MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_018015	CAC	2	6	1546385	1546390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961779
29003	NC_018015	GCC	2	6	1546424	1546429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961779
29004	NC_018015	TCC	2	6	1546485	1546490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961779
29005	NC_018015	CGT	2	6	1546498	1546503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961779
29006	NC_018015	GAA	2	6	1546513	1546518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961779
29007	NC_018015	TCC	2	6	1546756	1546761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961780
29008	NC_018015	TCA	2	6	1546792	1546797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961780
29009	NC_018015	AAT	2	6	1546902	1546907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961780
29010	NC_018015	TAC	2	6	1546916	1546921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961780
29011	NC_018015	TTC	3	9	1547011	1547019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961781
29012	NC_018015	CCCCG	2	10	1547053	1547062	0 %	0 %	20 %	80 %	390961781
29013	NC_018015	CTC	2	6	1547110	1547115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961781
29014	NC_018015	TCG	2	6	1547123	1547128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961781
29015	NC_018015	CTTC	2	8	1547160	1547167	0 %	50 %	0 %	50 %	390961781
29016	NC_018015	GACGTA	2	12	1547254	1547265	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390961781
29017	NC_018015	GCCC	2	8	1547269	1547276	0 %	0 %	25 %	75 %	390961781
29018	NC_018015	TTCG	2	8	1547297	1547304	0 %	50 %	25 %	25 %	390961781
29019	NC_018015	GAA	3	9	1547427	1547435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961782
29020	NC_018015	GAC	2	6	1547446	1547451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961782
29021	NC_018015	GAG	2	6	1547476	1547481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961782
29022	NC_018015	GAG	2	6	1547557	1547562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961782
29023	NC_018015	GGA	2	6	1547568	1547573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961782
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29025	NC_018015	ATA	2	6	1547653	1547658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961782
29026	NC_018015	GAG	2	6	1547668	1547673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961782
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29028	NC_018015	AAG	2	6	1547752	1547757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961782
29029	NC_018015	GA	3	6	1547773	1547778	50 %	0 %	50 %	0 %	390961782
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29032	NC_018015	TCC	2	6	1548012	1548017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961783
29033	NC_018015	TGT	2	6	1548055	1548060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961783
29034	NC_018015	TCG	2	6	1548082	1548087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961783
29035	NC_018015	CGC	2	6	1548148	1548153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961783
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29039	NC_018015	CCGG	2	8	1548234	1548241	0 %	0 %	50 %	50 %	390961783
29040	NC_018015	CGC	2	6	1548247	1548252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961783
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29042	NC_018015	TCA	2	6	1548319	1548324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961783
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29044	NC_018015	GT	3	6	1548366	1548371	0 %	50 %	50 %	0 %	390961783
29045	NC_018015	GCC	2	6	1548383	1548388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961783
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29047	NC_018015	GC	4	8	1548589	1548596	0 %	0 %	50 %	50 %	390961783
29048	NC_018015	CTC	2	6	1548640	1548645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961783
29049	NC_018015	TCT	2	6	1548667	1548672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961783
29050	NC_018015	CGG	2	6	1548733	1548738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961783
29051	NC_018015	GCG	2	6	1548744	1548749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961783
29052	NC_018015	GGCC	2	8	1548787	1548794	0 %	0 %	50 %	50 %	390961783
29053	NC_018015	ACG	2	6	1548810	1548815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961783
29054	NC_018015	TTG	2	6	1548828	1548833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961783
29055	NC_018015	CGC	2	6	1548841	1548846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961783
29056	NC_018015	TGTCGA	2	12	1548877	1548888	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390961783
29057	NC_018015	TC	3	6	1549051	1549056	0 %	50 %	0 %	50 %	390961783
29058	NC_018015	TCT	3	9	1549063	1549071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961783
29059	NC_018015	GAC	2	6	1549106	1549111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961783
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29072	NC_018015	CCA	2	6	1549874	1549879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961785
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29078	NC_018015	CAGTAT	2	12	1550010	1550021	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	390961785
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29098	NC_018015	CTCC	2	8	1551039	1551046	0 %	25 %	0 %	75 %	390961787
29099	NC_018015	CTT	3	9	1551067	1551075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961787
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29102	NC_018015	CT	3	6	1551260	1551265	0 %	50 %	0 %	50 %	390961787
29103	NC_018015	CTC	2	6	1551290	1551295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961787
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29107	NC_018015	AGC	2	6	1551452	1551457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961787
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29109	NC_018015	GGCCT	2	10	1551469	1551478	0 %	20 %	40 %	40 %	390961787
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29111	NC_018015	CTGG	2	8	1551508	1551515	0 %	25 %	50 %	25 %	390961787
29112	NC_018015	CGA	2	6	1551561	1551566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961787
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29114	NC_018015	ACAA	2	8	1551800	1551807	75 %	0 %	0 %	25 %	390961787
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29116	NC_018015	CTCC	2	8	1551855	1551862	0 %	25 %	0 %	75 %	390961788
29117	NC_018015	CGA	2	6	1551882	1551887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961788
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29220	NC_018015	CCA	2	6	1557073	1557078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961796
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29224	NC_018015	CGA	2	6	1557248	1557253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961796
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29232	NC_018015	CTC	2	6	1557892	1557897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961797
29233	NC_018015	CTCA	2	8	1557935	1557942	25 %	25 %	0 %	50 %	390961797
29234	NC_018015	CGA	2	6	1558081	1558086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961797
29235	NC_018015	TGAA	2	8	1558122	1558129	50 %	25 %	25 %	0 %	390961797
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29324	NC_018015	GAAG	2	8	1563100	1563107	50 %	0 %	50 %	0 %	390961804
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29330	NC_018015	AGG	2	6	1563492	1563497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961804
29331	NC_018015	CG	3	6	1563513	1563518	0 %	0 %	50 %	50 %	390961804
29332	NC_018015	TAA	2	6	1563534	1563539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961804
29333	NC_018015	GAC	2	6	1563643	1563648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961804
29334	NC_018015	GCG	2	6	1563656	1563661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961804
29335	NC_018015	GGAGCT	2	12	1563715	1563726	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390961804
29336	NC_018015	GGA	2	6	1563796	1563801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961804
29337	NC_018015	TGG	3	9	1563981	1563989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961805
29338	NC_018015	TCC	2	6	1564051	1564056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961805
29339	NC_018015	ATG	2	6	1564059	1564064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961805
29340	NC_018015	GGCA	2	8	1564065	1564072	25 %	0 %	50 %	25 %	390961805
29341	NC_018015	ATC	2	6	1564083	1564088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961805
29342	NC_018015	TCTCG	2	10	1564115	1564124	0 %	40 %	20 %	40 %	390961805
29343	NC_018015	CTG	2	6	1564140	1564145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961805
29344	NC_018015	CGT	2	6	1564235	1564240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961805
29345	NC_018015	TGG	2	6	1564241	1564246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961805
29346	NC_018015	CAT	2	6	1564298	1564303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961805
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29348	NC_018015	TAC	3	9	1564362	1564370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961805
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