MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_018015	GAG	2	6	1365255	1365260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961567
25503	NC_018015	AGC	2	6	1365322	1365327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961567
25504	NC_018015	CG	3	6	1365363	1365368	0 %	0 %	50 %	50 %	390961567
25505	NC_018015	CCA	2	6	1365391	1365396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961567
25506	NC_018015	AGG	2	6	1365400	1365405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961567
25507	NC_018015	GGAGA	2	10	1365453	1365462	40 %	0 %	60 %	0 %	390961567
25508	NC_018015	GAAAGA	2	12	1365532	1365543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961567
25509	NC_018015	CTC	2	6	1365555	1365560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961568
25510	NC_018015	CTC	3	9	1365570	1365578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961568
25511	NC_018015	TCCTTC	2	12	1365580	1365591	0 %	50 %	0 %	50 %	390961568
25512	NC_018015	CTC	2	6	1365600	1365605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961568
25513	NC_018015	CGG	2	6	1365621	1365626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961568
25514	NC_018015	CTC	2	6	1365672	1365677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961568
25515	NC_018015	G	6	6	1365718	1365723	0 %	0 %	100 %	0 %	390961568
25516	NC_018015	GCCT	2	8	1365737	1365744	0 %	25 %	25 %	50 %	390961568
25517	NC_018015	CCTT	2	8	1365749	1365756	0 %	50 %	0 %	50 %	390961568
25518	NC_018015	G	6	6	1365757	1365762	0 %	0 %	100 %	0 %	390961568
25519	NC_018015	CGC	2	6	1365812	1365817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961568
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25521	NC_018015	G	6	6	1365850	1365855	0 %	0 %	100 %	0 %	390961568
25522	NC_018015	TCC	2	6	1365885	1365890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961568
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25525	NC_018015	GAG	2	6	1366169	1366174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961569
25526	NC_018015	GAGG	2	8	1366223	1366230	25 %	0 %	75 %	0 %	390961569
25527	NC_018015	GGAA	2	8	1366253	1366260	50 %	0 %	50 %	0 %	390961569
25528	NC_018015	CTT	2	6	1366262	1366267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961569
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25532	NC_018015	CGA	2	6	1366534	1366539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961569
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25535	NC_018015	AGGGC	2	10	1366635	1366644	20 %	0 %	60 %	20 %	390961569
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25537	NC_018015	CGA	2	6	1366792	1366797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961569
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25539	NC_018015	ATG	2	6	1366826	1366831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961569
25540	NC_018015	GAG	2	6	1366859	1366864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961569
25541	NC_018015	TCC	2	6	1366869	1366874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961569
25542	NC_018015	CGA	2	6	1366888	1366893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961569
25543	NC_018015	GTCGAA	2	12	1366988	1366999	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390961569
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25545	NC_018015	TCG	2	6	1367040	1367045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961569
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25551	NC_018015	ACG	2	6	1367295	1367300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961569
25552	NC_018015	GAAG	2	8	1367325	1367332	50 %	0 %	50 %	0 %	390961569
25553	NC_018015	CGA	2	6	1367344	1367349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961569
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25555	NC_018015	CGA	2	6	1367383	1367388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961569
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25574	NC_018015	GCG	2	6	1368685	1368690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961571
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25585	NC_018015	CGGC	2	8	1369207	1369214	0 %	0 %	50 %	50 %	390961571
25586	NC_018015	GAC	2	6	1369241	1369246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961571
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25600	NC_018015	AGTG	2	8	1369964	1369971	25 %	25 %	50 %	0 %	390961572
25601	NC_018015	ACC	2	6	1370034	1370039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961572
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25603	NC_018015	CTT	2	6	1370231	1370236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961572
25604	NC_018015	TCA	2	6	1370248	1370253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961572
25605	NC_018015	CGAGAT	2	12	1370279	1370290	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390961572
25606	NC_018015	GCC	2	6	1370358	1370363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961572
25607	NC_018015	GCA	2	6	1370413	1370418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961572
25608	NC_018015	CT	3	6	1370494	1370499	0 %	50 %	0 %	50 %	390961572
25609	NC_018015	TCT	2	6	1370503	1370508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961572
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25613	NC_018015	GCC	2	6	1370688	1370693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961572
25614	NC_018015	CTTCC	2	10	1370698	1370707	0 %	40 %	0 %	60 %	390961572
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25616	NC_018015	CTC	2	6	1370829	1370834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961572
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