MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15003	NC_018722	TAA	2	6	785212	785217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502571
15004	NC_018722	ATG	2	6	785241	785246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502571
15005	NC_018722	TCC	2	6	785285	785290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502571
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15009	NC_018722	CAA	2	6	785443	785448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502571
15010	NC_018722	AAGAT	2	10	785478	785487	60 %	20 %	20 %	0 %	408502571
15011	NC_018722	AAC	2	6	785528	785533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502571
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15016	NC_018722	GTTT	2	8	785748	785755	0 %	75 %	25 %	0 %	408502572
15017	NC_018722	TCT	2	6	785756	785761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502572
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15019	NC_018722	CTC	2	6	786004	786009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502572
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15026	NC_018722	A	6	6	786220	786225	100 %	0 %	0 %	0 %	408502572
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15028	NC_018722	A	7	7	786279	786285	100 %	0 %	0 %	0 %	408502572
15029	NC_018722	A	6	6	786296	786301	100 %	0 %	0 %	0 %	408502572
15030	NC_018722	CAA	2	6	786408	786413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502572
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15054	NC_018722	CAA	2	6	787320	787325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502573
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15061	NC_018722	GAG	2	6	787644	787649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502574
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15065	NC_018722	CTAT	2	8	787882	787889	25 %	50 %	0 %	25 %	408502575
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15090	NC_018722	GC	3	6	788973	788978	0 %	0 %	50 %	50 %	408502576
15091	NC_018722	GC	3	6	789025	789030	0 %	0 %	50 %	50 %	408502576
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15093	NC_018722	CA	3	6	789082	789087	50 %	0 %	0 %	50 %	408502576
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15101	NC_018722	GA	3	6	789424	789429	50 %	0 %	50 %	0 %	408502576
15102	NC_018722	TCA	2	6	789457	789462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502576
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15106	NC_018722	GACT	2	8	789693	789700	25 %	25 %	25 %	25 %	408502577
15107	NC_018722	C	6	6	789745	789750	0 %	0 %	0 %	100 %	408502577
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15109	NC_018722	C	8	8	789791	789798	0 %	0 %	0 %	100 %	408502577
15110	NC_018722	GCT	2	6	789824	789829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502577
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15113	NC_018722	TGAC	2	8	790072	790079	25 %	25 %	25 %	25 %	408502577
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15122	NC_018722	CCA	2	6	790683	790688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502578
15123	NC_018722	GAA	2	6	790760	790765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502578
15124	NC_018722	TCA	2	6	790830	790835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502578
15125	NC_018722	ACCT	2	8	790849	790856	25 %	25 %	0 %	50 %	408502578
15126	NC_018722	ACC	2	6	790877	790882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502578
15127	NC_018722	GAGG	2	8	790889	790896	25 %	0 %	75 %	0 %	408502578
15128	NC_018722	CCTGT	2	10	791058	791067	0 %	40 %	20 %	40 %	408502578
15129	NC_018722	TCC	2	6	791068	791073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502578
15130	NC_018722	CTC	2	6	791194	791199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502578
15131	NC_018722	ACGTGC	2	12	791225	791236	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	408502578
15132	NC_018722	GTA	2	6	791267	791272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502578
15133	NC_018722	GC	3	6	791386	791391	0 %	0 %	50 %	50 %	408502578
15134	NC_018722	AGC	2	6	791429	791434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502578
15135	NC_018722	ATA	2	6	791454	791459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502578
15136	NC_018722	AG	3	6	791617	791622	50 %	0 %	50 %	0 %	408502579
15137	NC_018722	A	6	6	791648	791653	100 %	0 %	0 %	0 %	408502579
15138	NC_018722	CCA	2	6	791664	791669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502579
15139	NC_018722	CG	3	6	791672	791677	0 %	0 %	50 %	50 %	408502579
15140	NC_018722	CTG	2	6	791686	791691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502579
15141	NC_018722	CAACG	2	10	791719	791728	40 %	0 %	20 %	40 %	408502579
15142	NC_018722	GTA	2	6	791791	791796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502579
15143	NC_018722	CAC	2	6	791890	791895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502579
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15148	NC_018722	GT	3	6	792235	792240	0 %	50 %	50 %	0 %	408502580
15149	NC_018722	GT	3	6	792375	792380	0 %	50 %	50 %	0 %	408502580
15150	NC_018722	CAA	2	6	792440	792445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502580
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15152	NC_018722	A	7	7	792490	792496	100 %	0 %	0 %	0 %	408502580
15153	NC_018722	TCA	2	6	792531	792536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502580
15154	NC_018722	CTT	2	6	792590	792595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502580
15155	NC_018722	GAG	2	6	792675	792680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502580
