MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_018015	GAGTTC	2	12	1872588	1872599	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390962110
35002	NC_018015	AGG	2	6	1872637	1872642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962110
35003	NC_018015	ACCT	2	8	1872684	1872691	25 %	25 %	0 %	50 %	390962110
35004	NC_018015	CGG	2	6	1872692	1872697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962110
35005	NC_018015	TAC	2	6	1872765	1872770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962110
35006	NC_018015	GAG	2	6	1872783	1872788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962110
35007	NC_018015	AAG	2	6	1872801	1872806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962110
35008	NC_018015	GTTC	2	8	1872844	1872851	0 %	50 %	25 %	25 %	390962110
35009	NC_018015	GAT	2	6	1872886	1872891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962111
35010	NC_018015	CGT	2	6	1872955	1872960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962111
35011	NC_018015	TCG	2	6	1873032	1873037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962111
35012	NC_018015	CG	3	6	1873051	1873056	0 %	0 %	50 %	50 %	390962111
35013	NC_018015	ACT	2	6	1873089	1873094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962111
35014	NC_018015	CCT	2	6	1873192	1873197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962111
35015	NC_018015	GAAG	2	8	1873201	1873208	50 %	0 %	50 %	0 %	390962111
35016	NC_018015	TGG	3	9	1873218	1873226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962111
35017	NC_018015	GCT	2	6	1873258	1873263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962111
35018	NC_018015	CTCCAA	2	12	1873324	1873335	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	390962111
35019	NC_018015	GGA	2	6	1873366	1873371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962111
35020	NC_018015	GAG	2	6	1873403	1873408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962111
35021	NC_018015	AGG	2	6	1873415	1873420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962111
35022	NC_018015	TCC	2	6	1873425	1873430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962111
35023	NC_018015	CCG	2	6	1873431	1873436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390962111
35024	NC_018015	CGA	2	6	1873450	1873455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962111
35025	NC_018015	GAG	2	6	1873589	1873594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962111
35026	NC_018015	CAC	2	6	1873636	1873641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962111
35027	NC_018015	CGG	2	6	1873642	1873647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962111
35028	NC_018015	AGG	2	6	1873655	1873660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962111
35029	NC_018015	CCA	2	6	1873665	1873670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962111
35030	NC_018015	CGA	2	6	1873729	1873734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962111
35031	NC_018015	G	6	6	1873804	1873809	0 %	0 %	100 %	0 %	390962111
35032	NC_018015	TCCAC	2	10	1873837	1873846	20 %	20 %	0 %	60 %	390962112
35033	NC_018015	GAG	2	6	1873964	1873969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962112
35034	NC_018015	GGA	2	6	1874002	1874007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962112
35035	NC_018015	AAG	2	6	1874063	1874068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962112
35036	NC_018015	AC	3	6	1874070	1874075	50 %	0 %	0 %	50 %	390962112
35037	NC_018015	GTG	2	6	1874081	1874086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962112
35038	NC_018015	GAG	2	6	1874101	1874106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962112
35039	NC_018015	ACGG	2	8	1874179	1874186	25 %	0 %	50 %	25 %	390962112
35040	NC_018015	TCT	2	6	1874190	1874195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962112
35041	NC_018015	CGA	2	6	1874284	1874289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962112
35042	NC_018015	GAG	2	6	1874326	1874331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962112
35043	NC_018015	AGA	2	6	1874336	1874341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962112
35044	NC_018015	TGG	2	6	1874376	1874381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962112
35045	NC_018015	GAAATC	2	12	1874495	1874506	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	390962112
35046	NC_018015	GCT	2	6	1874521	1874526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962112
35047	NC_018015	AGG	2	6	1874586	1874591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962112
35048	NC_018015	GAG	2	6	1874653	1874658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962112
35049	NC_018015	TTC	2	6	1874804	1874809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962112
35050	NC_018015	CGC	2	6	1874885	1874890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390962112
35051	NC_018015	TCC	2	6	1874922	1874927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962112
35052	NC_018015	CTT	2	6	1875073	1875078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962113
35053	NC_018015	GA	3	6	1875099	1875104	50 %	0 %	50 %	0 %	390962113
35054	NC_018015	GGT	2	6	1875207	1875212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962113
35055	NC_018015	GAG	2	6	1875242	1875247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962113
35056	NC_018015	CGA	2	6	1875367	1875372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962113
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35058	NC_018015	AGG	2	6	1875410	1875415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962113
35059	NC_018015	AGG	2	6	1875417	1875422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962113
35060	NC_018015	GCA	2	6	1875444	1875449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962113
35061	NC_018015	TGA	2	6	1875468	1875473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962113
35062	NC_018015	TAC	3	9	1875506	1875514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962113
35063	NC_018015	CTC	2	6	1875533	1875538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962113
35064	NC_018015	CCT	2	6	1875664	1875669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962113
35065	NC_018015	AG	3	6	1875832	1875837	50 %	0 %	50 %	0 %	390962113
35066	NC_018015	GCC	2	6	1875857	1875862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390962113
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35069	NC_018015	AG	3	6	1875958	1875963	50 %	0 %	50 %	0 %	390962114
35070	NC_018015	GGT	2	6	1875978	1875983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962114
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35074	NC_018015	GC	3	6	1876267	1876272	0 %	0 %	50 %	50 %	390962115
35075	NC_018015	TAC	2	6	1876273	1876278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962115
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35083	NC_018015	CT	3	6	1878700	1878705	0 %	50 %	0 %	50 %	390962116
35084	NC_018015	ACG	2	6	1878711	1878716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962116
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35089	NC_018015	TCCC	2	8	1879124	1879131	0 %	25 %	0 %	75 %	390962116
35090	NC_018015	TCT	2	6	1879167	1879172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962116
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35100	NC_018015	GAG	2	6	1879388	1879393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962116
35101	NC_018015	TGG	2	6	1879415	1879420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962116
35102	NC_018015	T	6	6	1879555	1879560	0 %	100 %	0 %	0 %	390962117
35103	NC_018015	TTGAGG	2	12	1879590	1879601	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	390962117
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35112	NC_018015	GC	3	6	1880058	1880063	0 %	0 %	50 %	50 %	390962118
35113	NC_018015	CTC	2	6	1880068	1880073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962118
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35116	NC_018015	TGT	2	6	1880413	1880418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390962119
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35224	NC_018015	GCCTAT	2	12	1886417	1886428	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390962127
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35230	NC_018015	AGG	2	6	1886934	1886939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962127
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35465	NC_018015	TCA	2	6	1898798	1898803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962140
35466	NC_018015	CGGC	2	8	1898805	1898812	0 %	0 %	50 %	50 %	390962140
35467	NC_018015	CGT	2	6	1898847	1898852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962140
35468	NC_018015	CGA	2	6	1898901	1898906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962140
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