MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_018015	CTC	2	6	1339790	1339795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961538
25003	NC_018015	GGT	2	6	1339824	1339829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961538
25004	NC_018015	CTC	2	6	1339897	1339902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961538
25005	NC_018015	CCG	2	6	1339917	1339922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961538
25006	NC_018015	GCC	2	6	1339924	1339929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961538
25007	NC_018015	CCTT	2	8	1339977	1339984	0 %	50 %	0 %	50 %	390961538
25008	NC_018015	AAG	2	6	1339988	1339993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961538
25009	NC_018015	CTC	2	6	1339999	1340004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961538
25010	NC_018015	CGT	2	6	1340013	1340018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961538
25011	NC_018015	TCA	2	6	1340049	1340054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961538
25012	NC_018015	CGC	2	6	1340076	1340081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961538
25013	NC_018015	GAA	2	6	1340137	1340142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961538
25014	NC_018015	AGGG	2	8	1340153	1340160	25 %	0 %	75 %	0 %	390961538
25015	NC_018015	CTC	2	6	1340179	1340184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961538
25016	NC_018015	CCT	2	6	1340187	1340192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961538
25017	NC_018015	TCC	2	6	1340238	1340243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961538
25018	NC_018015	GGA	3	9	1340257	1340265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961538
25019	NC_018015	CGTGTC	2	12	1340341	1340352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961538
25020	NC_018015	CTTT	2	8	1340370	1340377	0 %	75 %	0 %	25 %	390961538
25021	NC_018015	GAC	2	6	1340383	1340388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961538
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25024	NC_018015	GGGA	2	8	1340974	1340981	25 %	0 %	75 %	0 %	390961539
25025	NC_018015	TTC	2	6	1340984	1340989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961539
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25028	NC_018015	GTA	2	6	1341069	1341074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961539
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25030	NC_018015	GTA	2	6	1341129	1341134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961539
25031	NC_018015	GAG	2	6	1341156	1341161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961539
25032	NC_018015	AGT	2	6	1341191	1341196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961539
25033	NC_018015	GGA	2	6	1341209	1341214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961539
25034	NC_018015	CTTT	2	8	1341347	1341354	0 %	75 %	0 %	25 %	390961539
25035	NC_018015	TGA	2	6	1341428	1341433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961539
25036	NC_018015	TGG	2	6	1341449	1341454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961539
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25038	NC_018015	CGA	2	6	1341521	1341526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961539
25039	NC_018015	GGC	2	6	1341591	1341596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961539
25040	NC_018015	AGG	2	6	1341638	1341643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961539
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25042	NC_018015	TCG	2	6	1341710	1341715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961539
25043	NC_018015	TCG	2	6	1341772	1341777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961539
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25046	NC_018015	CTG	2	6	1341891	1341896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961539
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25050	NC_018015	CTC	2	6	1342066	1342071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961540
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25055	NC_018015	CAT	2	6	1342320	1342325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961540
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25116	NC_018015	GTC	2	6	1344975	1344980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961541
25117	NC_018015	GCCT	2	8	1345119	1345126	0 %	25 %	25 %	50 %	390961541
25118	NC_018015	CAGC	2	8	1345155	1345162	25 %	0 %	25 %	50 %	390961541
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25229	NC_018015	GCC	2	6	1350900	1350905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961551
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25231	NC_018015	GTCC	2	8	1350918	1350925	0 %	25 %	25 %	50 %	390961551
25232	NC_018015	GGT	2	6	1350960	1350965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961551
25233	NC_018015	TTC	2	6	1350967	1350972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961551
25234	NC_018015	TC	3	6	1351037	1351042	0 %	50 %	0 %	50 %	390961551
25235	NC_018015	GTA	2	6	1351065	1351070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961551
25236	NC_018015	GTT	2	6	1351089	1351094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961551
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25238	NC_018015	GCCA	2	8	1351113	1351120	25 %	0 %	25 %	50 %	390961551
25239	NC_018015	CCG	2	6	1351148	1351153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961551
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25242	NC_018015	CAT	2	6	1351239	1351244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961551
25243	NC_018015	CTTG	2	8	1351362	1351369	0 %	50 %	25 %	25 %	390961551
25244	NC_018015	GTA	2	6	1351389	1351394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961551
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25247	NC_018015	ATC	2	6	1351617	1351622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961552
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25249	NC_018015	GGA	2	6	1351709	1351714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961552
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25262	NC_018015	TCT	2	6	1352504	1352509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961553
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25308	NC_018015	GTA	2	6	1355251	1355256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961556
