MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_018722	TAC	2	6	702177	702182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502502
13503	NC_018722	CGT	2	6	702203	702208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502502
13504	NC_018722	GTTT	2	8	702220	702227	0 %	75 %	25 %	0 %	408502502
13505	NC_018722	TTTC	2	8	702518	702525	0 %	75 %	0 %	25 %	408502502
13506	NC_018722	GC	3	6	702588	702593	0 %	0 %	50 %	50 %	408502502
13507	NC_018722	CA	3	6	702631	702636	50 %	0 %	0 %	50 %	408502502
13508	NC_018722	AGA	2	6	702641	702646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502502
13509	NC_018722	GCA	2	6	702695	702700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502502
13510	NC_018722	ATCG	2	8	702714	702721	25 %	25 %	25 %	25 %	408502502
13511	NC_018722	GCC	2	6	702765	702770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502502
13512	NC_018722	TCC	2	6	702771	702776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502502
13513	NC_018722	CTG	2	6	702849	702854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502502
13514	NC_018722	CTTG	2	8	702980	702987	0 %	50 %	25 %	25 %	408502502
13515	NC_018722	GTCAG	2	10	703025	703034	20 %	20 %	40 %	20 %	408502502
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13517	NC_018722	TGC	2	6	703111	703116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502502
13518	NC_018722	GC	3	6	703153	703158	0 %	0 %	50 %	50 %	408502502
13519	NC_018722	CAC	2	6	703196	703201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502502
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13522	NC_018722	AGG	2	6	703357	703362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502502
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13524	NC_018722	GTC	2	6	703409	703414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502502
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13526	NC_018722	GT	3	6	703597	703602	0 %	50 %	50 %	0 %	408502503
13527	NC_018722	GCAG	2	8	703633	703640	25 %	0 %	50 %	25 %	408502503
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13529	NC_018722	CAA	2	6	703666	703671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502503
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13533	NC_018722	AAAC	2	8	703836	703843	75 %	0 %	0 %	25 %	408502503
13534	NC_018722	CTG	2	6	703865	703870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502503
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13536	NC_018722	CACT	2	8	703915	703922	25 %	25 %	0 %	50 %	408502503
13537	NC_018722	ACCGA	2	10	703974	703983	40 %	0 %	20 %	40 %	408502503
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13539	NC_018722	GTA	2	6	704027	704032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502503
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13542	NC_018722	ATGT	2	8	704167	704174	25 %	50 %	25 %	0 %	408502503
13543	NC_018722	ACG	2	6	704179	704184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502503
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13553	NC_018722	GAA	3	9	705061	705069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502504
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13555	NC_018722	CAG	2	6	705088	705093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502504
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13561	NC_018722	CACG	2	8	705234	705241	25 %	0 %	25 %	50 %	408502504
13562	NC_018722	GC	3	6	705283	705288	0 %	0 %	50 %	50 %	408502504
13563	NC_018722	GC	3	6	705290	705295	0 %	0 %	50 %	50 %	408502504
13564	NC_018722	CA	3	6	705344	705349	50 %	0 %	0 %	50 %	408502504
13565	NC_018722	CTG	2	6	705350	705355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502504
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13570	NC_018722	TGA	2	6	705651	705656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502504
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13593	NC_018722	AT	3	6	706779	706784	50 %	50 %	0 %	0 %	408502504
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13602	NC_018722	TACG	2	8	707153	707160	25 %	25 %	25 %	25 %	408502505
13603	NC_018722	GCA	2	6	707247	707252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502505
13604	NC_018722	CA	3	6	707251	707256	50 %	0 %	0 %	50 %	408502505
13605	NC_018722	CAC	2	6	707310	707315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502505
13606	NC_018722	CAAA	2	8	707318	707325	75 %	0 %	0 %	25 %	408502505
13607	NC_018722	A	7	7	707363	707369	100 %	0 %	0 %	0 %	408502505
13608	NC_018722	ACTG	2	8	707397	707404	25 %	25 %	25 %	25 %	408502505
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13612	NC_018722	TCT	2	6	707685	707690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502506
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13614	NC_018722	AT	3	6	707842	707847	50 %	50 %	0 %	0 %	408502506
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13622	NC_018722	TC	3	6	708865	708870	0 %	50 %	0 %	50 %	408502506
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13730	NC_018722	A	7	7	714842	714848	100 %	0 %	0 %	0 %	408502512
13731	NC_018722	GCA	2	6	714959	714964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502512
13732	NC_018722	CA	4	8	715012	715019	50 %	0 %	0 %	50 %	408502512