15156	NC_018722	GCA	2	6	792720	792725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502580
15157	NC_018722	A	7	7	792776	792782	100 %	0 %	0 %	0 %	408502580
15158	NC_018722	GCC	2	6	792831	792836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502580
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15160	NC_018722	GAT	2	6	792954	792959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502581
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15162	NC_018722	TAG	2	6	793038	793043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502581
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15168	NC_018722	C	6	6	793529	793534	0 %	0 %	0 %	100 %	408502581
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15194	NC_018722	TTCG	2	8	794734	794741	0 %	50 %	25 %	25 %	408502583
15195	NC_018722	GCA	2	6	794747	794752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502583
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15199	NC_018722	A	7	7	795007	795013	100 %	0 %	0 %	0 %	408502583
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15211	NC_018722	GC	4	8	795740	795747	0 %	0 %	50 %	50 %	408502584
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15223	NC_018722	CTGCGC	2	12	796520	796531	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	408502585
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15225	NC_018722	CG	3	6	796579	796584	0 %	0 %	50 %	50 %	408502585
15226	NC_018722	CG	3	6	796593	796598	0 %	0 %	50 %	50 %	408502585
15227	NC_018722	GC	3	6	796613	796618	0 %	0 %	50 %	50 %	408502585
15228	NC_018722	GAG	2	6	796642	796647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502585
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15231	NC_018722	TCC	2	6	796745	796750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502585
15232	NC_018722	CTGC	2	8	796758	796765	0 %	25 %	25 %	50 %	408502585
15233	NC_018722	CAC	2	6	796789	796794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502585
15234	NC_018722	AGC	2	6	796799	796804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502585
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15237	NC_018722	GCA	2	6	796900	796905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502585
15238	NC_018722	GGGCAG	2	12	796906	796917	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	408502585
15239	NC_018722	GAAG	2	8	796923	796930	50 %	0 %	50 %	0 %	408502585
15240	NC_018722	CA	3	6	796993	796998	50 %	0 %	0 %	50 %	408502585
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15242	NC_018722	CGC	2	6	797066	797071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502585
15243	NC_018722	GCT	2	6	797095	797100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502585
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15364	NC_018722	TCC	2	6	802258	802263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502591
15365	NC_018722	ACAG	2	8	802298	802305	50 %	0 %	25 %	25 %	408502591
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15468	NC_018722	CG	3	6	807144	807149	0 %	0 %	50 %	50 %	408502595
15469	NC_018722	ATA	2	6	807162	807167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502595
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15473	NC_018722	A	8	8	807309	807316	100 %	0 %	0 %	0 %	408502595
15474	NC_018722	GAG	2	6	807318	807323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502595
15475	NC_018722	A	7	7	807325	807331	100 %	0 %	0 %	0 %	408502595
15476	NC_018722	CA	3	6	807521	807526	50 %	0 %	0 %	50 %	408502596
15477	NC_018722	CACT	2	8	807534	807541	25 %	25 %	0 %	50 %	408502596
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15479	NC_018722	TAACGT	2	12	807562	807573	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	408502596
15480	NC_018722	CGC	2	6	807595	807600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502596
15481	NC_018722	AC	3	6	807651	807656	50 %	0 %	0 %	50 %	408502596
15482	NC_018722	ACA	3	9	807696	807704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502596
15483	NC_018722	AC	4	8	807735	807742	50 %	0 %	0 %	50 %	408502596
15484	NC_018722	GC	3	6	807749	807754	0 %	0 %	50 %	50 %	408502596
15485	NC_018722	CGCA	2	8	807807	807814	25 %	0 %	25 %	50 %	408502596
15486	NC_018722	GCA	3	9	807812	807820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502596
15487	NC_018722	CAA	2	6	807823	807828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502596
15488	NC_018722	CCG	2	6	807913	807918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502596
15489	NC_018722	ACG	2	6	807946	807951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502596
15490	NC_018722	GC	4	8	807983	807990	0 %	0 %	50 %	50 %	408502596
15491	NC_018722	CG	3	6	808149	808154	0 %	0 %	50 %	50 %	408502597
15492	NC_018722	ATA	2	6	808155	808160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502597
15493	NC_018722	CCG	2	6	808258	808263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502597
15494	NC_018722	GGGAA	2	10	808272	808281	40 %	0 %	60 %	0 %	408502597
15495	NC_018722	C	6	6	808316	808321	0 %	0 %	0 %	100 %	408502597
15496	NC_018722	GC	3	6	808340	808345	0 %	0 %	50 %	50 %	408502597
15497	NC_018722	GT	3	6	808364	808369	0 %	50 %	50 %	0 %	408502597
15498	NC_018722	GC	3	6	808406	808411	0 %	0 %	50 %	50 %	408502597
15499	NC_018722	TGC	2	6	808476	808481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502597
15500	NC_018722	GCACTT	2	12	808590	808601	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	408502597

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