MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32502	NC_018015	TACAGG	2	12	1735391	1735402	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390961966
32503	NC_018015	AC	3	6	1735414	1735419	50 %	0 %	0 %	50 %	390961966
32504	NC_018015	CTG	2	6	1735430	1735435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961966
32505	NC_018015	TCG	2	6	1735578	1735583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961966
32506	NC_018015	GA	3	6	1735593	1735598	50 %	0 %	50 %	0 %	390961966
32507	NC_018015	TGG	2	6	1735607	1735612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961966
32508	NC_018015	AAG	2	6	1735706	1735711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961966
32509	NC_018015	TCC	2	6	1735978	1735983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961967
32510	NC_018015	GT	3	6	1736096	1736101	0 %	50 %	50 %	0 %	390961967
32511	NC_018015	TCC	2	6	1736149	1736154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961967
32512	NC_018015	CCG	2	6	1736201	1736206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961967
32513	NC_018015	TGA	2	6	1736213	1736218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961967
32514	NC_018015	TCC	2	6	1736267	1736272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961967
32515	NC_018015	CTC	2	6	1736287	1736292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961967
32516	NC_018015	AAGCTC	2	12	1736367	1736378	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390961967
32517	NC_018015	TCG	2	6	1736419	1736424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961967
32518	NC_018015	T	6	6	1736451	1736456	0 %	100 %	0 %	0 %	390961967
32519	NC_018015	CTCC	2	8	1736486	1736493	0 %	25 %	0 %	75 %	390961967
32520	NC_018015	TTC	2	6	1736495	1736500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961967
32521	NC_018015	ATG	2	6	1736563	1736568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961967
32522	NC_018015	CCA	2	6	1736636	1736641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961967
32523	NC_018015	TC	3	6	1736701	1736706	0 %	50 %	0 %	50 %	390961967
32524	NC_018015	CTC	2	6	1736718	1736723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961967
32525	NC_018015	CCT	2	6	1736730	1736735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961967
32526	NC_018015	CTCCC	2	10	1736812	1736821	0 %	20 %	0 %	80 %	390961967
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32528	NC_018015	CAGG	2	8	1736876	1736883	25 %	0 %	50 %	25 %	390961967
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32530	NC_018015	GCGGG	2	10	1736921	1736930	0 %	0 %	80 %	20 %	390961967
32531	NC_018015	TCG	2	6	1737034	1737039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961967
32532	NC_018015	GGA	2	6	1737158	1737163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961967
32533	NC_018015	CTC	2	6	1737168	1737173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961967
32534	NC_018015	CGT	2	6	1737273	1737278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961967
32535	NC_018015	GAC	2	6	1737300	1737305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961967
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32538	NC_018015	GCC	2	6	1737378	1737383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961967
32539	NC_018015	C	6	6	1737382	1737387	0 %	0 %	0 %	100 %	390961967
32540	NC_018015	CT	4	8	1737399	1737406	0 %	50 %	0 %	50 %	390961967
32541	NC_018015	GGA	2	6	1737432	1737437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961967
32542	NC_018015	ACC	2	6	1737448	1737453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961967
32543	NC_018015	CGCTCC	2	12	1737467	1737478	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	390961967
32544	NC_018015	GGT	2	6	1737482	1737487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961967
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32548	NC_018015	C	7	7	1737698	1737704	0 %	0 %	0 %	100 %	390961967
32549	NC_018015	CT	3	6	1737714	1737719	0 %	50 %	0 %	50 %	390961967
32550	NC_018015	GTG	2	6	1737744	1737749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961967
32551	NC_018015	GTC	2	6	1737882	1737887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961967
32552	NC_018015	CGT	2	6	1737899	1737904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961967
32553	NC_018015	ATC	2	6	1737930	1737935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961967
32554	NC_018015	TCC	2	6	1737956	1737961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961967
32555	NC_018015	GGA	2	6	1737962	1737967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961967
32556	NC_018015	CG	3	6	1737971	1737976	0 %	0 %	50 %	50 %	390961967
32557	NC_018015	TCAC	2	8	1738070	1738077	25 %	25 %	0 %	50 %	390961967
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32560	NC_018015	CT	3	6	1738123	1738128	0 %	50 %	0 %	50 %	390961968
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32566	NC_018015	CAG	2	6	1738281	1738286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961968
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