MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_018015	CGT	2	6	1598248	1598253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961842
30003	NC_018015	GTA	2	6	1598267	1598272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961842
30004	NC_018015	CGA	2	6	1598329	1598334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961842
30005	NC_018015	ATGGCC	2	12	1598466	1598477	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390961842
30006	NC_018015	TCC	2	6	1598478	1598483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961842
30007	NC_018015	AGG	2	6	1598595	1598600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961842
30008	NC_018015	CGA	3	9	1598614	1598622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961842
30009	NC_018015	GCT	3	9	1598644	1598652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961842
30010	NC_018015	TCC	2	6	1598739	1598744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961842
30011	NC_018015	CCTT	2	8	1598752	1598759	0 %	50 %	0 %	50 %	390961842
30012	NC_018015	GGAGG	2	10	1598849	1598858	20 %	0 %	80 %	0 %	390961842
30013	NC_018015	CCT	2	6	1598866	1598871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961842
30014	NC_018015	CGT	2	6	1598930	1598935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961842
30015	NC_018015	TCA	2	6	1599149	1599154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961843
30016	NC_018015	CCA	2	6	1599212	1599217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961843
30017	NC_018015	TAG	2	6	1599235	1599240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961843
30018	NC_018015	AGG	2	6	1599319	1599324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961843
30019	NC_018015	CTG	2	6	1599370	1599375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961843
30020	NC_018015	GCT	2	6	1599391	1599396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961843
30021	NC_018015	CGC	2	6	1599444	1599449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961843
30022	NC_018015	CAG	2	6	1599507	1599512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961843
30023	NC_018015	TGG	2	6	1599515	1599520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961843
30024	NC_018015	AGA	3	9	1599554	1599562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961843
30025	NC_018015	CTT	2	6	1599642	1599647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961843
30026	NC_018015	CTG	2	6	1599652	1599657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961843
30027	NC_018015	ATG	2	6	1599688	1599693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961843
30028	NC_018015	AAT	2	6	1599696	1599701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961843
30029	NC_018015	GCC	2	6	1599703	1599708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961843
30030	NC_018015	ATG	2	6	1599730	1599735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961843
30031	NC_018015	CTGG	2	8	1599749	1599756	0 %	25 %	50 %	25 %	390961843
30032	NC_018015	ATG	2	6	1599760	1599765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961843
30033	NC_018015	GGT	2	6	1599780	1599785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961843
30034	NC_018015	GAC	3	9	1599876	1599884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961843
30035	NC_018015	TTTGG	2	10	1599913	1599922	0 %	60 %	40 %	0 %	390961843
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30037	NC_018015	CGA	2	6	1600172	1600177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961843
30038	NC_018015	CTC	2	6	1600269	1600274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961843
30039	NC_018015	TGA	2	6	1600292	1600297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961843
30040	NC_018015	CGA	2	6	1600361	1600366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961843
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30042	NC_018015	AT	3	6	1600394	1600399	50 %	50 %	0 %	0 %	390961843
30043	NC_018015	TTA	2	6	1600424	1600429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961843
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30049	NC_018015	TAT	2	6	1600605	1600610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961843
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30051	NC_018015	GTA	2	6	1600647	1600652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961843
30052	NC_018015	GA	3	6	1600749	1600754	50 %	0 %	50 %	0 %	390961843
30053	NC_018015	ACG	2	6	1600844	1600849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961843
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30055	NC_018015	ATCA	2	8	1601059	1601066	50 %	25 %	0 %	25 %	390961844
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30062	NC_018015	CGT	2	6	1601333	1601338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961844
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30065	NC_018015	GTC	2	6	1601415	1601420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961844
30066	NC_018015	GGGC	2	8	1601468	1601475	0 %	0 %	75 %	25 %	390961844
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30463	NC_018015	CTC	2	6	1621880	1621885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961863
30464	NC_018015	CGA	2	6	1621935	1621940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961864
30465	NC_018015	AGG	2	6	1621964	1621969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961864
30466	NC_018015	GAC	2	6	1622008	1622013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961864
30467	NC_018015	CCT	2	6	1622071	1622076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961864
30468	NC_018015	GTC	2	6	1622146	1622151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961864
30469	NC_018015	TC	3	6	1622157	1622162	0 %	50 %	0 %	50 %	390961864
30470	NC_018015	GCG	2	6	1622171	1622176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961864
30471	NC_018015	GGACTT	2	12	1622254	1622265	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390961864
30472	NC_018015	GGCA	2	8	1622430	1622437	25 %	0 %	50 %	25 %	390961865
30473	NC_018015	ATA	2	6	1622452	1622457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961865
30474	NC_018015	GAG	2	6	1622478	1622483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961865
30475	NC_018015	ATG	2	6	1622491	1622496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961865
30476	NC_018015	CTC	2	6	1622530	1622535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961865
30477	NC_018015	GTT	2	6	1622632	1622637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961865
30478	NC_018015	C	6	6	1622651	1622656	0 %	0 %	0 %	100 %	390961865
30479	NC_018015	GGAA	2	8	1622837	1622844	50 %	0 %	50 %	0 %	390961865
30480	NC_018015	CGC	2	6	1622892	1622897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961865
30481	NC_018015	GTG	2	6	1622927	1622932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961865
30482	NC_018015	TCC	2	6	1622959	1622964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961866
30483	NC_018015	AGG	2	6	1622977	1622982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961866
30484	NC_018015	GGA	2	6	1622987	1622992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961866
30485	NC_018015	GTT	2	6	1623129	1623134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961866
30486	NC_018015	C	6	6	1623148	1623153	0 %	0 %	0 %	100 %	390961866
30487	NC_018015	CGT	2	6	1623170	1623175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961866
30488	NC_018015	ATA	2	6	1623309	1623314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961866
30489	NC_018015	AAT	2	6	1623487	1623492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961867
30490	NC_018015	TCA	2	6	1623519	1623524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961867
30491	NC_018015	ACT	2	6	1623534	1623539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961867
30492	NC_018015	TCA	2	6	1623588	1623593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961867
30493	NC_018015	CCA	2	6	1623618	1623623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961867
30494	NC_018015	TCC	2	6	1623653	1623658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961867
30495	NC_018015	GAA	2	6	1623778	1623783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961867
30496	NC_018015	CTG	2	6	1623821	1623826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961867
30497	NC_018015	ACG	2	6	1623831	1623836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961867
30498	NC_018015	CTA	2	6	1623892	1623897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961867
30499	NC_018015	GAG	2	6	1623923	1623928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961867
30500	NC_018015	GGC	2	6	1623938	1623943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961867

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