MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_018015	TTCAC	2	10	1415044	1415053	20 %	40 %	0 %	40 %	390961626
26503	NC_018015	ACG	2	6	1415086	1415091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961626
26504	NC_018015	C	6	6	1415209	1415214	0 %	0 %	0 %	100 %	390961626
26505	NC_018015	TCG	2	6	1415250	1415255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961626
26506	NC_018015	ACA	2	6	1415263	1415268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961626
26507	NC_018015	GAA	2	6	1415354	1415359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961626
26508	NC_018015	TTA	2	6	1415462	1415467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961627
26509	NC_018015	GGC	2	6	1415485	1415490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961627
26510	NC_018015	ACC	2	6	1415500	1415505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961627
26511	NC_018015	TGG	3	9	1415555	1415563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961627
26512	NC_018015	GA	3	6	1415767	1415772	50 %	0 %	50 %	0 %	390961627
26513	NC_018015	ACTG	2	8	1415865	1415872	25 %	25 %	25 %	25 %	390961627
26514	NC_018015	CAA	2	6	1416003	1416008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961627
26515	NC_018015	GAC	2	6	1416084	1416089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961627
26516	NC_018015	GCC	2	6	1416166	1416171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961627
26517	NC_018015	GGT	2	6	1416198	1416203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961627
26518	NC_018015	GGA	2	6	1416286	1416291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961628
26519	NC_018015	GAA	2	6	1416319	1416324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961628
26520	NC_018015	AGA	2	6	1416336	1416341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961628
26521	NC_018015	GAG	2	6	1416392	1416397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961628
26522	NC_018015	AGG	2	6	1416401	1416406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961628
26523	NC_018015	TAC	3	9	1416440	1416448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961628
26524	NC_018015	CTC	2	6	1416485	1416490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961628
26525	NC_018015	AG	3	6	1416501	1416506	50 %	0 %	50 %	0 %	390961628
26526	NC_018015	TTC	2	6	1416645	1416650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961629
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26528	NC_018015	TTA	2	6	1416702	1416707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961629
26529	NC_018015	CCT	2	6	1416738	1416743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961629
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26531	NC_018015	TCCC	2	8	1416911	1416918	0 %	25 %	0 %	75 %	390961629
26532	NC_018015	CTTC	2	8	1416919	1416926	0 %	50 %	0 %	50 %	390961629
26533	NC_018015	GTC	2	6	1416937	1416942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961629
26534	NC_018015	TCG	2	6	1416965	1416970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961629
26535	NC_018015	GCCT	2	8	1416983	1416990	0 %	25 %	25 %	50 %	390961629
26536	NC_018015	GGA	2	6	1417014	1417019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961629
26537	NC_018015	C	6	6	1417031	1417036	0 %	0 %	0 %	100 %	390961629
26538	NC_018015	GTG	2	6	1417115	1417120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961630
26539	NC_018015	TTC	2	6	1417125	1417130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961630
26540	NC_018015	TCC	2	6	1417209	1417214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961630
26541	NC_018015	ACGAAG	2	12	1417221	1417232	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	390961630
26542	NC_018015	CCCT	2	8	1417236	1417243	0 %	25 %	0 %	75 %	390961630
26543	NC_018015	CAT	2	6	1417249	1417254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961630
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26549	NC_018015	GAA	2	6	1417418	1417423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961630
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26551	NC_018015	CTT	2	6	1417487	1417492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961630
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26553	NC_018015	TTA	2	6	1417543	1417548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961630
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26555	NC_018015	ATAG	2	8	1417660	1417667	50 %	25 %	25 %	0 %	390961631
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26562	NC_018015	CCCT	2	8	1417952	1417959	0 %	25 %	0 %	75 %	390961631
26563	NC_018015	CGA	2	6	1417962	1417967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961631
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