MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_018015	GTC	2	6	1763920	1763925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961999
33002	NC_018015	GCC	2	6	1763947	1763952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961999
33003	NC_018015	ATC	2	6	1763999	1764004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961999
33004	NC_018015	GCC	2	6	1764052	1764057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961999
33005	NC_018015	AAGG	2	8	1764184	1764191	50 %	0 %	50 %	0 %	390961999
33006	NC_018015	TG	3	6	1764205	1764210	0 %	50 %	50 %	0 %	390961999
33007	NC_018015	GTG	2	6	1764223	1764228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961999
33008	NC_018015	TCA	2	6	1764342	1764347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961999
33009	NC_018015	TCA	2	6	1764410	1764415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961999
33010	NC_018015	CCT	2	6	1764898	1764903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962000
33011	NC_018015	CGT	2	6	1764940	1764945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962000
33012	NC_018015	CGG	2	6	1764946	1764951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962000
33013	NC_018015	TTC	2	6	1764978	1764983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962000
33014	NC_018015	AGA	2	6	1764988	1764993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962000
33015	NC_018015	TCC	2	6	1765029	1765034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962000
33016	NC_018015	CTCG	2	8	1765121	1765128	0 %	25 %	25 %	50 %	390962000
33017	NC_018015	GAC	2	6	1765142	1765147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962000
33018	NC_018015	CCT	2	6	1765192	1765197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962000
33019	NC_018015	CCTGTA	2	12	1765220	1765231	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390962000
33020	NC_018015	GAG	2	6	1765291	1765296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962001
33021	NC_018015	TCAGCA	2	12	1765306	1765317	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390962001
33022	NC_018015	CAG	2	6	1765442	1765447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962001
33023	NC_018015	AAT	2	6	1765490	1765495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390962001
33024	NC_018015	AGGCC	2	10	1765606	1765615	20 %	0 %	40 %	40 %	390962001
33025	NC_018015	CGGC	2	8	1765636	1765643	0 %	0 %	50 %	50 %	390962001
33026	NC_018015	CCA	2	6	1765807	1765812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962001
33027	NC_018015	TAT	2	6	1765820	1765825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390962001
33028	NC_018015	CGA	2	6	1765867	1765872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962001
33029	NC_018015	GGA	2	6	1765879	1765884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962001
33030	NC_018015	TCT	2	6	1765974	1765979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962001
33031	NC_018015	GTG	2	6	1765980	1765985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962001
33032	NC_018015	TTC	2	6	1765994	1765999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962001
33033	NC_018015	GCT	2	6	1766025	1766030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962001
33034	NC_018015	TCC	2	6	1766157	1766162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962001
33035	NC_018015	GTA	2	6	1766180	1766185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962001
33036	NC_018015	AGT	2	6	1766365	1766370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962001
33037	NC_018015	AGA	2	6	1766371	1766376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962001
33038	NC_018015	GAA	2	6	1766378	1766383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962001
33039	NC_018015	CCA	2	6	1766404	1766409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962001
33040	NC_018015	GAGTT	2	10	1766412	1766421	20 %	40 %	40 %	0 %	390962001
33041	NC_018015	CAG	2	6	1766498	1766503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962001
33042	NC_018015	TGA	2	6	1766509	1766514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390962001
33043	NC_018015	TTC	2	6	1766617	1766622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962002
33044	NC_018015	TAT	2	6	1766715	1766720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390962002
33045	NC_018015	CAC	2	6	1766724	1766729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390962002
33046	NC_018015	GAG	2	6	1766751	1766756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962002
33047	NC_018015	TCC	2	6	1766770	1766775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962002
33048	NC_018015	ATC	2	6	1766787	1766792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962002
33049	NC_018015	ACG	2	6	1766822	1766827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390962002
33050	NC_018015	CGC	2	6	1766844	1766849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390962002
33051	NC_018015	CCG	2	6	1766864	1766869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390962002
33052	NC_018015	TCG	2	6	1766908	1766913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962002
33053	NC_018015	GCCAG	2	10	1766944	1766953	20 %	0 %	40 %	40 %	390962002
33054	NC_018015	TCA	2	6	1766998	1767003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962002
33055	NC_018015	CCT	2	6	1767024	1767029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962002
33056	NC_018015	CTT	2	6	1767121	1767126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390962002
33057	NC_018015	GAA	2	6	1767141	1767146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962002
33058	NC_018015	TCG	2	6	1767310	1767315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962003
33059	NC_018015	GAA	2	6	1767353	1767358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390962003
33060	NC_018015	G	6	6	1767375	1767380	0 %	0 %	100 %	0 %	390962003
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33063	NC_018015	GGAGG	2	10	1767473	1767482	20 %	0 %	80 %	0 %	390962003
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33067	NC_018015	TCGGA	2	10	1767628	1767637	20 %	20 %	40 %	20 %	390962003
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33071	NC_018015	CCGGA	2	10	1768023	1768032	20 %	0 %	40 %	40 %	390962004
33072	NC_018015	GCCCC	2	10	1768051	1768060	0 %	0 %	20 %	80 %	390962004
33073	NC_018015	CCT	2	6	1768070	1768075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962004
33074	NC_018015	GA	3	6	1768090	1768095	50 %	0 %	50 %	0 %	390962004
33075	NC_018015	GGA	2	6	1768152	1768157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390962004
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33082	NC_018015	TCA	2	6	1768605	1768610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390962005
33083	NC_018015	CCGC	2	8	1768635	1768642	0 %	0 %	25 %	75 %	390962005
33084	NC_018015	GCG	2	6	1768664	1768669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390962005
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33087	NC_018015	CTG	2	6	1768796	1768801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390962005
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33089	NC_018015	CTC	2	6	1768967	1768972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390962005
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33101	NC_018015	TC	3	6	1769770	1769775	0 %	50 %	0 %	50 %	390962006
33102	NC_018015	A	6	6	1769793	1769798	100 %	0 %	0 %	0 %	390962007
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33109	NC_018015	CT	3	6	1770047	1770052	0 %	50 %	0 %	50 %	390962007
33110	NC_018015	GGT	2	6	1770090	1770095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390962007
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