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25312	NC_018015	CTG	2	6	1355350	1355355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961556
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25316	NC_018015	GCGGA	2	10	1355434	1355443	20 %	0 %	60 %	20 %	390961556
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25322	NC_018015	AGCTT	2	10	1355673	1355682	20 %	40 %	20 %	20 %	390961556
25323	NC_018015	TCC	2	6	1355696	1355701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961556
25324	NC_018015	ATGGCA	2	12	1355938	1355949	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390961557
25325	NC_018015	GTG	2	6	1355950	1355955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961557
25326	NC_018015	GAG	2	6	1355977	1355982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961557
25327	NC_018015	G	6	6	1356002	1356007	0 %	0 %	100 %	0 %	390961557
25328	NC_018015	GCTCCA	2	12	1356039	1356050	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390961557
25329	NC_018015	CGA	2	6	1356068	1356073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961557
25330	NC_018015	GGC	2	6	1356105	1356110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961557
25331	NC_018015	ACGAG	2	10	1356122	1356131	40 %	0 %	40 %	20 %	390961557
25332	NC_018015	TCCC	2	8	1356145	1356152	0 %	25 %	0 %	75 %	390961557
25333	NC_018015	CGTTA	2	10	1356163	1356172	20 %	40 %	20 %	20 %	390961557
25334	NC_018015	CGG	2	6	1356198	1356203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961557
25335	NC_018015	AGC	2	6	1356215	1356220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961557
25336	NC_018015	TTCA	2	8	1356253	1356260	25 %	50 %	0 %	25 %	390961557
25337	NC_018015	AGC	2	6	1356351	1356356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961557
25338	NC_018015	CGT	2	6	1356486	1356491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961557
25339	NC_018015	GCG	2	6	1356499	1356504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961557
25340	NC_018015	GGT	2	6	1356531	1356536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961557
25341	NC_018015	GCC	2	6	1356640	1356645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961557
25342	NC_018015	TGG	2	6	1356686	1356691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961557
25343	NC_018015	CGACC	2	10	1356705	1356714	20 %	0 %	20 %	60 %	390961557
25344	NC_018015	GAG	3	9	1356727	1356735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961557
25345	NC_018015	GAA	2	6	1356750	1356755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961557
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25347	NC_018015	GCG	2	6	1356844	1356849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961557
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25463	NC_018015	CAG	2	6	1363310	1363315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961563
25464	NC_018015	GGA	2	6	1363316	1363321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961563
25465	NC_018015	GGC	2	6	1363337	1363342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961563
25466	NC_018015	CTT	2	6	1363400	1363405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961563
25467	NC_018015	ACG	2	6	1363414	1363419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961563
25468	NC_018015	GGC	2	6	1363433	1363438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961563
25469	NC_018015	GAA	2	6	1363466	1363471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961563
25470	NC_018015	AGGG	2	8	1363494	1363501	25 %	0 %	75 %	0 %	390961563
25471	NC_018015	TCC	2	6	1363606	1363611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961563
25472	NC_018015	AGG	2	6	1363710	1363715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961563
25473	NC_018015	GAG	2	6	1363862	1363867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961564
25474	NC_018015	TGAGC	2	10	1363870	1363879	20 %	20 %	40 %	20 %	390961564
25475	NC_018015	TCA	2	6	1363893	1363898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961564
25476	NC_018015	TAC	2	6	1363937	1363942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961564
25477	NC_018015	GGT	2	6	1363984	1363989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961564
25478	NC_018015	GCTCA	2	10	1363994	1364003	20 %	20 %	20 %	40 %	390961564
25479	NC_018015	GAG	2	6	1364018	1364023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961564
25480	NC_018015	GAGGTC	2	12	1364039	1364050	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390961564
25481	NC_018015	AAG	2	6	1364057	1364062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961564
25482	NC_018015	GAG	2	6	1364075	1364080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961564
25483	NC_018015	AAT	2	6	1364086	1364091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961564
25484	NC_018015	GCC	2	6	1364113	1364118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961564
25485	NC_018015	TGAAG	2	10	1364121	1364130	40 %	20 %	40 %	0 %	390961564
25486	NC_018015	CGA	2	6	1364247	1364252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961565
25487	NC_018015	TCC	2	6	1364262	1364267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961565
25488	NC_018015	GGT	2	6	1364332	1364337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961565
25489	NC_018015	CT	3	6	1364357	1364362	0 %	50 %	0 %	50 %	390961565
25490	NC_018015	TTC	2	6	1364404	1364409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961566
25491	NC_018015	C	6	6	1364466	1364471	0 %	0 %	0 %	100 %	390961566
25492	NC_018015	TTC	2	6	1364559	1364564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961566
25493	NC_018015	CCT	2	6	1364630	1364635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961566
25494	NC_018015	CCA	2	6	1364665	1364670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961566
25495	NC_018015	TTC	2	6	1364695	1364700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961566
25496	NC_018015	GTC	3	9	1364720	1364728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961566
25497	NC_018015	CGA	2	6	1364767	1364772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961566
25498	NC_018015	CTCACC	2	12	1364828	1364839	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	390961566
25499	NC_018015	CGG	2	6	1365134	1365139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961567
25500	NC_018015	GCAG	2	8	1365175	1365182	25 %	0 %	50 %	25 %	390961567

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