MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_018722	CA	3	6	580094	580099	50 %	0 %	0 %	50 %	408502403
11002	NC_018722	A	6	6	580106	580111	100 %	0 %	0 %	0 %	408502404
11003	NC_018722	AAGG	2	8	580121	580128	50 %	0 %	50 %	0 %	408502404
11004	NC_018722	TCC	3	9	580146	580154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502404
11005	NC_018722	CTTC	2	8	580267	580274	0 %	50 %	0 %	50 %	408502404
11006	NC_018722	GCC	2	6	580290	580295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502404
11007	NC_018722	GGA	2	6	580463	580468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502405
11008	NC_018722	AGCACC	2	12	580531	580542	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	408502405
11009	NC_018722	CCA	2	6	580561	580566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502405
11010	NC_018722	GCTT	2	8	580583	580590	0 %	50 %	25 %	25 %	408502405
11011	NC_018722	CTG	2	6	580591	580596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502405
11012	NC_018722	CGC	2	6	580597	580602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502405
11013	NC_018722	GTC	2	6	580618	580623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502405
11014	NC_018722	CAA	2	6	580636	580641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502405
11015	NC_018722	GAAA	2	8	580647	580654	75 %	0 %	25 %	0 %	408502405
11016	NC_018722	A	6	6	580663	580668	100 %	0 %	0 %	0 %	408502405
11017	NC_018722	CCA	2	6	580754	580759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502405
11018	NC_018722	ACC	2	6	580799	580804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502405
11019	NC_018722	ACC	3	9	580814	580822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502405
11020	NC_018722	GC	3	6	581016	581021	0 %	0 %	50 %	50 %	408502406
11021	NC_018722	CG	3	6	581101	581106	0 %	0 %	50 %	50 %	408502406
11022	NC_018722	CCG	2	6	581125	581130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502406
11023	NC_018722	ACT	2	6	581179	581184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502406
11024	NC_018722	CA	3	6	581251	581256	50 %	0 %	0 %	50 %	408502406
11025	NC_018722	CA	3	6	581294	581299	50 %	0 %	0 %	50 %	408502406
11026	NC_018722	GC	3	6	581314	581319	0 %	0 %	50 %	50 %	408502406
11027	NC_018722	TGAT	2	8	581428	581435	25 %	50 %	25 %	0 %	408502406
11028	NC_018722	C	6	6	581543	581548	0 %	0 %	0 %	100 %	408502406
11029	NC_018722	ACT	2	6	581556	581561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502406
11030	NC_018722	GC	3	6	581570	581575	0 %	0 %	50 %	50 %	408502406
11031	NC_018722	AAG	2	6	581577	581582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502406
11032	NC_018722	ATGT	2	8	581644	581651	25 %	50 %	25 %	0 %	408502406
11033	NC_018722	ACC	2	6	581658	581663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502406
11034	NC_018722	C	6	6	581971	581976	0 %	0 %	0 %	100 %	408502407
11035	NC_018722	CTG	2	6	582020	582025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502407
11036	NC_018722	TCC	2	6	582036	582041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502407
11037	NC_018722	ACC	2	6	582313	582318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502407
11038	NC_018722	AC	3	6	582320	582325	50 %	0 %	0 %	50 %	408502407
11039	NC_018722	TCC	2	6	582376	582381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502407
11040	NC_018722	TCCC	2	8	582434	582441	0 %	25 %	0 %	75 %	408502407
11041	NC_018722	GAT	2	6	582444	582449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502407
11042	NC_018722	AGA	2	6	582495	582500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502407
11043	NC_018722	CAC	2	6	582509	582514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502407
11044	NC_018722	CCA	2	6	582524	582529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502407
11045	NC_018722	ACC	2	6	582625	582630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502407
11046	NC_018722	CAT	2	6	582665	582670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502407
11047	NC_018722	CTT	2	6	582855	582860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502407
11048	NC_018722	AATG	2	8	582903	582910	50 %	25 %	25 %	0 %	408502407
11049	NC_018722	TCTT	2	8	582934	582941	0 %	75 %	0 %	25 %	408502407
11050	NC_018722	GAT	2	6	583023	583028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502407
11051	NC_018722	CTG	2	6	583046	583051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502407
11052	NC_018722	CG	3	6	583058	583063	0 %	0 %	50 %	50 %	408502407
11053	NC_018722	GTC	2	6	583065	583070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502407
11054	NC_018722	ACCAT	2	10	583075	583084	40 %	20 %	0 %	40 %	408502407
