_018722	ACGCA	2	10	848004	848013	40 %	0 %	20 %	40 %	408502634
16253	NC_018722	TTA	2	6	848057	848062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502634
16254	NC_018722	A	6	6	848237	848242	100 %	0 %	0 %	0 %	408502634
16255	NC_018722	CAC	2	6	848250	848255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502634
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16258	NC_018722	CA	3	6	848422	848427	50 %	0 %	0 %	50 %	408502635
16259	NC_018722	CTG	2	6	848440	848445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502635
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16261	NC_018722	GC	3	6	848490	848495	0 %	0 %	50 %	50 %	408502635
16262	NC_018722	A	7	7	848578	848584	100 %	0 %	0 %	0 %	408502635
16263	NC_018722	ATC	2	6	848635	848640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502635
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16267	NC_018722	CA	4	8	848739	848746	50 %	0 %	0 %	50 %	408502635
16268	NC_018722	CAC	2	6	848788	848793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502635
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16270	NC_018722	CG	3	6	848943	848948	0 %	0 %	50 %	50 %	408502635
16271	NC_018722	CTG	2	6	848977	848982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502635
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16274	NC_018722	GA	3	6	849149	849154	50 %	0 %	50 %	0 %	408502635
16275	NC_018722	CG	5	10	849163	849172	0 %	0 %	50 %	50 %	408502635
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16280	NC_018722	CGC	2	6	849416	849421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502635
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16282	NC_018722	ACG	3	9	849514	849522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502635
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16284	NC_018722	CA	3	6	849628	849633	50 %	0 %	0 %	50 %	408502635
16285	NC_018722	C	6	6	849690	849695	0 %	0 %	0 %	100 %	408502635
16286	NC_018722	TACG	2	8	849706	849713	25 %	25 %	25 %	25 %	408502635
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16303	NC_018722	CGTT	2	8	850405	850412	0 %	50 %	25 %	25 %	408502636
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16305	NC_018722	GACA	2	8	850535	850542	50 %	0 %	25 %	25 %	408502636
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16312	NC_018722	ATCA	2	8	850885	850892	50 %	25 %	0 %	25 %	408502636
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16315	NC_018722	CTG	2	6	851191	851196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502636
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16320	NC_018722	T	8	8	851414	851421	0 %	100 %	0 %	0 %	408502637
16321	NC_018722	CG	3	6	851480	851485	0 %	0 %	50 %	50 %	408502637
16322	NC_018722	GCT	2	6	851509	851514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502637
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16325	NC_018722	ACCCCT	2	12	851622	851633	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	408502637
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16328	NC_018722	CA	3	6	851782	851787	50 %	0 %	0 %	50 %	408502637
16329	NC_018722	CGCA	2	8	851788	851795	25 %	0 %	25 %	50 %	408502637
16330	NC_018722	AG	4	8	851813	851820	50 %	0 %	50 %	0 %	408502637
16331	NC_018722	CCCG	2	8	851849	851856	0 %	0 %	25 %	75 %	408502637
16332	NC_018722	GCA	2	6	851934	851939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502637
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16334	NC_018722	CG	4	8	851995	852002	0 %	0 %	50 %	50 %	408502637
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16341	NC_018722	GCT	2	6	852378	852383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502637
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16347	NC_018722	CAG	2	6	852715	852720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502638
16348	NC_018722	AC	3	6	852759	852764	50 %	0 %	0 %	50 %	408502638
16349	NC_018722	ACA	2	6	852801	852806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502638
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16351	NC_018722	ACG	2	6	852900	852905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502638
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16356	NC_018722	GCAC	2	8	853145	853152	25 %	0 %	25 %	50 %	408502638
16357	NC_018722	CG	3	6	853217	853222	0 %	0 %	50 %	50 %	408502638
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16361	NC_018722	CG	3	6	853356	853361	0 %	0 %	50 %	50 %	408502639
16362	NC_018722	T	6	6	853375	853380	0 %	100 %	0 %	0 %	408502639
16363	NC_018722	CG	3	6	853440	853445	0 %	0 %	50 %	50 %	408502639
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16367	NC_018722	TAC	2	6	853602	853607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502639
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16487	NC_018722	ACG	2	6	859415	859420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502644
16488	NC_018722	ATT	3	9	859531	859539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502644
16489	NC_018722	AGCGT	2	10	859545	859554	20 %	20 %	40 %	20 %	408502644
16490	NC_018722	A	6	6	859570	859575	100 %	0 %	0 %	0 %	408502644
16491	NC_018722	GC	3	6	859584	859589	0 %	0 %	50 %	50 %	408502644
16492	NC_018722	CAA	2	6	859599	859604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502644
16493	NC_018722	CACG	2	8	859844	859851	25 %	0 %	25 %	50 %	408502645
16494	NC_018722	CTG	2	6	859870	859875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502645
16495	NC_018722	GGC	2	6	860027	860032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502645
16496	NC_018722	ATC	2	6	860072	860077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502645
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16498	NC_018722	AC	3	6	860119	860124	50 %	0 %	0 %	50 %	408502646
16499	NC_018722	GTCC	2	8	860131	860138	0 %	25 %	25 %	50 %	408502646
16500	NC_018722	AGA	2	6	860139	860144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502646

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