MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_018722	A	6	6	653429	653434	100 %	0 %	0 %	0 %	408502463
12503	NC_018722	CTG	2	6	653440	653445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502463
12504	NC_018722	CAA	2	6	653454	653459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502463
12505	NC_018722	TCA	2	6	653471	653476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502463
12506	NC_018722	TCAC	2	8	653538	653545	25 %	25 %	0 %	50 %	408502463
12507	NC_018722	A	6	6	653558	653563	100 %	0 %	0 %	0 %	408502464
12508	NC_018722	CGT	2	6	653568	653573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502464
12509	NC_018722	CAA	2	6	653601	653606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502464
12510	NC_018722	ACA	2	6	653634	653639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502464
12511	NC_018722	CTT	2	6	653654	653659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502464
12512	NC_018722	CCG	2	6	653696	653701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502464
12513	NC_018722	ATA	2	6	653729	653734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502464
12514	NC_018722	AG	4	8	653736	653743	50 %	0 %	50 %	0 %	408502464
12515	NC_018722	A	6	6	653789	653794	100 %	0 %	0 %	0 %	408502464
12516	NC_018722	CTG	2	6	653863	653868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502464
12517	NC_018722	AC	3	6	653915	653920	50 %	0 %	0 %	50 %	408502464
12518	NC_018722	A	7	7	653959	653965	100 %	0 %	0 %	0 %	408502464
12519	NC_018722	GCA	2	6	654075	654080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502464
12520	NC_018722	GACT	2	8	654091	654098	25 %	25 %	25 %	25 %	408502464
12521	NC_018722	T	6	6	654098	654103	0 %	100 %	0 %	0 %	408502464
12522	NC_018722	AGC	2	6	654116	654121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502464
12523	NC_018722	GCA	2	6	654203	654208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502464
12524	NC_018722	CCG	2	6	654222	654227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502464
12525	NC_018722	CAA	2	6	654228	654233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502464
12526	NC_018722	T	6	6	654372	654377	0 %	100 %	0 %	0 %	408502464
12527	NC_018722	TACA	2	8	654481	654488	50 %	25 %	0 %	25 %	408502464
12528	NC_018722	TG	3	6	654511	654516	0 %	50 %	50 %	0 %	408502464
12529	NC_018722	C	6	6	654712	654717	0 %	0 %	0 %	100 %	408502464
12530	NC_018722	TTTC	2	8	654757	654764	0 %	75 %	0 %	25 %	408502464
12531	NC_018722	GCG	2	6	654824	654829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502464
12532	NC_018722	ACA	2	6	654852	654857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502464
12533	NC_018722	CAC	2	6	654871	654876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502464
12534	NC_018722	AAT	2	6	654883	654888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502464
12535	NC_018722	CT	4	8	654901	654908	0 %	50 %	0 %	50 %	408502465
12536	NC_018722	CA	3	6	654935	654940	50 %	0 %	0 %	50 %	408502465
12537	NC_018722	CTT	2	6	654968	654973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502465
12538	NC_018722	GC	3	6	654991	654996	0 %	0 %	50 %	50 %	408502465
12539	NC_018722	TCT	2	6	655000	655005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502465
12540	NC_018722	ACGC	2	8	655064	655071	25 %	0 %	25 %	50 %	408502465
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12542	NC_018722	TGC	2	6	655086	655091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502465
12543	NC_018722	ACGC	2	8	655109	655116	25 %	0 %	25 %	50 %	408502465
12544	NC_018722	AGG	2	6	655227	655232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502465
12545	NC_018722	CAC	3	9	655350	655358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502465
12546	NC_018722	A	6	6	655383	655388	100 %	0 %	0 %	0 %	408502465
12547	NC_018722	TCT	2	6	655448	655453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502465
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12550	NC_018722	AGC	2	6	655605	655610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502465
12551	NC_018722	TTG	2	6	655634	655639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502465
12552	NC_018722	GCA	2	6	655657	655662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502465
12553	NC_018722	CTTT	2	8	655690	655697	0 %	75 %	0 %	25 %	408502465
12554	NC_018722	AG	3	6	655738	655743	50 %	0 %	50 %	0 %	408502465
12555	NC_018722	CAG	2	6	655754	655759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502465
12556	NC_018722	ACC	3	9	655777	655785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502465
12557	NC_018722	GAA	2	6	655798	655803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502465
12558	NC_018722	TGCG	2	8	655817	655824	0 %	25 %	50 %	25 %	408502465
12559	NC_018722	CTT	2	6	655829	655834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502465
12560	NC_018722	CG	3	6	655880	655885	0 %	0 %	50 %	50 %	408502465