11055	NC_018722	ACA	2	6	583117	583122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502407
11056	NC_018722	CAT	2	6	583161	583166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502407
11057	NC_018722	CTC	2	6	583167	583172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502408
11058	NC_018722	A	7	7	583233	583239	100 %	0 %	0 %	0 %	408502408
11059	NC_018722	TCGG	2	8	583255	583262	0 %	25 %	50 %	25 %	408502408
11060	NC_018722	CCTG	2	8	583283	583290	0 %	25 %	25 %	50 %	408502408
11061	NC_018722	TTG	2	6	583334	583339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502408
11062	NC_018722	GTT	2	6	583747	583752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502409
11063	NC_018722	ATCT	2	8	583829	583836	25 %	50 %	0 %	25 %	408502409
11064	NC_018722	CTT	2	6	583867	583872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502409
11065	NC_018722	AAAG	2	8	583897	583904	75 %	0 %	25 %	0 %	408502409
11066	NC_018722	GCT	2	6	583921	583926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502409
11067	NC_018722	ATT	2	6	583929	583934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502409
11068	NC_018722	CCG	2	6	583988	583993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502409
11069	NC_018722	ACGG	2	8	584147	584154	25 %	0 %	50 %	25 %	408502410
11070	NC_018722	AAG	2	6	584164	584169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502410
11071	NC_018722	TGT	2	6	584418	584423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502410
11072	NC_018722	TAG	2	6	584427	584432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502410
11073	NC_018722	GAA	3	9	584453	584461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502410
11074	NC_018722	TTGC	2	8	584477	584484	0 %	50 %	25 %	25 %	408502410
11075	NC_018722	A	6	6	584493	584498	100 %	0 %	0 %	0 %	408502410
11076	NC_018722	CG	3	6	584499	584504	0 %	0 %	50 %	50 %	408502410
11077	NC_018722	TTGC	2	8	584507	584514	0 %	50 %	25 %	25 %	408502410
11078	NC_018722	CGA	2	6	584554	584559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502410
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11080	NC_018722	TGC	2	6	584589	584594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502410
11081	NC_018722	CGC	2	6	584623	584628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502410
11082	NC_018722	CTG	2	6	584643	584648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502410
11083	NC_018722	GA	3	6	584710	584715	50 %	0 %	50 %	0 %	408502410
11084	NC_018722	GCG	2	6	584729	584734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502410
11085	NC_018722	CGCA	2	8	584835	584842	25 %	0 %	25 %	50 %	408502410
11086	NC_018722	GAA	2	6	584950	584955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502410
11087	NC_018722	CG	3	6	584993	584998	0 %	0 %	50 %	50 %	408502410
11088	NC_018722	CTC	2	6	585008	585013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502410
11089	NC_018722	CA	3	6	585074	585079	50 %	0 %	0 %	50 %	408502410
11090	NC_018722	CGC	2	6	585127	585132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502411
11091	NC_018722	GGGC	2	8	585135	585142	0 %	0 %	75 %	25 %	408502411
11092	NC_018722	CA	4	8	585174	585181	50 %	0 %	0 %	50 %	408502411
11093	NC_018722	ATA	2	6	585193	585198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502411
11094	NC_018722	CGA	2	6	585251	585256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502411
11095	NC_018722	GA	3	6	585255	585260	50 %	0 %	50 %	0 %	408502411
11096	NC_018722	T	6	6	585299	585304	0 %	100 %	0 %	0 %	408502411
11097	NC_018722	AGA	2	6	585388	585393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502411
11098	NC_018722	AGA	2	6	585443	585448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502411
11099	NC_018722	AAT	2	6	585474	585479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502411
11100	NC_018722	A	7	7	585523	585529	100 %	0 %	0 %	0 %	408502411
11101	NC_018722	A	6	6	585543	585548	100 %	0 %	0 %	0 %	408502411
11102	NC_018722	GTAC	2	8	585556	585563	25 %	25 %	25 %	25 %	408502411
11103	NC_018722	TG	3	6	585674	585679	0 %	50 %	50 %	0 %	408502411
11104	NC_018722	CAG	2	6	585687	585692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502411
11105	NC_018722	AGCAGA	2	12	585715	585726	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	408502411
11106	NC_018722	GC	3	6	585786	585791	0 %	0 %	50 %	50 %	408502411
11107	NC_018722	GC	3	6	585899	585904	0 %	0 %	50 %	50 %	408502411
11108	NC_018722	CA	3	6	585918	585923	50 %	0 %	0 %	50 %	408502411
11109	NC_018722	CTT	2	6	585966	585971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502411
