MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_018722	A	6	6	731650	731655	100 %	0 %	0 %	0 %	408502527
14002	NC_018722	CG	3	6	731670	731675	0 %	0 %	50 %	50 %	408502527
14003	NC_018722	CCA	2	6	731708	731713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502527
14004	NC_018722	CA	3	6	731749	731754	50 %	0 %	0 %	50 %	408502527
14005	NC_018722	CAC	2	6	732024	732029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502528
14006	NC_018722	A	7	7	732039	732045	100 %	0 %	0 %	0 %	408502528
14007	NC_018722	CG	3	6	732058	732063	0 %	0 %	50 %	50 %	408502528
14008	NC_018722	AC	3	6	732079	732084	50 %	0 %	0 %	50 %	408502528
14009	NC_018722	CAT	2	6	732168	732173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502528
14010	NC_018722	A	6	6	732177	732182	100 %	0 %	0 %	0 %	408502528
14011	NC_018722	CAGCAT	2	12	732282	732293	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502528
14012	NC_018722	GCA	2	6	732296	732301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502528
14013	NC_018722	ACCGA	2	10	732319	732328	40 %	0 %	20 %	40 %	408502528
14014	NC_018722	GA	3	6	732508	732513	50 %	0 %	50 %	0 %	408502528
14015	NC_018722	AAT	2	6	732550	732555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502528
14016	NC_018722	TAGA	2	8	732566	732573	50 %	25 %	25 %	0 %	408502528
14017	NC_018722	GCAC	2	8	732586	732593	25 %	0 %	25 %	50 %	408502529
14018	NC_018722	TGC	2	6	732633	732638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502529
14019	NC_018722	ACGT	2	8	732684	732691	25 %	25 %	25 %	25 %	408502529
14020	NC_018722	CATG	2	8	732703	732710	25 %	25 %	25 %	25 %	408502529
14021	NC_018722	GAA	2	6	732712	732717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502529
14022	NC_018722	CCT	2	6	732732	732737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502529
14023	NC_018722	TC	3	6	732850	732855	0 %	50 %	0 %	50 %	408502529
14024	NC_018722	CCAG	2	8	732882	732889	25 %	0 %	25 %	50 %	408502529
14025	NC_018722	CCA	2	6	732982	732987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502529
14026	NC_018722	ATA	2	6	732993	732998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502529
14027	NC_018722	GC	3	6	733015	733020	0 %	0 %	50 %	50 %	408502529
14028	NC_018722	CTC	2	6	733025	733030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502529
14029	NC_018722	CACAG	2	10	733032	733041	40 %	0 %	20 %	40 %	408502529
14030	NC_018722	TATT	2	8	733155	733162	25 %	75 %	0 %	0 %	408502529
14031	NC_018722	TCA	2	6	733230	733235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502529
14032	NC_018722	ATA	2	6	733253	733258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502529
14033	NC_018722	TC	3	6	733286	733291	0 %	50 %	0 %	50 %	408502529
14034	NC_018722	TTC	2	6	733304	733309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502529
14035	NC_018722	GCTT	2	8	733364	733371	0 %	50 %	25 %	25 %	408502529
14036	NC_018722	T	6	6	733392	733397	0 %	100 %	0 %	0 %	408502529
14037	NC_018722	TCG	2	6	733419	733424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502529
14038	NC_018722	ATT	2	6	733485	733490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502529
14039	NC_018722	T	8	8	733497	733504	0 %	100 %	0 %	0 %	408502529
14040	NC_018722	AGG	2	6	733546	733551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502529
14041	NC_018722	TCA	2	6	733575	733580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502529
14042	NC_018722	CAA	2	6	733622	733627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502529
14043	NC_018722	AATT	2	8	733750	733757	50 %	50 %	0 %	0 %	408502529
14044	NC_018722	CGG	2	6	733786	733791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502529
14045	NC_018722	TTA	2	6	733854	733859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502529
14046	NC_018722	TTTTC	2	10	733954	733963	0 %	80 %	0 %	20 %	408502529
14047	NC_018722	TTTC	2	8	733982	733989	0 %	75 %	0 %	25 %	408502529
14048	NC_018722	TATTT	2	10	734124	734133	20 %	80 %	0 %	0 %	408502529
14049	NC_018722	AT	3	6	734157	734162	50 %	50 %	0 %	0 %	408502529
14050	NC_018722	AATG	2	8	734168	734175	50 %	25 %	25 %	0 %	408502529
14051	NC_018722	TCC	2	6	734217	734222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502529
14052	NC_018722	GCA	2	6	734286	734291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502529
14053	NC_018722	TTCC	2	8	734296	734303	0 %	50 %	0 %	50 %	408502529
14054	NC_018722	CGT	2	6	734379	734384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502529
