MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018015	CCT	2	6	189810	189815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960377
3502	NC_018015	CTTC	2	8	189906	189913	0 %	50 %	0 %	50 %	390960377
3503	NC_018015	CTC	2	6	189959	189964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960377
3504	NC_018015	GCC	2	6	190004	190009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960377
3505	NC_018015	TG	3	6	190042	190047	0 %	50 %	50 %	0 %	390960377
3506	NC_018015	TAT	2	6	190087	190092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960377
3507	NC_018015	TTA	2	6	190134	190139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960377
3508	NC_018015	TCA	2	6	190208	190213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960377
3509	NC_018015	AGG	2	6	190220	190225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960377
3510	NC_018015	CCT	2	6	190255	190260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960377
3511	NC_018015	CGG	2	6	190273	190278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960377
3512	NC_018015	GCG	2	6	190322	190327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960377
3513	NC_018015	CTTTT	2	10	190357	190366	0 %	80 %	0 %	20 %	390960377
3514	NC_018015	CTC	2	6	190726	190731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960377
3515	NC_018015	TTG	2	6	190766	190771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960377
3516	NC_018015	CTCC	2	8	190816	190823	0 %	25 %	0 %	75 %	390960377
3517	NC_018015	CG	3	6	190884	190889	0 %	0 %	50 %	50 %	390960377
3518	NC_018015	CCT	3	9	190926	190934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960377
3519	NC_018015	A	6	6	191066	191071	100 %	0 %	0 %	0 %	390960378
3520	NC_018015	GAT	2	6	191106	191111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960378
3521	NC_018015	AGG	2	6	191126	191131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960378
3522	NC_018015	GAA	2	6	191202	191207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960378
3523	NC_018015	TCG	2	6	191210	191215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960378
3524	NC_018015	CGAGC	2	10	191301	191310	20 %	0 %	40 %	40 %	390960378
3525	NC_018015	AAG	2	6	191317	191322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960378
3526	NC_018015	GGA	2	6	191328	191333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960378
3527	NC_018015	GAA	2	6	191453	191458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960378
3528	NC_018015	AAG	2	6	191469	191474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960378
3529	NC_018015	TAT	2	6	191616	191621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960379
3530	NC_018015	GAC	2	6	191664	191669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960379
3531	NC_018015	TGG	2	6	191672	191677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960379
3532	NC_018015	A	6	6	191757	191762	100 %	0 %	0 %	0 %	390960379
3533	NC_018015	CTT	2	6	191772	191777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960379
3534	NC_018015	CCT	3	9	191834	191842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960379
3535	NC_018015	GTA	2	6	191910	191915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960379
3536	NC_018015	ACG	2	6	191938	191943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960379
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3538	NC_018015	CCTT	2	8	192125	192132	0 %	50 %	0 %	50 %	390960379
3539	NC_018015	ACG	2	6	192334	192339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960379
3540	NC_018015	ACG	2	6	192373	192378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960379
3541	NC_018015	GAC	2	6	192423	192428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960379
3542	NC_018015	ACC	2	6	192433	192438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960379
3543	NC_018015	CGGA	2	8	192468	192475	25 %	0 %	50 %	25 %	390960379
3544	NC_018015	TTC	2	6	192588	192593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960379
3545	NC_018015	TCT	2	6	192638	192643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960380
3546	NC_018015	CCT	2	6	192776	192781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960380
3547	NC_018015	CCT	2	6	192791	192796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960380
3548	NC_018015	CGG	2	6	192837	192842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960380
3549	NC_018015	TC	3	6	192894	192899	0 %	50 %	0 %	50 %	390960380
3550	NC_018015	GTC	2	6	192924	192929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960380
3551	NC_018015	CTC	2	6	192981	192986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960380
3552	NC_018015	CTGTC	2	10	193037	193046	0 %	40 %	20 %	40 %	390960380
3553	NC_018015	TGGC	2	8	193056	193063	0 %	25 %	50 %	25 %	390960380
3554	NC_018015	CCTC	2	8	193082	193089	0 %	25 %	0 %	75 %	390960380
3555	NC_018015	GAG	2	6	193098	193103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960380
3556	NC_018015	AGG	2	6	193176	193181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960380
3557	NC_018015	CAG	2	6	193245	193250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960380
3558	NC_018015	TTC	2	6	193330	193335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960380
3559	NC_018015	CGA	2	6	193343	193348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960380
3560	NC_018015	CTC	2	6	193350	193355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960380
