MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_018015	AT	3	6	1900741	1900746	50 %	50 %	0 %	0 %	390962141
35502	NC_018015	CTC	2	6	1900765	1900770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962142
35503	NC_018015	TCT	2	6	1900798	1900803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962142
35504	NC_018015	CTC	2	6	1900878	1900883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962142
35505	NC_018015	GTGC	2	8	1900896	1900903	0 %	25 %	50 %	25 %	390962142
35506	NC_018015	GAG	2	6	1900920	1900925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962142
35507	NC_018015	TCCT	2	8	1900994	1901001	0 %	50 %	0 %	50 %	390962142
35508	NC_018015	TCG	2	6	1901021	1901026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962142
35509	NC_018015	CTC	2	6	1901103	1901108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962142
35510	NC_018015	TC	3	6	1901248	1901253	0 %	50 %	0 %	50 %	390962142
35511	NC_018015	TCCT	2	8	1901263	1901270	0 %	50 %	0 %	50 %	390962142
35512	NC_018015	CCAG	2	8	1901374	1901381	25 %	0 %	25 %	50 %	390962142
35513	NC_018015	ACG	2	6	1901492	1901497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962143
35514	NC_018015	TGA	2	6	1901508	1901513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962143
35515	NC_018015	GC	3	6	1901581	1901586	0 %	0 %	50 %	50 %	390962143
35516	NC_018015	ATC	2	6	1901620	1901625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962143
35517	NC_018015	GCG	2	6	1901636	1901641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962143
35518	NC_018015	ACG	2	6	1901660	1901665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962143
35519	NC_018015	GTT	2	6	1901938	1901943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390962144
35520	NC_018015	CGC	2	6	1902003	1902008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390962144
35521	NC_018015	CGT	2	6	1902087	1902092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962144
35522	NC_018015	CTG	2	6	1902143	1902148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962144
35523	NC_018015	GAT	2	6	1902153	1902158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962144
35524	NC_018015	AGG	2	6	1902185	1902190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962144
35525	NC_018015	ACC	3	9	1902202	1902210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962144
35526	NC_018015	CGT	2	6	1902213	1902218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962144
35527	NC_018015	CTC	2	6	1902232	1902237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962144
35528	NC_018015	GAG	2	6	1902247	1902252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962144
35529	NC_018015	CTC	2	6	1902253	1902258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962144
35530	NC_018015	CAT	2	6	1902279	1902284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962144
35531	NC_018015	GGC	2	6	1902303	1902308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962144
35532	NC_018015	GAG	2	6	1902331	1902336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962144
35533	NC_018015	GAC	2	6	1902358	1902363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962144
35534	NC_018015	GAA	2	6	1902474	1902479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962144
35535	NC_018015	CGT	2	6	1902492	1902497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962144
35536	NC_018015	ACA	2	6	1902506	1902511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390962144
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35538	NC_018015	GAG	2	6	1902544	1902549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962144
35539	NC_018015	CGT	2	6	1902567	1902572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962144
35540	NC_018015	CCAA	2	8	1902604	1902611	50 %	0 %	0 %	50 %	390962144
35541	NC_018015	TCA	2	6	1902635	1902640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962144
35542	NC_018015	AAG	2	6	1902658	1902663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962144
35543	NC_018015	AGG	2	6	1902725	1902730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962144
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35549	NC_018015	TCG	2	6	1902998	1903003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962144
35550	NC_018015	TCA	2	6	1903037	1903042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962144
35551	NC_018015	GGC	2	6	1903045	1903050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962144
35552	NC_018015	GC	3	6	1903077	1903082	0 %	0 %	50 %	50 %	390962144
35553	NC_018015	GTC	2	6	1903102	1903107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962144
35554	NC_018015	GGA	2	6	1903119	1903124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962144
35555	NC_018015	CCGG	2	8	1903138	1903145	0 %	0 %	50 %	50 %	390962144
35556	NC_018015	CGA	2	6	1903179	1903184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962144
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35560	NC_018015	GCATCG	2	12	1903340	1903351	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390962144
35561	NC_018015	CGG	2	6	1903370	1903375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962144
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35564	NC_018015	CGA	2	6	1903467	1903472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962144
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35584	NC_018015	GC	3	6	1904328	1904333	0 %	0 %	50 %	50 %	390962145
35585	NC_018015	AGC	2	6	1904426	1904431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962145
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35600	NC_018015	CTG	2	6	1905161	1905166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962146
35601	NC_018015	GCG	2	6	1905188	1905193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962146
35602	NC_018015	ATA	2	6	1905194	1905199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390962146
35603	NC_018015	GAGG	2	8	1905242	1905249	25 %	0 %	75 %	0 %	390962146
35604	NC_018015	CTG	2	6	1905290	1905295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962146
35605	NC_018015	CGA	2	6	1905301	1905306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962146
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35610	NC_018015	GAG	2	6	1905446	1905451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962146
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35965	NC_018015	GAC	2	6	1924189	1924194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962167
35966	NC_018015	CAC	2	6	1924222	1924227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962167
35967	NC_018015	CAT	2	6	1924234	1924239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962167
35968	NC_018015	GTT	2	6	1924351	1924356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390962167
35969	NC_018015	CGT	2	6	1924380	1924385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962167
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35975	NC_018015	ACGTGC	2	12	1924568	1924579	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390962167
35976	NC_018015	G	6	6	1924587	1924592	0 %	0 %	100 %	0 %	390962167
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35993	NC_018015	TCG	3	9	1925878	1925886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962168
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35999	NC_018015	CTCC	2	8	1926236	1926243	0 %	25 %	0 %	75 %	390962168
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