12561	NC_018722	CG	3	6	655894	655899	0 %	0 %	50 %	50 %	408502465
12562	NC_018722	CCA	2	6	655928	655933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502465
12563	NC_018722	TGC	2	6	655971	655976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502465
12564	NC_018722	CCGCC	2	10	656109	656118	0 %	0 %	20 %	80 %	408502466
12565	NC_018722	A	6	6	656126	656131	100 %	0 %	0 %	0 %	408502466
12566	NC_018722	TCA	2	6	656161	656166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502466
12567	NC_018722	CGACT	2	10	656168	656177	20 %	20 %	20 %	40 %	408502466
12568	NC_018722	CAGT	2	8	656194	656201	25 %	25 %	25 %	25 %	408502466
12569	NC_018722	AG	3	6	656237	656242	50 %	0 %	50 %	0 %	408502466
12570	NC_018722	TGT	2	6	656356	656361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502466
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12572	NC_018722	A	9	9	656470	656478	100 %	0 %	0 %	0 %	408502466
12573	NC_018722	AAG	2	6	656545	656550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502466
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12579	NC_018722	GC	3	6	656933	656938	0 %	0 %	50 %	50 %	408502467
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12586	NC_018722	T	6	6	657152	657157	0 %	100 %	0 %	0 %	408502467
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12593	NC_018722	TGA	2	6	657549	657554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502467
12594	NC_018722	TGC	2	6	657563	657568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502467
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12598	NC_018722	CG	4	8	657777	657784	0 %	0 %	50 %	50 %	408502468
12599	NC_018722	CCTG	2	8	657785	657792	0 %	25 %	25 %	50 %	408502468
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12601	NC_018722	GGA	2	6	657823	657828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502468
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12603	NC_018722	GGTT	2	8	657987	657994	0 %	50 %	50 %	0 %	408502468
12604	NC_018722	TAG	2	6	658000	658005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502468
12605	NC_018722	CCT	2	6	658067	658072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502468
12606	NC_018722	CTT	2	6	658089	658094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502468
12607	NC_018722	TCT	2	6	658097	658102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502468
12608	NC_018722	CACT	2	8	658228	658235	25 %	25 %	0 %	50 %	408502469
12609	NC_018722	T	7	7	658310	658316	0 %	100 %	0 %	0 %	408502469
12610	NC_018722	GTC	2	6	658330	658335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502469
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12613	NC_018722	GCT	2	6	658461	658466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502469
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12620	NC_018722	CG	3	6	658716	658721	0 %	0 %	50 %	50 %	408502469
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12622	NC_018722	GCA	2	6	658746	658751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502469
12623	NC_018722	TAA	2	6	658914	658919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502469
12624	NC_018722	CAG	2	6	658932	658937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502469
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12628	NC_018722	CAT	2	6	659044	659049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502469
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12735	NC_018722	CTGCTC	2	12	664113	664124	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	408502473
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12739	NC_018722	GC	4	8	664323	664330	0 %	0 %	50 %	50 %	408502473
12740	NC_018722	CTC	2	6	664341	664346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502473
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12742	NC_018722	A	6	6	664443	664448	100 %	0 %	0 %	0 %	408502473
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12988	NC_018722	CG	3	6	677687	677692	0 %	0 %	50 %	50 %	408502485
12989	NC_018722	TGA	2	6	677706	677711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502485
12990	NC_018722	CG	4	8	677744	677751	0 %	0 %	50 %	50 %	408502485
12991	NC_018722	T	7	7	677862	677868	0 %	100 %	0 %	0 %	408502485
12992	NC_018722	TGC	2	6	677898	677903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502485
12993	NC_018722	CTG	2	6	677951	677956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502485
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12996	NC_018722	CG	3	6	678195	678200	0 %	0 %	50 %	50 %	408502485
12997	NC_018722	GC	3	6	678263	678268	0 %	0 %	50 %	50 %	408502485
12998	NC_018722	GC	3	6	678311	678316	0 %	0 %	50 %	50 %	408502485
12999	NC_018722	AG	3	6	678386	678391	50 %	0 %	50 %	0 %	408502485
13000	NC_018722	TGC	2	6	678399	678404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502485

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