MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_018015	TGA	3	9	1792232	1792240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962032
33502	NC_018015	GAA	2	6	1792305	1792310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962032
33503	NC_018015	GTA	2	6	1792314	1792319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962032
33504	NC_018015	ATGCT	2	10	1792325	1792334	20 %	40 %	20 %	20 %	390962032
33505	NC_018015	CCGA	2	8	1792390	1792397	25 %	0 %	25 %	50 %	390962032
33506	NC_018015	TCCT	2	8	1792407	1792414	0 %	50 %	0 %	50 %	390962032
33507	NC_018015	CCCTT	2	10	1792478	1792487	0 %	40 %	0 %	60 %	390962032
33508	NC_018015	TAT	2	6	1792542	1792547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390962032
33509	NC_018015	CGC	2	6	1792550	1792555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390962032
33510	NC_018015	CTC	2	6	1792570	1792575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962032
33511	NC_018015	CGA	2	6	1792586	1792591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962032
33512	NC_018015	ACG	2	6	1792600	1792605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962032
33513	NC_018015	ATT	2	6	1792609	1792614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390962032
33514	NC_018015	GCC	2	6	1792716	1792721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390962032
33515	NC_018015	TCT	2	6	1792829	1792834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962032
33516	NC_018015	GCC	2	6	1792897	1792902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390962032
33517	NC_018015	CCG	2	6	1792976	1792981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390962032
33518	NC_018015	AATGG	2	10	1793284	1793293	40 %	20 %	40 %	0 %	390962033
33519	NC_018015	CTC	2	6	1793309	1793314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962033
33520	NC_018015	TA	3	6	1793356	1793361	50 %	50 %	0 %	0 %	390962033
33521	NC_018015	TTTC	2	8	1793425	1793432	0 %	75 %	0 %	25 %	390962033
33522	NC_018015	CTC	3	9	1793525	1793533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962033
33523	NC_018015	G	6	6	1793726	1793731	0 %	0 %	100 %	0 %	390962033
33524	NC_018015	CCT	2	6	1793920	1793925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962033
33525	NC_018015	TTC	2	6	1793960	1793965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962033
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33527	NC_018015	TCG	2	6	1794039	1794044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962033
33528	NC_018015	GCCG	2	8	1794098	1794105	0 %	0 %	50 %	50 %	390962033
33529	NC_018015	TC	3	6	1794151	1794156	0 %	50 %	0 %	50 %	390962033
33530	NC_018015	TCC	2	6	1794186	1794191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962033
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33532	NC_018015	CGAG	2	8	1794264	1794271	25 %	0 %	50 %	25 %	390962033
33533	NC_018015	GGT	2	6	1794283	1794288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962033
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33537	NC_018015	CG	3	6	1794718	1794723	0 %	0 %	50 %	50 %	390962034
33538	NC_018015	AGT	2	6	1794826	1794831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962034
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33540	NC_018015	AGT	2	6	1794887	1794892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962034
33541	NC_018015	TTCCG	2	10	1794893	1794902	0 %	40 %	20 %	40 %	390962034
33542	NC_018015	TCG	2	6	1794961	1794966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962034
33543	NC_018015	TCG	3	9	1794987	1794995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962034
33544	NC_018015	TCGC	2	8	1795053	1795060	0 %	25 %	25 %	50 %	390962034
33545	NC_018015	AGGA	2	8	1795086	1795093	50 %	0 %	50 %	0 %	390962034
33546	NC_018015	CAG	2	6	1795142	1795147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962034
33547	NC_018015	TCG	2	6	1795353	1795358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962034
33548	NC_018015	GTA	2	6	1795559	1795564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962034
33549	NC_018015	TCC	2	6	1795566	1795571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962034
33550	NC_018015	TGG	2	6	1795648	1795653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962034
33551	NC_018015	TTCTC	2	10	1795663	1795672	0 %	60 %	0 %	40 %	390962034
33552	NC_018015	GTT	2	6	1795730	1795735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390962034
33553	NC_018015	CCTG	2	8	1795747	1795754	0 %	25 %	25 %	50 %	390962034
33554	NC_018015	CGGT	2	8	1795755	1795762	0 %	25 %	50 %	25 %	390962034
33555	NC_018015	ACG	2	6	1795779	1795784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962034
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33557	NC_018015	CTT	2	6	1795808	1795813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962034
33558	NC_018015	CCT	2	6	1795857	1795862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962035
33559	NC_018015	CCT	2	6	1795961	1795966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962035
33560	NC_018015	GCT	2	6	1795983	1795988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962035
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33562	NC_018015	CCT	2	6	1796022	1796027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962035
33563	NC_018015	TAGG	2	8	1796058	1796065	25 %	25 %	50 %	0 %	390962035
33564	NC_018015	CTG	2	6	1796085	1796090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962035
33565	NC_018015	GTC	2	6	1796100	1796105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962035
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33567	NC_018015	AGGT	2	8	1796191	1796198	25 %	25 %	50 %	0 %	390962035
33568	NC_018015	TGA	2	6	1796306	1796311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962035
33569	NC_018015	TGA	2	6	1796321	1796326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962035
33570	NC_018015	TCG	3	9	1796353	1796361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962035
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33598	NC_018015	TC	3	6	1798109	1798114	0 %	50 %	0 %	50 %	390962037
33599	NC_018015	ATC	2	6	1798155	1798160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962037
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33601	NC_018015	CCTT	2	8	1798351	1798358	0 %	50 %	0 %	50 %	390962038
33602	NC_018015	GTT	2	6	1798368	1798373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390962038
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33604	NC_018015	CTC	2	6	1798422	1798427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962038
33605	NC_018015	GTC	2	6	1798528	1798533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962038
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33614	NC_018015	CCCT	2	8	1799068	1799075	0 %	25 %	0 %	75 %	390962039
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