MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7003	NC_018722	GCAA	2	8	383643	383650	50 %	0 %	25 %	25 %	408502239
7004	NC_018722	GCG	3	9	383971	383979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502240
7005	NC_018722	GGT	2	6	384012	384017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502240
7006	NC_018722	TTG	2	6	384029	384034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502240
7007	NC_018722	GAA	2	6	384048	384053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502240
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7009	NC_018722	GGT	2	6	384153	384158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502241
7010	NC_018722	AGG	2	6	384211	384216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502241
7011	NC_018722	TGT	2	6	384233	384238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502241
7012	NC_018722	GCCGT	2	10	384365	384374	0 %	20 %	40 %	40 %	408502241
7013	NC_018722	GCG	2	6	384391	384396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502241
7014	NC_018722	GTG	2	6	384474	384479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502241
7015	NC_018722	CTGA	2	8	384515	384522	25 %	25 %	25 %	25 %	408502241
7016	NC_018722	TGG	2	6	384560	384565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502241
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7021	NC_018722	GTTG	2	8	384929	384936	0 %	50 %	50 %	0 %	408502241
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7041	NC_018722	GGA	2	6	386113	386118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502243
7042	NC_018722	CTGC	2	8	386153	386160	0 %	25 %	25 %	50 %	408502243
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7054	NC_018722	GCG	2	6	386685	386690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502243
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7057	NC_018722	T	6	6	386972	386977	0 %	100 %	0 %	0 %	408502243
7058	NC_018722	CTTA	2	8	386991	386998	25 %	50 %	0 %	25 %	408502243
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7061	NC_018722	TCT	2	6	387125	387130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502243
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7070	NC_018722	GC	3	6	387427	387432	0 %	0 %	50 %	50 %	408502243
7071	NC_018722	GT	3	6	387525	387530	0 %	50 %	50 %	0 %	408502243
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7245	NC_018722	T	6	6	396621	396626	0 %	100 %	0 %	0 %	408502251
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7371	NC_018722	TG	3	6	403097	403102	0 %	50 %	50 %	0 %	408502256
7372	NC_018722	AC	3	6	403139	403144	50 %	0 %	0 %	50 %	408502256
7373	NC_018722	GC	4	8	403237	403244	0 %	0 %	50 %	50 %	408502256
7374	NC_018722	AGC	2	6	403257	403262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502256
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7377	NC_018722	A	6	6	403337	403342	100 %	0 %	0 %	0 %	408502256
7378	NC_018722	AAC	2	6	403344	403349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502256
7379	NC_018722	GTG	2	6	403369	403374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502256
7380	NC_018722	GCACA	2	10	403376	403385	40 %	0 %	20 %	40 %	408502256
7381	NC_018722	AGC	2	6	403416	403421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502256
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7384	NC_018722	GAA	2	6	403490	403495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502256
7385	NC_018722	TTCTG	2	10	403503	403512	0 %	60 %	20 %	20 %	408502256
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7389	NC_018722	GCT	2	6	403767	403772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502257
7390	NC_018722	GTC	2	6	403825	403830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502257
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7392	NC_018722	T	6	6	403954	403959	0 %	100 %	0 %	0 %	408502257
7393	NC_018722	ATCG	2	8	403960	403967	25 %	25 %	25 %	25 %	408502257
7394	NC_018722	T	6	6	404042	404047	0 %	100 %	0 %	0 %	408502257
7395	NC_018722	CCAG	2	8	404095	404102	25 %	0 %	25 %	50 %	408502257
7396	NC_018722	TTG	2	6	404149	404154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502257
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7402	NC_018722	GC	4	8	404382	404389	0 %	0 %	50 %	50 %	408502257
7403	NC_018722	C	7	7	404472	404478	0 %	0 %	0 %	100 %	408502257
7404	NC_018722	ATC	3	9	404494	404502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	408502257
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7406	NC_018722	A	6	6	404512	404517	100 %	0 %	0 %	0 %	408502257
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7462	NC_018722	CGCAC	2	10	406990	406999	20 %	0 %	20 %	60 %	408502258
7463	NC_018722	TCT	2	6	407091	407096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502258
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7480	NC_018722	CGT	2	6	407951	407956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502258
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7483	NC_018722	TGC	2	6	408182	408187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502258
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7487	NC_018722	TTGGC	2	10	408435	408444	0 %	40 %	40 %	20 %	408502259
7488	NC_018722	GTAG	2	8	408452	408459	25 %	25 %	50 %	0 %	408502259
7489	NC_018722	CAG	2	6	408495	408500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502259
7490	NC_018722	A	7	7	408510	408516	100 %	0 %	0 %	0 %	408502259
7491	NC_018722	TGC	2	6	408603	408608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502259
7492	NC_018722	AGA	2	6	408613	408618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502259
7493	NC_018722	CAG	2	6	408804	408809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502259
7494	NC_018722	CGG	2	6	408826	408831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502259
7495	NC_018722	TGA	2	6	408833	408838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502259
7496	NC_018722	CA	3	6	408923	408928	50 %	0 %	0 %	50 %	408502259
7497	NC_018722	A	7	7	408946	408952	100 %	0 %	0 %	0 %	408502259
7498	NC_018722	CG	4	8	408966	408973	0 %	0 %	50 %	50 %	408502259
7499	NC_018722	AGC	2	6	408991	408996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502259
7500	NC_018722	AGC	2	6	409015	409020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502259

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