MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_018722	CCTT	2	8	808602	808609	0 %	50 %	0 %	50 %	408502597
15502	NC_018722	ATC	2	6	808789	808794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502598
15503	NC_018722	AC	3	6	808804	808809	50 %	0 %	0 %	50 %	408502598
15504	NC_018722	CA	3	6	808856	808861	50 %	0 %	0 %	50 %	408502598
15505	NC_018722	AACGC	2	10	808866	808875	40 %	0 %	20 %	40 %	408502598
15506	NC_018722	AG	3	6	808891	808896	50 %	0 %	50 %	0 %	408502598
15507	NC_018722	CCT	2	6	808908	808913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502598
15508	NC_018722	GCT	2	6	808986	808991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502598
15509	NC_018722	CG	3	6	809040	809045	0 %	0 %	50 %	50 %	408502598
15510	NC_018722	GCAAA	2	10	809086	809095	60 %	0 %	20 %	20 %	408502598
15511	NC_018722	GTAT	2	8	809098	809105	25 %	50 %	25 %	0 %	408502598
15512	NC_018722	GCA	2	6	809262	809267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502598
15513	NC_018722	CG	3	6	809310	809315	0 %	0 %	50 %	50 %	408502598
15514	NC_018722	CG	3	6	809318	809323	0 %	0 %	50 %	50 %	408502598
15515	NC_018722	A	7	7	809329	809335	100 %	0 %	0 %	0 %	408502598
15516	NC_018722	AGA	2	6	809344	809349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502598
15517	NC_018722	CAC	2	6	809410	809415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502598
15518	NC_018722	GC	3	6	809442	809447	0 %	0 %	50 %	50 %	408502598
15519	NC_018722	CTG	2	6	809458	809463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502598
15520	NC_018722	ACC	2	6	809494	809499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502598
15521	NC_018722	GCG	2	6	809635	809640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502598
15522	NC_018722	CGC	2	6	809742	809747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502598
15523	NC_018722	C	6	6	809759	809764	0 %	0 %	0 %	100 %	408502598
15524	NC_018722	GCC	2	6	809770	809775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502598
15525	NC_018722	CCG	2	6	809794	809799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502598
15526	NC_018722	CA	3	6	809806	809811	50 %	0 %	0 %	50 %	408502598
15527	NC_018722	TCA	2	6	809852	809857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502598
15528	NC_018722	AAG	2	6	809991	809996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502599
15529	NC_018722	CA	3	6	810011	810016	50 %	0 %	0 %	50 %	408502599
15530	NC_018722	CCTT	2	8	810033	810040	0 %	50 %	0 %	50 %	408502599
15531	NC_018722	GAGCAA	2	12	810063	810074	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408502599
15532	NC_018722	ACC	2	6	810169	810174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502599
15533	NC_018722	AAC	2	6	810176	810181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502599
15534	NC_018722	CT	3	6	810237	810242	0 %	50 %	0 %	50 %	408502599
15535	NC_018722	TAC	2	6	810252	810257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502599
15536	NC_018722	CA	3	6	810288	810293	50 %	0 %	0 %	50 %	408502600
15537	NC_018722	CGCA	2	8	810305	810312	25 %	0 %	25 %	50 %	408502600
15538	NC_018722	ACGT	2	8	810345	810352	25 %	25 %	25 %	25 %	408502600
15539	NC_018722	AG	3	6	810387	810392	50 %	0 %	50 %	0 %	408502600
15540	NC_018722	C	7	7	810412	810418	0 %	0 %	0 %	100 %	408502600
15541	NC_018722	GA	3	6	810428	810433	50 %	0 %	50 %	0 %	408502600
15542	NC_018722	CCG	2	6	810444	810449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502600
15543	NC_018722	CA	4	8	810516	810523	50 %	0 %	0 %	50 %	408502600
15544	NC_018722	GCA	2	6	810548	810553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502600
15545	NC_018722	GGT	2	6	810684	810689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502601
15546	NC_018722	CTT	2	6	810694	810699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502601
15547	NC_018722	CAC	2	6	810748	810753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502601
15548	NC_018722	CG	3	6	810754	810759	0 %	0 %	50 %	50 %	408502601
15549	NC_018722	CCA	2	6	810809	810814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502601
15550	NC_018722	ATC	2	6	810815	810820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502601
15551	NC_018722	CCCG	2	8	810844	810851	0 %	0 %	25 %	75 %	408502601
15552	NC_018722	TAT	2	6	810867	810872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502601
15553	NC_018722	TAC	3	9	810882	810890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502601
15554	NC_018722	GC	3	6	811053	811058	0 %	0 %	50 %	50 %	408502602
15555	NC_018722	CCTT	2	8	811107	811114	0 %	50 %	0 %	50 %	408502602
15556	NC_018722	CA	3	6	811246	811251	50 %	0 %	0 %	50 %	408502602
15557	NC_018722	CG	3	6	811318	811323	0 %	0 %	50 %	50 %	408502602
15558	NC_018722	GC	3	6	811463	811468	0 %	0 %	50 %	50 %	408502602
15559	NC_018722	GCAG	2	8	811494	811501	25 %	0 %	50 %	25 %	408502602
15560	NC_018722	CACC	2	8	811513	811520	25 %	0 %	0 %	75 %	408502602
15561	NC_018722	CCT	2	6	811531	811536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502602
15562	NC_018722	TCT	2	6	811681	811686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502602
15563	NC_018722	GC	3	6	811719	811724	0 %	0 %	50 %	50 %	408502602
15564	NC_018722	CTC	2	6	811826	811831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502602
15565	NC_018722	CTC	2	6	812027	812032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502602
15566	NC_018722	CGG	2	6	812055	812060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502602
15567	NC_018722	TCT	2	6	812076	812081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502602
15568	NC_018722	GAA	2	6	812084	812089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502602
15569	NC_018722	GCGAGC	2	12	812133	812144	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	408502602