14055	NC_018722	CTG	2	6	734560	734565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502529
14056	NC_018722	T	6	6	734675	734680	0 %	100 %	0 %	0 %	408502529
14057	NC_018722	ATC	2	6	734696	734701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502529
14058	NC_018722	ATC	2	6	734718	734723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502529
14059	NC_018722	CGC	2	6	734771	734776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502529
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14061	NC_018722	CGCA	2	8	734834	734841	25 %	0 %	25 %	50 %	408502529
14062	NC_018722	CTT	2	6	734854	734859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502529
14063	NC_018722	CAAAA	2	10	734869	734878	80 %	0 %	0 %	20 %	408502529
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14065	NC_018722	CCCCG	2	10	735006	735015	0 %	0 %	20 %	80 %	408502529
14066	NC_018722	TAA	2	6	735049	735054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502529
14067	NC_018722	CAA	2	6	735079	735084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502529
14068	NC_018722	ATCC	2	8	735086	735093	25 %	25 %	0 %	50 %	408502529
14069	NC_018722	TTC	2	6	735134	735139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502529
14070	NC_018722	ACT	2	6	735144	735149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502529
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14073	NC_018722	AGA	2	6	735341	735346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502529
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14082	NC_018722	TTC	2	6	735614	735619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502529
14083	NC_018722	CAAGA	2	10	735667	735676	60 %	0 %	20 %	20 %	408502529
14084	NC_018722	GTA	2	6	735737	735742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502529
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14087	NC_018722	CAG	2	6	735916	735921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502529
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14091	NC_018722	AAT	2	6	736048	736053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502529
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14093	NC_018722	AGGG	2	8	736256	736263	25 %	0 %	75 %	0 %	408502530
14094	NC_018722	GTC	2	6	736286	736291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502530
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14097	NC_018722	GCG	2	6	736365	736370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502530
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14101	NC_018722	CG	3	6	736641	736646	0 %	0 %	50 %	50 %	408502530
14102	NC_018722	CG	4	8	736761	736768	0 %	0 %	50 %	50 %	408502530
14103	NC_018722	CCA	2	6	736780	736785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502530
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14105	NC_018722	CTGC	2	8	736869	736876	0 %	25 %	25 %	50 %	408502530
14106	NC_018722	CAA	2	6	736927	736932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502530
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14108	NC_018722	CGC	2	6	736997	737002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502530
14109	NC_018722	CA	3	6	737050	737055	50 %	0 %	0 %	50 %	408502530
14110	NC_018722	GCA	2	6	737080	737085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502530
14111	NC_018722	AC	3	6	737157	737162	50 %	0 %	0 %	50 %	408502530
14112	NC_018722	ACC	2	6	737195	737200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502530
14113	NC_018722	AC	3	6	737213	737218	50 %	0 %	0 %	50 %	408502530
14114	NC_018722	ACG	2	6	737309	737314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502530
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14116	NC_018722	GC	3	6	737357	737362	0 %	0 %	50 %	50 %	408502530
14117	NC_018722	CAC	2	6	737432	737437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502530
14118	NC_018722	GCCAAT	2	12	737465	737476	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	408502531
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14248	NC_018722	GC	3	6	744219	744224	0 %	0 %	50 %	50 %	408502537
14249	NC_018722	CG	3	6	744232	744237	0 %	0 %	50 %	50 %	408502537
14250	NC_018722	CAC	2	6	744249	744254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502537
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14262	NC_018722	CTTG	2	8	744919	744926	0 %	50 %	25 %	25 %	408502538
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14278	NC_018722	CT	3	6	745545	745550	0 %	50 %	0 %	50 %	408502539