3561	NC_018015	TTTCTC	2	12	193369	193380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960380
3562	NC_018015	TCG	2	6	193417	193422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960380
3563	NC_018015	TCG	2	6	193492	193497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960380
3564	NC_018015	TCC	2	6	193543	193548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960380
3565	NC_018015	TCG	3	9	193586	193594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960380
3566	NC_018015	TCG	2	6	193651	193656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960380
3567	NC_018015	CCTC	2	8	193724	193731	0 %	25 %	0 %	75 %	390960380
3568	NC_018015	CCCT	2	8	193783	193790	0 %	25 %	0 %	75 %	390960380
3569	NC_018015	CTT	2	6	193857	193862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960380
3570	NC_018015	CCT	2	6	193916	193921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960380
3571	NC_018015	GCTC	2	8	193946	193953	0 %	25 %	25 %	50 %	390960380
3572	NC_018015	AG	3	6	194180	194185	50 %	0 %	50 %	0 %	390960381
3573	NC_018015	CAC	2	6	194270	194275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960381
3574	NC_018015	GCT	2	6	194277	194282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960381
3575	NC_018015	GGA	2	6	194291	194296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960381
3576	NC_018015	A	6	6	194308	194313	100 %	0 %	0 %	0 %	390960381
3577	NC_018015	CGA	2	6	194420	194425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960381
3578	NC_018015	TCA	2	6	194467	194472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960381
3579	NC_018015	GATA	2	8	194486	194493	50 %	25 %	25 %	0 %	390960381
3580	NC_018015	GCC	3	9	194517	194525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960381
3581	NC_018015	GAG	2	6	194628	194633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960381
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3583	NC_018015	GAA	2	6	194970	194975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960382
3584	NC_018015	TGC	2	6	195002	195007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960382
3585	NC_018015	GAA	2	6	195043	195048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960382
3586	NC_018015	GAT	2	6	195096	195101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960382
3587	NC_018015	CTA	2	6	195117	195122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960382
3588	NC_018015	CT	3	6	195123	195128	0 %	50 %	0 %	50 %	390960382
3589	NC_018015	TAA	3	9	195143	195151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390960382
3590	NC_018015	CAC	2	6	195241	195246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960382
3591	NC_018015	TTC	2	6	195247	195252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960382
3592	NC_018015	TCC	2	6	195289	195294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960382
3593	NC_018015	CAA	2	6	195297	195302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960382
3594	NC_018015	TCC	2	6	195353	195358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960382
3595	NC_018015	GCC	2	6	195380	195385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960382
3596	NC_018015	ACC	2	6	195433	195438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960382
3597	NC_018015	CAT	2	6	195480	195485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960382
3598	NC_018015	CTG	2	6	195508	195513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960382
3599	NC_018015	CA	3	6	195518	195523	50 %	0 %	0 %	50 %	390960382
3600	NC_018015	GTTG	2	8	195532	195539	0 %	50 %	50 %	0 %	390960382
3601	NC_018015	AGA	2	6	195629	195634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960383
3602	NC_018015	AG	3	6	195650	195655	50 %	0 %	50 %	0 %	390960383
3603	NC_018015	CCA	2	6	195857	195862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960383
3604	NC_018015	ACA	2	6	195872	195877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390960383
3605	NC_018015	GA	3	6	195916	195921	50 %	0 %	50 %	0 %	390960383
3606	NC_018015	GA	3	6	195927	195932	50 %	0 %	50 %	0 %	390960383
3607	NC_018015	CTG	2	6	196016	196021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960384
3608	NC_018015	CAG	2	6	196075	196080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960384
3609	NC_018015	GAAG	2	8	196128	196135	50 %	0 %	50 %	0 %	390960384
3610	NC_018015	ATT	2	6	196160	196165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960384
3611	NC_018015	CGG	2	6	196188	196193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960384
3612	NC_018015	GTC	2	6	196208	196213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960384
3613	NC_018015	GTCGC	2	10	196250	196259	0 %	20 %	40 %	40 %	390960384
3614	NC_018015	TCC	2	6	196272	196277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960384
3615	NC_018015	CGC	2	6	196351	196356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960384
3616	NC_018015	GCA	2	6	196436	196441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960384
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3618	NC_018015	AGG	2	6	196626	196631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960384
3619	NC_018015	CGA	2	6	196761	196766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960385
3620	NC_018015	TCC	2	6	196802	196807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960385