15570	NC_018722	AACG	2	8	812184	812191	50 %	0 %	25 %	25 %	408502602
15571	NC_018722	GTA	2	6	812291	812296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502602
15572	NC_018722	GGAC	2	8	812379	812386	25 %	0 %	50 %	25 %	408502602
15573	NC_018722	CAA	2	6	812413	812418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502602
15574	NC_018722	C	7	7	812438	812444	0 %	0 %	0 %	100 %	408502602
15575	NC_018722	AGAA	2	8	812450	812457	75 %	0 %	25 %	0 %	408502602
15576	NC_018722	CACGC	2	10	812551	812560	20 %	0 %	20 %	60 %	408502602
15577	NC_018722	CCG	2	6	812599	812604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502602
15578	NC_018722	AAT	2	6	812618	812623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502602
15579	NC_018722	C	7	7	812624	812630	0 %	0 %	0 %	100 %	408502602
15580	NC_018722	CCA	2	6	812731	812736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502602
15581	NC_018722	AGC	2	6	812757	812762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502602
15582	NC_018722	CTTCG	2	10	812786	812795	0 %	40 %	20 %	40 %	408502602
15583	NC_018722	TC	3	6	812857	812862	0 %	50 %	0 %	50 %	408502602
15584	NC_018722	TCC	2	6	812871	812876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502602
15585	NC_018722	TCG	2	6	812955	812960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502602
15586	NC_018722	CTC	2	6	812966	812971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502602
15587	NC_018722	TCT	2	6	812992	812997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502602
15588	NC_018722	TCC	2	6	813102	813107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502602
15589	NC_018722	CAG	2	6	813116	813121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502602
15590	NC_018722	CTT	2	6	813142	813147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502602
15591	NC_018722	CAT	2	6	813163	813168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502602
15592	NC_018722	TCC	2	6	813236	813241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502602
15593	NC_018722	A	7	7	813246	813252	100 %	0 %	0 %	0 %	408502602
15594	NC_018722	GAA	2	6	813353	813358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502602
15595	NC_018722	ACC	2	6	813477	813482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502602
15596	NC_018722	GAG	2	6	813485	813490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502602
15597	NC_018722	GA	3	6	813592	813597	50 %	0 %	50 %	0 %	408502602
15598	NC_018722	GAC	2	6	813661	813666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502602
15599	NC_018722	AATG	2	8	813727	813734	50 %	25 %	25 %	0 %	408502602
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15601	NC_018722	AG	3	6	813842	813847	50 %	0 %	50 %	0 %	408502603
15602	NC_018722	AG	3	6	813925	813930	50 %	0 %	50 %	0 %	408502603
15603	NC_018722	GAA	2	6	813978	813983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502603
15604	NC_018722	CG	3	6	813990	813995	0 %	0 %	50 %	50 %	408502603
15605	NC_018722	ATA	2	6	814008	814013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502603
15606	NC_018722	AAC	2	6	814044	814049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502603
15607	NC_018722	AGG	2	6	814112	814117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502603
15608	NC_018722	CG	3	6	814119	814124	0 %	0 %	50 %	50 %	408502603
15609	NC_018722	CTT	2	6	814199	814204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502603
15610	NC_018722	TCA	2	6	814350	814355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502603
15611	NC_018722	CAA	2	6	814388	814393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502603
15612	NC_018722	TTC	2	6	814440	814445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502603
15613	NC_018722	TGA	2	6	814476	814481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502603
15614	NC_018722	CCTT	2	8	814552	814559	0 %	50 %	0 %	50 %	408502603
15615	NC_018722	AGC	2	6	814653	814658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502603
15616	NC_018722	TTC	2	6	814683	814688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502603
15617	NC_018722	TTC	3	9	814749	814757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502603
15618	NC_018722	CAC	2	6	814790	814795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502603
15619	NC_018722	GCAC	2	8	815110	815117	25 %	0 %	25 %	50 %	408502604
15620	NC_018722	ACG	3	9	815124	815132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502604
15621	NC_018722	CTT	2	6	815223	815228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502604
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15623	NC_018722	CATA	2	8	815375	815382	50 %	25 %	0 %	25 %	408502604
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15988	NC_018722	GC	3	6	834247	834252	0 %	0 %	50 %	50 %	408502622
15989	NC_018722	CGTG	2	8	834254	834261	0 %	25 %	50 %	25 %	408502622
15990	NC_018722	GCG	2	6	834324	834329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502622
15991	NC_018722	T	6	6	834439	834444	0 %	100 %	0 %	0 %	408502622
15992	NC_018722	TAC	2	6	834498	834503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502622
15993	NC_018722	GAG	2	6	834555	834560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502622
15994	NC_018722	A	6	6	834672	834677	100 %	0 %	0 %	0 %	408502622
15995	NC_018722	CG	4	8	834699	834706	0 %	0 %	50 %	50 %	408502622
15996	NC_018722	TGTT	2	8	834865	834872	0 %	75 %	25 %	0 %	408502622
15997	NC_018722	ATC	2	6	835008	835013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502622
15998	NC_018722	GC	4	8	835125	835132	0 %	0 %	50 %	50 %	408502622
15999	NC_018722	CGG	2	6	835163	835168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502622
16000	NC_018722	ATCAA	2	10	835237	835246	60 %	20 %	0 %	20 %	408502622

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