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14368	NC_018722	TGC	2	6	749723	749728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502543
14369	NC_018722	TTC	2	6	749786	749791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502543
14370	NC_018722	CG	5	10	749807	749816	0 %	0 %	50 %	50 %	408502543
14371	NC_018722	GCAC	2	8	749855	749862	25 %	0 %	25 %	50 %	408502543
14372	NC_018722	TGCAG	2	10	749900	749909	20 %	20 %	40 %	20 %	408502543
14373	NC_018722	CG	3	6	749919	749924	0 %	0 %	50 %	50 %	408502543
14374	NC_018722	GCA	2	6	750260	750265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502544
14375	NC_018722	T	6	6	750358	750363	0 %	100 %	0 %	0 %	408502544
14376	NC_018722	TGG	2	6	750459	750464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502544
14377	NC_018722	GAT	2	6	750480	750485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502544
14378	NC_018722	CAT	2	6	750537	750542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502544
14379	NC_018722	CGC	2	6	750607	750612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502544
14380	NC_018722	CTC	2	6	750633	750638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502544
14381	NC_018722	AAG	2	6	750656	750661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502544
14382	NC_018722	AGG	2	6	750675	750680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502544
14383	NC_018722	GGT	2	6	750693	750698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502544
14384	NC_018722	ACG	2	6	750824	750829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502544
14385	NC_018722	ACG	2	6	750890	750895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502544
14386	NC_018722	TC	3	6	750947	750952	0 %	50 %	0 %	50 %	408502544
14387	NC_018722	CAA	2	6	751065	751070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502544
14388	NC_018722	GC	3	6	751076	751081	0 %	0 %	50 %	50 %	408502544
14389	NC_018722	CGA	2	6	751202	751207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502544
14390	NC_018722	TGC	2	6	751214	751219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502544
14391	NC_018722	CGCTC	2	10	751284	751293	0 %	20 %	20 %	60 %	408502544
14392	NC_018722	AGC	2	6	751446	751451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502544
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14394	NC_018722	TGGA	2	8	751753	751760	25 %	25 %	50 %	0 %	408502545
14395	NC_018722	AAG	2	6	751786	751791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502545
14396	NC_018722	TCAA	2	8	751828	751835	50 %	25 %	0 %	25 %	408502545
14397	NC_018722	CGA	2	6	751919	751924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502545
14398	NC_018722	GCA	2	6	751981	751986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502545
14399	NC_018722	TGTC	2	8	751987	751994	0 %	50 %	25 %	25 %	408502545
14400	NC_018722	TC	3	6	751993	751998	0 %	50 %	0 %	50 %	408502545
14401	NC_018722	CGA	2	6	752057	752062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502545
14402	NC_018722	CT	3	6	752072	752077	0 %	50 %	0 %	50 %	408502545
14403	NC_018722	A	6	6	752127	752132	100 %	0 %	0 %	0 %	408502545
14404	NC_018722	TGC	2	6	752200	752205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502545
14405	NC_018722	TCA	2	6	752260	752265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502545
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14407	NC_018722	A	8	8	752510	752517	100 %	0 %	0 %	0 %	408502545
14408	NC_018722	AGC	2	6	752529	752534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502545
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14413	NC_018722	CTTG	2	8	752819	752826	0 %	50 %	25 %	25 %	408502545
14414	NC_018722	TCA	2	6	752878	752883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502545
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14417	NC_018722	GCG	2	6	753275	753280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502546
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14419	NC_018722	GCA	2	6	753454	753459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502546
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14422	NC_018722	GCGCT	2	10	753558	753567	0 %	20 %	40 %	40 %	408502546
14423	NC_018722	GTG	2	6	753599	753604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502546
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14431	NC_018722	TTTCA	2	10	754054	754063	20 %	60 %	0 %	20 %	408502546
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14434	NC_018722	T	6	6	754100	754105	0 %	100 %	0 %	0 %	408502546
