MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Mexico A chromosome

Total Repeats: 21915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_018722	AG	3	6	333674	333679	50 %	0 %	50 %	0 %	408502200
6003	NC_018722	TCT	2	6	333712	333717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502200
6004	NC_018722	TTAG	2	8	333765	333772	25 %	50 %	25 %	0 %	408502200
6005	NC_018722	GCA	2	6	333798	333803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502200
6006	NC_018722	CAC	2	6	333908	333913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502200
6007	NC_018722	CCG	2	6	333939	333944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502200
6008	NC_018722	TTA	2	6	333963	333968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408502200
6009	NC_018722	GGTG	2	8	334039	334046	0 %	25 %	75 %	0 %	408502200
6010	NC_018722	AGA	2	6	334169	334174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408502200
6011	NC_018722	AC	3	6	334238	334243	50 %	0 %	0 %	50 %	408502200
6012	NC_018722	ACGC	2	8	334279	334286	25 %	0 %	25 %	50 %	408502200
6013	NC_018722	CTG	2	6	334310	334315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502200
6014	NC_018722	TCT	3	9	334336	334344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502200
6015	NC_018722	CTT	2	6	334348	334353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502200
6016	NC_018722	TTG	2	6	334445	334450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502200
6017	NC_018722	GCAA	2	8	334494	334501	50 %	0 %	25 %	25 %	408502200
6018	NC_018722	TCT	2	6	334515	334520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502200
6019	NC_018722	TGA	2	6	334540	334545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502200
6020	NC_018722	TGC	2	6	334553	334558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502200
6021	NC_018722	CAC	2	6	334640	334645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502200
6022	NC_018722	GCA	2	6	334663	334668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502200
6023	NC_018722	AGG	2	6	334721	334726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502200
6024	NC_018722	CTT	2	6	334868	334873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502200
6025	NC_018722	CCAG	2	8	334885	334892	25 %	0 %	25 %	50 %	408502200
6026	NC_018722	TG	3	6	334962	334967	0 %	50 %	50 %	0 %	408502200
6027	NC_018722	CAG	2	6	335075	335080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502200
6028	NC_018722	TCT	2	6	335133	335138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502200
6029	NC_018722	TACT	2	8	335223	335230	25 %	50 %	0 %	25 %	408502200
6030	NC_018722	GA	3	6	335274	335279	50 %	0 %	50 %	0 %	408502200
6031	NC_018722	GCC	2	6	335339	335344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502200
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6033	NC_018722	TTC	2	6	335445	335450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502200
6034	NC_018722	AGTGT	2	10	335476	335485	20 %	40 %	40 %	0 %	408502200
6035	NC_018722	TGC	2	6	335586	335591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502200
6036	NC_018722	GTGG	2	8	335603	335610	0 %	25 %	75 %	0 %	408502200
6037	NC_018722	GTA	2	6	335649	335654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502200
6038	NC_018722	CGCT	2	8	335806	335813	0 %	25 %	25 %	50 %	408502200
6039	NC_018722	CAC	3	9	335822	335830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502200
6040	NC_018722	AC	3	6	335829	335834	50 %	0 %	0 %	50 %	408502200
6041	NC_018722	C	11	11	335873	335883	0 %	0 %	0 %	100 %	408502201
6042	NC_018722	TAG	2	6	335893	335898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502201
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6044	NC_018722	CAC	2	6	335935	335940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	408502201
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6047	NC_018722	CG	3	6	336041	336046	0 %	0 %	50 %	50 %	408502202
6048	NC_018722	T	6	6	336057	336062	0 %	100 %	0 %	0 %	408502202
6049	NC_018722	TGC	2	6	336069	336074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502202
6050	NC_018722	GCT	2	6	336081	336086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502202
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6052	NC_018722	TCG	2	6	336141	336146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502202
6053	NC_018722	CAG	2	6	336194	336199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408502202
6054	NC_018722	AAC	2	6	336233	336238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	408502202
6055	NC_018722	GTT	2	6	336431	336436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502202
6056	NC_018722	GCG	2	6	336485	336490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502202
6057	NC_018722	ATG	2	6	336551	336556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408502202
6058	NC_018722	CT	3	6	336558	336563	0 %	50 %	0 %	50 %	408502202
6059	NC_018722	G	6	6	336715	336720	0 %	0 %	100 %	0 %	408502202
6060	NC_018722	GC	3	6	336746	336751	0 %	0 %	50 %	50 %	408502202
6061	NC_018722	TCG	2	6	336754	336759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502202
6062	NC_018722	ATGG	2	8	336809	336816	25 %	25 %	50 %	0 %	408502202
6063	NC_018722	GCGGA	2	10	336878	336887	20 %	0 %	60 %	20 %	408502202
6064	NC_018722	G	6	6	336920	336925	0 %	0 %	100 %	0 %	408502202
6065	NC_018722	GAG	2	6	337022	337027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	408502202
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6070	NC_018722	CGT	2	6	337159	337164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502203
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6094	NC_018722	GC	3	6	338123	338128	0 %	0 %	50 %	50 %	408502204
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6096	NC_018722	GGTGC	2	10	338212	338221	0 %	20 %	60 %	20 %	408502204
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6107	NC_018722	CG	3	6	338667	338672	0 %	0 %	50 %	50 %	408502204
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6371	NC_018722	CGG	2	6	352855	352860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	408502211
6372	NC_018722	GCT	2	6	352910	352915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502211
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6462	NC_018722	GT	3	6	357896	357901	0 %	50 %	50 %	0 %	408502215
6463	NC_018722	CG	3	6	357906	357911	0 %	0 %	50 %	50 %	408502215
6464	NC_018722	CG	3	6	357916	357921	0 %	0 %	50 %	50 %	408502215
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6470	NC_018722	G	6	6	358147	358152	0 %	0 %	100 %	0 %	408502215
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6486	NC_018722	CT	3	6	358869	358874	0 %	50 %	0 %	50 %	408502216
6487	NC_018722	CTGC	2	8	358927	358934	0 %	25 %	25 %	50 %	408502216
6488	NC_018722	GTGCA	2	10	358988	358997	20 %	20 %	40 %	20 %	408502216
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6491	NC_018722	CTT	2	6	359048	359053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408502216
6492	NC_018722	A	7	7	359068	359074	100 %	0 %	0 %	0 %	408502216
6493	NC_018722	GGGAA	2	10	359107	359116	40 %	0 %	60 %	0 %	408502216
6494	NC_018722	GAAG	2	8	359139	359146	50 %	0 %	50 %	0 %	408502216
6495	NC_018722	GCC	2	6	359188	359193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408502216
6496	NC_018722	AT	3	6	359288	359293	50 %	50 %	0 %	0 %	408502216
6497	NC_018722	GTG	2	6	359302	359307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408502216
6498	NC_018722	TGC	2	6	359316	359321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408502217
6499	NC_018722	GT	3	6	359394	359399	0 %	50 %	50 %	0 %	408502217
6500	NC_018722	TTG	2	6	359416	359421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408502217

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