MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_018015	CAG	2	6	1843945	1843950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962084
34502	NC_018015	ATC	2	6	1843951	1843956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962084
34503	NC_018015	CCG	2	6	1843993	1843998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390962084
34504	NC_018015	GCA	2	6	1844019	1844024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962084
34505	NC_018015	GAAG	2	8	1844154	1844161	50 %	0 %	50 %	0 %	390962085
34506	NC_018015	AGGG	2	8	1844218	1844225	25 %	0 %	75 %	0 %	390962085
34507	NC_018015	ACT	2	6	1844238	1844243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962085
34508	NC_018015	TGG	2	6	1844252	1844257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962085
34509	NC_018015	GGT	2	6	1844380	1844385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962085
34510	NC_018015	GAG	2	6	1844392	1844397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962085
34511	NC_018015	TGG	2	6	1844466	1844471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962085
34512	NC_018015	CAG	2	6	1844587	1844592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962085
34513	NC_018015	GAGG	2	8	1844593	1844600	25 %	0 %	75 %	0 %	390962085
34514	NC_018015	CTA	2	6	1844614	1844619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962085
34515	NC_018015	G	6	6	1844656	1844661	0 %	0 %	100 %	0 %	390962085
34516	NC_018015	CAC	2	6	1844913	1844918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962086
34517	NC_018015	CAT	2	6	1844961	1844966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962086
34518	NC_018015	AGG	2	6	1845035	1845040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962086
34519	NC_018015	CAT	2	6	1845108	1845113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962086
34520	NC_018015	GCCA	2	8	1845160	1845167	25 %	0 %	25 %	50 %	390962086
34521	NC_018015	TCG	3	9	1845185	1845193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962086
34522	NC_018015	CCTT	2	8	1845233	1845240	0 %	50 %	0 %	50 %	390962086
34523	NC_018015	CAT	2	6	1845264	1845269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962086
34524	NC_018015	CAA	2	6	1845279	1845284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390962086
34525	NC_018015	AGA	2	6	1845308	1845313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962086
34526	NC_018015	AAG	2	6	1845340	1845345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962086
34527	NC_018015	CTC	2	6	1845346	1845351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962086
34528	NC_018015	ATG	2	6	1845352	1845357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962086
34529	NC_018015	ACA	2	6	1845407	1845412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390962086
34530	NC_018015	GCC	2	6	1845486	1845491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390962086
34531	NC_018015	CGT	2	6	1845603	1845608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962086
34532	NC_018015	CAC	2	6	1845676	1845681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962086
34533	NC_018015	AGG	2	6	1845692	1845697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962086
34534	NC_018015	ACA	2	6	1845710	1845715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390962086
34535	NC_018015	AC	3	6	1845774	1845779	50 %	0 %	0 %	50 %	390962086
34536	NC_018015	CGT	2	6	1845795	1845800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962086
34537	NC_018015	ATC	2	6	1845829	1845834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962086
34538	NC_018015	ACC	2	6	1845842	1845847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962086
34539	NC_018015	TCC	2	6	1845878	1845883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962086
34540	NC_018015	AGC	2	6	1845917	1845922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962086
34541	NC_018015	TCG	2	6	1845956	1845961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962086
34542	NC_018015	TCA	2	6	1845977	1845982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962086
34543	NC_018015	TCG	2	6	1846001	1846006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962086
34544	NC_018015	CAC	2	6	1846327	1846332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962087
34545	NC_018015	CGA	2	6	1846417	1846422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962087
34546	NC_018015	ATCGAG	2	12	1846472	1846483	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390962087
34547	NC_018015	TCG	2	6	1846845	1846850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962088
34548	NC_018015	GTA	2	6	1846925	1846930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962088
34549	NC_018015	TCG	2	6	1846932	1846937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962088
34550	NC_018015	GTC	2	6	1847027	1847032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962088
34551	NC_018015	GCG	2	6	1847146	1847151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962088
34552	NC_018015	CGT	2	6	1847203	1847208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962088
34553	NC_018015	CCA	2	6	1847288	1847293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962088
34554	NC_018015	GGT	2	6	1847332	1847337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962088
34555	NC_018015	CGT	2	6	1847392	1847397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962088
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34557	NC_018015	TCT	2	6	1847521	1847526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962088
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34559	NC_018015	CGG	2	6	1847641	1847646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962088
34560	NC_018015	GTC	2	6	1847705	1847710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962088
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34584	NC_018015	CTC	2	6	1848416	1848421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962088
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34600	NC_018015	T	6	6	1849457	1849462	0 %	100 %	0 %	0 %	390962090
34601	NC_018015	CGC	2	6	1849706	1849711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390962090
34602	NC_018015	GGA	2	6	1849808	1849813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962090
34603	NC_018015	TC	3	6	1850084	1850089	0 %	50 %	0 %	50 %	390962091
34604	NC_018015	CAG	2	6	1850136	1850141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962091
34605	NC_018015	GACGG	2	10	1850224	1850233	20 %	0 %	60 %	20 %	390962091
34606	NC_018015	CAC	2	6	1850308	1850313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962091
34607	NC_018015	C	6	6	1850323	1850328	0 %	0 %	0 %	100 %	390962091
34608	NC_018015	GCCT	2	8	1850337	1850344	0 %	25 %	25 %	50 %	390962091
34609	NC_018015	AAGAGG	2	12	1850365	1850376	50 %	0 %	50 %	0 %	390962091
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34612	NC_018015	ACG	2	6	1850582	1850587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962092
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34615	NC_018015	TTC	2	6	1850774	1850779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962092
34616	NC_018015	GGCCGA	2	12	1850919	1850930	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	390962092
34617	NC_018015	CTA	2	6	1850943	1850948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962092
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