11110	NC_018722	GACA	2	8	585981	585988	50 %	0 %	25 %	25 %	408502411
11111	NC_018722	GC	3	6	586005	586010	0 %	0 %	50 %	50 %	408502411
11112	NC_018722	TAA	2	6	586050	586055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408502411
11113	NC_018722	CG	3	6	586086	586091	0 %	0 %	50 %	50 %	408502411
11114	NC_018722	TCA	2	6	586265	586270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502411
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11116	NC_018722	CGG	2	6	586323	586328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502411
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11118	NC_018722	AG	3	6	586676	586681	50 %	0 %	50 %	0 %	408502411
11119	NC_018722	GTG	2	6	586709	586714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502411
11120	NC_018722	C	6	6	586749	586754	0 %	0 %	0 %	100 %	408502411
11121	NC_018722	GAA	2	6	586755	586760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502411
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11123	NC_018722	ACTC	2	8	586876	586883	25 %	25 %	0 %	50 %	408502412
11124	NC_018722	GCA	2	6	586885	586890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502412
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11127	NC_018722	GCA	2	6	587113	587118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502412
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11246	NC_018722	GCG	2	6	593244	593249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502416
11247	NC_018722	AGAT	2	8	593284	593291	50 %	25 %	25 %	0 %	408502416
11248	NC_018722	CG	4	8	593318	593325	0 %	0 %	50 %	50 %	408502416
11249	NC_018722	GGT	2	6	593385	593390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502416
11250	NC_018722	CGC	2	6	593433	593438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502416
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11258	NC_018722	GC	3	6	594065	594070	0 %	0 %	50 %	50 %	408502417
11259	NC_018722	CTTCT	2	10	594071	594080	0 %	60 %	0 %	40 %	408502417
11260	NC_018722	AGT	2	6	594123	594128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502417
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11273	NC_018722	GCG	2	6	594809	594814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502417
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11282	NC_018722	CTCG	2	8	595446	595453	0 %	25 %	25 %	50 %	408502418
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11309	NC_018722	GC	5	10	596359	596368	0 %	0 %	50 %	50 %	408502418
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11353	NC_018722	CA	3	6	598195	598200	50 %	0 %	0 %	50 %	408502419
11354	NC_018722	CG	3	6	598246	598251	0 %	0 %	50 %	50 %	408502419
11355	NC_018722	GAT	2	6	598311	598316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502419
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11359	NC_018722	TTC	2	6	598457	598462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502419
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11361	NC_018722	CTG	2	6	598538	598543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502419
11362	NC_018722	TGC	3	9	598572	598580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502419
11363	NC_018722	CGTG	2	8	598589	598596	0 %	25 %	50 %	25 %	408502419
11364	NC_018722	GGC	2	6	598682	598687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502419
11365	NC_018722	GTACG	2	10	598726	598735	20 %	20 %	40 %	20 %	408502419
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11488	NC_018722	C	6	6	604027	604032	0 %	0 %	0 %	100 %	408502424
11489	NC_018722	AGC	2	6	604046	604051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502424
11490	NC_018722	CTC	2	6	604315	604320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502425
11491	NC_018722	ACCG	2	8	604325	604332	25 %	0 %	25 %	50 %	408502425
11492	NC_018722	ACC	2	6	604408	604413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502425
11493	NC_018722	GAC	2	6	604431	604436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502425
11494	NC_018722	TGCG	2	8	604499	604506	0 %	25 %	50 %	25 %	408502425
11495	NC_018722	ACGC	2	8	604551	604558	25 %	0 %	25 %	50 %	408502425
11496	NC_018722	CGT	2	6	604621	604626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502425
11497	NC_018722	GC	3	6	604646	604651	0 %	0 %	50 %	50 %	408502425
11498	NC_018722	CAC	2	6	604680	604685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502425
11499	NC_018722	CGC	2	6	604763	604768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502425
11500	NC_018722	CTC	2	6	604774	604779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	408502425

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