MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_018015	TGG	2	6	1441660	1441665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961658
27003	NC_018015	GGA	2	6	1441666	1441671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961658
27004	NC_018015	TCG	2	6	1441678	1441683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961658
27005	NC_018015	TTG	2	6	1441856	1441861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961659
27006	NC_018015	GTG	2	6	1441862	1441867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961659
27007	NC_018015	TCC	2	6	1441935	1441940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961659
27008	NC_018015	AGG	2	6	1441947	1441952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961659
27009	NC_018015	CTC	2	6	1442025	1442030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961659
27010	NC_018015	GAG	2	6	1442080	1442085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961659
27011	NC_018015	CGG	2	6	1442100	1442105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961659
27012	NC_018015	TCCC	2	8	1442128	1442135	0 %	25 %	0 %	75 %	390961659
27013	NC_018015	TTG	2	6	1442383	1442388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961660
27014	NC_018015	TCT	2	6	1442435	1442440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961660
27015	NC_018015	AAG	2	6	1442598	1442603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961660
27016	NC_018015	GGT	2	6	1442612	1442617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961660
27017	NC_018015	CTC	2	6	1442774	1442779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961661
27018	NC_018015	TC	3	6	1442831	1442836	0 %	50 %	0 %	50 %	390961661
27019	NC_018015	GAAGAC	2	12	1442876	1442887	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	390961661
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27021	NC_018015	TCCT	2	8	1443114	1443121	0 %	50 %	0 %	50 %	390961661
27022	NC_018015	GGTCGC	2	12	1443163	1443174	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	390961661
27023	NC_018015	GGA	2	6	1443196	1443201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961661
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27025	NC_018015	GGA	2	6	1443297	1443302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961661
27026	NC_018015	CTT	2	6	1443344	1443349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961661
27027	NC_018015	TCT	2	6	1443402	1443407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961661
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27032	NC_018015	GAAT	2	8	1443767	1443774	50 %	25 %	25 %	0 %	390961661
27033	NC_018015	CCT	2	6	1444124	1444129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961662
27034	NC_018015	TCC	2	6	1444167	1444172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961662
27035	NC_018015	AT	3	6	1444179	1444184	50 %	50 %	0 %	0 %	390961662
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27038	NC_018015	CG	3	6	1444250	1444255	0 %	0 %	50 %	50 %	390961662
27039	NC_018015	TTC	2	6	1444336	1444341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961662
27040	NC_018015	AGC	2	6	1444381	1444386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961662
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27042	NC_018015	AGG	2	6	1444567	1444572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961662
27043	NC_018015	GAG	2	6	1444662	1444667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961662
27044	NC_018015	CTC	2	6	1444782	1444787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961662
27045	NC_018015	TGA	2	6	1444864	1444869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961662
27046	NC_018015	GAG	2	6	1444941	1444946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961662
27047	NC_018015	TAC	2	6	1444968	1444973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961662
27048	NC_018015	TTC	2	6	1445017	1445022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961662
27049	NC_018015	CAC	2	6	1445064	1445069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961662
27050	NC_018015	AAG	2	6	1445076	1445081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961662
27051	NC_018015	TGC	2	6	1445105	1445110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961662
27052	NC_018015	AGG	2	6	1445190	1445195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961662
27053	NC_018015	GAGGAA	2	12	1445224	1445235	50 %	0 %	50 %	0 %	390961662
27054	NC_018015	CGA	2	6	1445302	1445307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961663
27055	NC_018015	GAG	2	6	1445330	1445335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961663
27056	NC_018015	GAG	2	6	1445354	1445359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961663
27057	NC_018015	GGC	2	6	1445401	1445406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961663
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27060	NC_018015	CGA	2	6	1445519	1445524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961664
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27116	NC_018015	ATC	2	6	1448392	1448397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961668
27117	NC_018015	GGA	2	6	1448441	1448446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961668
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