13733	NC_018722	AGG	2	6	715043	715048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502512
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13735	NC_018722	GACT	2	8	718386	718393	25 %	25 %	25 %	25 %	408502513
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13741	NC_018722	TAT	2	6	718704	718709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502513
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13743	NC_018722	AGC	2	6	718830	718835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502513
13744	NC_018722	CCGTA	2	10	718856	718865	20 %	20 %	20 %	40 %	408502514
13745	NC_018722	TCT	2	6	718915	718920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502514
13746	NC_018722	GGT	2	6	718937	718942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502514
13747	NC_018722	TG	3	6	718985	718990	0 %	50 %	50 %	0 %	408502514
13748	NC_018722	CTG	2	6	719043	719048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502514
13749	NC_018722	CT	3	6	719121	719126	0 %	50 %	0 %	50 %	408502514
13750	NC_018722	TTC	2	6	719145	719150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502514
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13752	NC_018722	TTA	2	6	719263	719268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502514
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13763	NC_018722	CTG	2	6	719777	719782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502515
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13772	NC_018722	GC	3	6	720138	720143	0 %	0 %	50 %	50 %	408502515
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13850	NC_018722	A	6	6	723878	723883	100 %	0 %	0 %	0 %	408502520
13851	NC_018722	GT	3	6	723894	723899	0 %	50 %	50 %	0 %	408502520
13852	NC_018722	GCC	2	6	723948	723953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502520
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13855	NC_018722	CCTG	2	8	724089	724096	0 %	25 %	25 %	50 %	408502520
13856	NC_018722	CT	3	6	724120	724125	0 %	50 %	0 %	50 %	408502520
13857	NC_018722	TGC	2	6	724154	724159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502520
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13859	NC_018722	TGAT	2	8	724308	724315	25 %	50 %	25 %	0 %	408502520
13860	NC_018722	CCA	2	6	724321	724326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502520
13861	NC_018722	CCA	2	6	724333	724338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502520
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13863	NC_018722	GAA	2	6	724461	724466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502520
13864	NC_018722	CCCATC	2	12	724475	724486	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	408502520
13865	NC_018722	TTG	2	6	724509	724514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502520
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13867	NC_018722	CAC	2	6	724721	724726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502520
13868	NC_018722	GTT	2	6	724746	724751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502520
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13878	NC_018722	CGAA	2	8	725383	725390	50 %	0 %	25 %	25 %	408502520
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13885	NC_018722	AG	3	6	725824	725829	50 %	0 %	50 %	0 %	408502521
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13979	NC_018722	CAT	2	6	730297	730302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502527
13980	NC_018722	GCAC	2	8	730346	730353	25 %	0 %	25 %	50 %	408502527
13981	NC_018722	T	6	6	730374	730379	0 %	100 %	0 %	0 %	408502527
13982	NC_018722	CAA	2	6	730423	730428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502527
13983	NC_018722	TCA	2	6	730518	730523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502527
13984	NC_018722	AAT	2	6	730561	730566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502527
13985	NC_018722	AGC	2	6	730568	730573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502527
13986	NC_018722	GAAG	2	8	730637	730644	50 %	0 %	50 %	0 %	408502527
13987	NC_018722	TTA	2	6	730682	730687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502527
13988	NC_018722	ATC	2	6	730774	730779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502527
13989	NC_018722	T	7	7	730831	730837	0 %	100 %	0 %	0 %	408502527
13990	NC_018722	GCC	2	6	730943	730948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502527
13991	NC_018722	TTC	2	6	731029	731034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502527
13992	NC_018722	TGC	2	6	731036	731041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502527
13993	NC_018722	ATG	2	6	731093	731098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502527
13994	NC_018722	CA	3	6	731142	731147	50 %	0 %	0 %	50 %	408502527
13995	NC_018722	A	6	6	731197	731202	100 %	0 %	0 %	0 %	408502527
13996	NC_018722	ATG	2	6	731266	731271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502527
13997	NC_018722	GCAC	2	8	731407	731414	25 %	0 %	25 %	50 %	408502527
13998	NC_018722	CGGTA	2	10	731418	731427	20 %	20 %	40 %	20 %	408502527
13999	NC_018722	C	6	6	731435	731440	0 %	0 %	0 %	100 %	408502527
14000	NC_018722	TGGCA	2	10	731591	731600	20 %	20 %	40 %	20 %	408502527

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