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3622	NC_018015	GTAT	2	8	196821	196828	25 %	50 %	25 %	0 %	390960385
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3856	NC_018015	G	6	6	210132	210137	0 %	0 %	100 %	0 %	390960408
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3863	NC_018015	GAT	2	6	210415	210420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960408
3864	NC_018015	TCC	2	6	210426	210431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960408
3865	NC_018015	TCC	2	6	210480	210485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960408
3866	NC_018015	AGC	2	6	210489	210494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960408
3867	NC_018015	GAG	2	6	210505	210510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960408
3868	NC_018015	GAC	2	6	210518	210523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960408
3869	NC_018015	TCG	2	6	210540	210545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960408
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3871	NC_018015	G	6	6	210574	210579	0 %	0 %	100 %	0 %	390960408
3872	NC_018015	GGA	2	6	210613	210618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960408
3873	NC_018015	TCA	2	6	210639	210644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960408
3874	NC_018015	TGGCCT	2	12	210681	210692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960408
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3876	NC_018015	TGG	2	6	210826	210831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960408
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3878	NC_018015	GAT	2	6	210926	210931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960408
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3882	NC_018015	TCA	2	6	211066	211071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960409
3883	NC_018015	AGCG	2	8	211086	211093	25 %	0 %	50 %	25 %	390960409
3884	NC_018015	GAG	2	6	211104	211109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960409
3885	NC_018015	CTT	2	6	211127	211132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960409
3886	NC_018015	AGGT	2	8	211210	211217	25 %	25 %	50 %	0 %	390960409
3887	NC_018015	GTT	2	6	211299	211304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960409
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3889	NC_018015	AGG	2	6	211324	211329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960409
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3892	NC_018015	CTC	2	6	211627	211632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960410
3893	NC_018015	TTCA	2	8	211640	211647	25 %	50 %	0 %	25 %	390960410
3894	NC_018015	TC	3	6	211683	211688	0 %	50 %	0 %	50 %	390960410
3895	NC_018015	CTG	2	6	211711	211716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960410
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3899	NC_018015	CGAA	2	8	211889	211896	50 %	0 %	25 %	25 %	390960410
3900	NC_018015	CTT	2	6	211920	211925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960410
3901	NC_018015	CGG	2	6	211935	211940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960410
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3922	NC_018015	GCTC	2	8	212576	212583	0 %	25 %	25 %	50 %	390960411
3923	NC_018015	CG	3	6	212626	212631	0 %	0 %	50 %	50 %	390960411
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3978	NC_018015	CGT	2	6	215477	215482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960415
3979	NC_018015	AGC	2	6	215494	215499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960415
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3982	NC_018015	GC	3	6	215624	215629	0 %	0 %	50 %	50 %	390960415
3983	NC_018015	TCC	2	6	215872	215877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960415
3984	NC_018015	TCC	2	6	216003	216008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960415
3985	NC_018015	CGT	2	6	216021	216026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960415
3986	NC_018015	CTT	2	6	216108	216113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960415
3987	NC_018015	TTA	2	6	216139	216144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960416
3988	NC_018015	CTC	2	6	216167	216172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960416
3989	NC_018015	CAG	2	6	216254	216259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960416
3990	NC_018015	GCT	2	6	216292	216297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960416
3991	NC_018015	GTA	2	6	216305	216310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960416
3992	NC_018015	TCA	2	6	216313	216318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960416
3993	NC_018015	GTG	2	6	216339	216344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960416
3994	NC_018015	CTC	3	9	216386	216394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960416
3995	NC_018015	TCC	2	6	216396	216401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960416
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3997	NC_018015	GCG	2	6	216432	216437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960416
3998	NC_018015	GT	3	6	216595	216600	0 %	50 %	50 %	0 %	390960416
3999	NC_018015	CAG	2	6	216707	216712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960416
4000	NC_018015	AGCC	2	8	216998	217005	25 %	0 %	25 %	50 %	390960417

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