14435	NC_018722	CCA	2	6	754227	754232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502546
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14440	NC_018722	ATC	3	9	754613	754621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502546
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14443	NC_018722	AGT	2	6	754828	754833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502547
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14445	NC_018722	CG	3	6	754847	754852	0 %	0 %	50 %	50 %	408502547
14446	NC_018722	GGA	2	6	754859	754864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502547
14447	NC_018722	ATCC	2	8	754985	754992	25 %	25 %	0 %	50 %	408502547
14448	NC_018722	AG	3	6	755115	755120	50 %	0 %	50 %	0 %	408502547
14449	NC_018722	CAA	2	6	755183	755188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502547
14450	NC_018722	GCT	3	9	755243	755251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502547
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14453	NC_018722	ATACAT	2	12	755313	755324	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408502547
14454	NC_018722	ATAA	2	8	755373	755380	75 %	25 %	0 %	0 %	408502547
14455	NC_018722	TGCC	2	8	755385	755392	0 %	25 %	25 %	50 %	408502547
14456	NC_018722	ATTTC	2	10	755404	755413	20 %	60 %	0 %	20 %	408502547
14457	NC_018722	TCTT	2	8	755444	755451	0 %	75 %	0 %	25 %	408502547
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14463	NC_018722	TTCCC	2	10	755596	755605	0 %	40 %	0 %	60 %	408502547
14464	NC_018722	AACC	2	8	755667	755674	50 %	0 %	0 %	50 %	408502547
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14467	NC_018722	AGCA	2	8	755877	755884	50 %	0 %	25 %	25 %	408502547
14468	NC_018722	AAT	2	6	755907	755912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502547
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14470	NC_018722	TTC	2	6	755985	755990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502547
14471	NC_018722	TCT	2	6	756071	756076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502547
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14473	NC_018722	CTG	2	6	756117	756122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502547
14474	NC_018722	A	7	7	756197	756203	100 %	0 %	0 %	0 %	408502547
14475	NC_018722	TTC	2	6	756204	756209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502547
14476	NC_018722	CAT	2	6	756239	756244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502547
14477	NC_018722	GAT	2	6	756296	756301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502547
14478	NC_018722	TGC	2	6	756360	756365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502547
14479	NC_018722	T	7	7	756430	756436	0 %	100 %	0 %	0 %	408502547
14480	NC_018722	T	6	6	756449	756454	0 %	100 %	0 %	0 %	408502547
14481	NC_018722	ACT	2	6	756468	756473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502547
14482	NC_018722	A	6	6	756547	756552	100 %	0 %	0 %	0 %	408502547
14483	NC_018722	TCTTGC	2	12	756617	756628	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	408502547
14484	NC_018722	AAC	2	6	756795	756800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502547
14485	NC_018722	G	6	6	757008	757013	0 %	0 %	100 %	0 %	408502548
14486	NC_018722	T	6	6	757064	757069	0 %	100 %	0 %	0 %	408502548
14487	NC_018722	ATC	2	6	757156	757161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502548
14488	NC_018722	TCC	2	6	757297	757302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502548
14489	NC_018722	CTC	2	6	757323	757328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502548
14490	NC_018722	TAA	2	6	757356	757361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502548
14491	NC_018722	ATC	2	6	757393	757398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502548
14492	NC_018722	A	8	8	757437	757444	100 %	0 %	0 %	0 %	408502548
14493	NC_018722	A	6	6	757515	757520	100 %	0 %	0 %	0 %	408502548
14494	NC_018722	CA	3	6	757578	757583	50 %	0 %	0 %	50 %	408502548
14495	NC_018722	TGC	2	6	757622	757627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502548
14496	NC_018722	TCC	2	6	757648	757653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502548
14497	NC_018722	ACTTT	2	10	757671	757680	20 %	60 %	0 %	20 %	408502548
14498	NC_018722	T	6	6	757678	757683	0 %	100 %	0 %	0 %	408502548
14499	NC_018722	GCA	2	6	757694	757699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502548
14500	NC_018722	A	6	6	757739	757744	100 %	0 %	0 %	0 %	408502548

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