MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_018015	TCC	2	6	1649076	1649081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961885
31002	NC_018015	CTC	2	6	1649102	1649107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961885
31003	NC_018015	TCC	2	6	1649313	1649318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961885
31004	NC_018015	GCC	2	6	1649387	1649392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961885
31005	NC_018015	TGG	2	6	1649425	1649430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961885
31006	NC_018015	GTG	3	9	1649433	1649441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961885
31007	NC_018015	CT	3	6	1649502	1649507	0 %	50 %	0 %	50 %	390961885
31008	NC_018015	TCGTT	2	10	1649527	1649536	0 %	60 %	20 %	20 %	390961885
31009	NC_018015	AGT	2	6	1649539	1649544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961885
31010	NC_018015	GCG	2	6	1649599	1649604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961885
31011	NC_018015	AGTTGA	2	12	1649677	1649688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961885
31012	NC_018015	TCCG	2	8	1649927	1649934	0 %	25 %	25 %	50 %	390961885
31013	NC_018015	CCG	2	6	1650051	1650056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961885
31014	NC_018015	GTA	2	6	1650164	1650169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961885
31015	NC_018015	GCC	2	6	1650234	1650239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961885
31016	NC_018015	ACG	2	6	1650333	1650338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961885
31017	NC_018015	CT	3	6	1650363	1650368	0 %	50 %	0 %	50 %	390961885
31018	NC_018015	TC	3	6	1650436	1650441	0 %	50 %	0 %	50 %	390961885
31019	NC_018015	CAC	2	6	1650449	1650454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961885
31020	NC_018015	GAG	2	6	1650479	1650484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961885
31021	NC_018015	GTTCC	2	10	1650522	1650531	0 %	40 %	20 %	40 %	390961885
31022	NC_018015	GGTG	2	8	1650626	1650633	0 %	25 %	75 %	0 %	390961885
31023	NC_018015	G	6	6	1650649	1650654	0 %	0 %	100 %	0 %	390961885
31024	NC_018015	CCAG	2	8	1650811	1650818	25 %	0 %	25 %	50 %	390961886
31025	NC_018015	TCC	2	6	1650819	1650824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961886
31026	NC_018015	CT	3	6	1650837	1650842	0 %	50 %	0 %	50 %	390961886
31027	NC_018015	CGG	2	6	1650859	1650864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961886
31028	NC_018015	CCT	2	6	1650886	1650891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961886
31029	NC_018015	CTC	2	6	1650926	1650931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961886
31030	NC_018015	TCC	2	6	1650933	1650938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961886
31031	NC_018015	TGGTC	2	10	1650961	1650970	0 %	40 %	40 %	20 %	390961886
31032	NC_018015	CTC	2	6	1651049	1651054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961886
31033	NC_018015	GGTG	2	8	1651082	1651089	0 %	25 %	75 %	0 %	390961886
31034	NC_018015	TGA	2	6	1651135	1651140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961886
31035	NC_018015	GCT	2	6	1651147	1651152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961886
31036	NC_018015	TCT	2	6	1651171	1651176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961886
31037	NC_018015	TTC	2	6	1651182	1651187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961886
31038	NC_018015	TCG	2	6	1651213	1651218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961886
31039	NC_018015	CTC	2	6	1651229	1651234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961886
31040	NC_018015	TTC	2	6	1651380	1651385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961886
31041	NC_018015	A	6	6	1651391	1651396	100 %	0 %	0 %	0 %	390961886
31042	NC_018015	CTC	2	6	1651417	1651422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961887
31043	NC_018015	TCC	2	6	1651424	1651429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961887
31044	NC_018015	GAC	2	6	1651450	1651455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961887
31045	NC_018015	CCA	2	6	1651590	1651595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961887
31046	NC_018015	TCG	2	6	1651598	1651603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961887
31047	NC_018015	TTTATC	2	12	1651622	1651633	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	390961887
31048	NC_018015	CTC	2	6	1651648	1651653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961887
31049	NC_018015	TTC	2	6	1651712	1651717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961887
31050	NC_018015	GTG	2	6	1651760	1651765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961887
31051	NC_018015	CTTGAG	2	12	1651771	1651782	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390961887
31052	NC_018015	TCT	3	9	1651824	1651832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961887
31053	NC_018015	CCT	2	6	1651854	1651859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961887
31054	NC_018015	GCT	2	6	1651866	1651871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961887
31055	NC_018015	CTT	2	6	1651900	1651905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961887
31056	NC_018015	TTC	2	6	1651979	1651984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961887
31057	NC_018015	T	6	6	1652010	1652015	0 %	100 %	0 %	0 %	390961887
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31059	NC_018015	CGA	2	6	1652094	1652099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961888
31060	NC_018015	CCT	2	6	1652154	1652159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961888
31061	NC_018015	CCT	2	6	1652178	1652183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961888
31062	NC_018015	ATT	2	6	1652204	1652209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961888
31063	NC_018015	TCT	2	6	1652211	1652216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961888
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31066	NC_018015	CGC	2	6	1652322	1652327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961888
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31069	NC_018015	TCA	2	6	1652468	1652473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961888
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31072	NC_018015	GAG	2	6	1652599	1652604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961888
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31088	NC_018015	TCT	2	6	1653112	1653117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961888
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31096	NC_018015	CTGC	2	8	1653294	1653301	0 %	25 %	25 %	50 %	390961888
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31099	NC_018015	GTA	2	6	1653481	1653486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961888
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31101	NC_018015	GTT	2	6	1653508	1653513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961888
31102	NC_018015	TCT	2	6	1653528	1653533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961888
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31104	NC_018015	TCCCTG	2	12	1653602	1653613	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390961888
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31113	NC_018015	CCCTT	2	10	1654033	1654042	0 %	40 %	0 %	60 %	390961889
31114	NC_018015	CGA	2	6	1654132	1654137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961889
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31466	NC_018015	TTC	2	6	1676687	1676692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961908
31467	NC_018015	CT	3	6	1676702	1676707	0 %	50 %	0 %	50 %	390961908
31468	NC_018015	CCA	2	6	1676842	1676847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961908
31469	NC_018015	CCCT	2	8	1676906	1676913	0 %	25 %	0 %	75 %	390961908
31470	NC_018015	CG	4	8	1676916	1676923	0 %	0 %	50 %	50 %	390961908
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31476	NC_018015	ATC	2	6	1677140	1677145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961908
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31481	NC_018015	CTC	2	6	1677415	1677420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961908
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31492	NC_018015	TCG	2	6	1677648	1677653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961909
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31495	NC_018015	TCC	3	9	1677906	1677914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961909
31496	NC_018015	CT	3	6	1677964	1677969	0 %	50 %	0 %	50 %	390961909
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31500	NC_018015	CCT	2	6	1678130	1678135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961909

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