MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_018015	TCG	2	6	107123	107128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960287
2002	NC_018015	CTC	2	6	107305	107310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960287
2003	NC_018015	GAG	2	6	107335	107340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960287
2004	NC_018015	CTT	2	6	107344	107349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960287
2005	NC_018015	GGC	2	6	107356	107361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960287
2006	NC_018015	GCCTTC	2	12	107372	107383	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390960287
2007	NC_018015	TCA	2	6	107405	107410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960287
2008	NC_018015	TCT	2	6	107499	107504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960287
2009	NC_018015	CTCC	2	8	107554	107561	0 %	25 %	0 %	75 %	390960287
2010	NC_018015	TCC	2	6	107576	107581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960287
2011	NC_018015	GA	3	6	107597	107602	50 %	0 %	50 %	0 %	390960287
2012	NC_018015	GTG	2	6	107614	107619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960287
2013	NC_018015	GTA	2	6	107650	107655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960287
2014	NC_018015	CTC	2	6	107695	107700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960287
2015	NC_018015	TGT	2	6	107838	107843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960287
2016	NC_018015	GGT	2	6	107866	107871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960287
2017	NC_018015	GTT	2	6	107872	107877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960287
2018	NC_018015	ACCA	2	8	107908	107915	50 %	0 %	0 %	50 %	390960287
2019	NC_018015	CGTTC	2	10	108026	108035	0 %	40 %	20 %	40 %	390960288
2020	NC_018015	TGA	2	6	108175	108180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960288
2021	NC_018015	ACC	2	6	108186	108191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960288
2022	NC_018015	CCA	2	6	108214	108219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390960288
2023	NC_018015	CTC	2	6	108293	108298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960288
2024	NC_018015	CCG	2	6	108364	108369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960289
2025	NC_018015	CT	3	6	108394	108399	0 %	50 %	0 %	50 %	390960289
2026	NC_018015	CGA	2	6	108439	108444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960289
2027	NC_018015	ATC	2	6	108471	108476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960289
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2029	NC_018015	GCC	2	6	108522	108527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960289
2030	NC_018015	GAGG	2	8	108530	108537	25 %	0 %	75 %	0 %	390960289
2031	NC_018015	AGA	2	6	108541	108546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960289
2032	NC_018015	ATT	2	6	108618	108623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390960289
2033	NC_018015	CCG	2	6	108624	108629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960289
2034	NC_018015	TCTCCA	2	12	108711	108722	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	390960289
2035	NC_018015	GTT	2	6	108731	108736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390960289
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2040	NC_018015	CGC	2	6	108908	108913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390960289
2041	NC_018015	GGA	2	6	108914	108919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960289
2042	NC_018015	TGG	2	6	109219	109224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960290
2043	NC_018015	TTC	2	6	109319	109324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960290
2044	NC_018015	GGA	2	6	109329	109334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960290
2045	NC_018015	A	6	6	109377	109382	100 %	0 %	0 %	0 %	390960290
2046	NC_018015	TC	3	6	109403	109408	0 %	50 %	0 %	50 %	390960290
2047	NC_018015	GTCCTG	2	12	109416	109427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960290
2048	NC_018015	GTG	2	6	109431	109436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960290
2049	NC_018015	CGG	2	6	109463	109468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960290
2050	NC_018015	CTA	2	6	109586	109591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960290
2051	NC_018015	CCGC	2	8	109601	109608	0 %	0 %	25 %	75 %	390960290
2052	NC_018015	GTG	2	6	109635	109640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960290
2053	NC_018015	GAAA	2	8	109679	109686	75 %	0 %	25 %	0 %	390960290
2054	NC_018015	CTT	2	6	109762	109767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390960291
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2056	NC_018015	CGCCGA	2	12	109992	110003	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	390960291
2057	NC_018015	GAA	2	6	110026	110031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960291
2058	NC_018015	ACG	2	6	110126	110131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960291
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2061	NC_018015	GAGG	2	8	110287	110294	25 %	0 %	75 %	0 %	390960291
2062	NC_018015	GCG	2	6	110306	110311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960291
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2072	NC_018015	TGCC	2	8	111187	111194	0 %	25 %	25 %	50 %	390960292
2073	NC_018015	GTC	2	6	111207	111212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960292
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2080	NC_018015	C	6	6	111519	111524	0 %	0 %	0 %	100 %	390960293
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2092	NC_018015	TCAACG	2	12	112238	112249	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390960293
2093	NC_018015	G	6	6	112329	112334	0 %	0 %	100 %	0 %	390960293
2094	NC_018015	TC	3	6	112363	112368	0 %	50 %	0 %	50 %	390960293
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2104	NC_018015	CA	3	6	113088	113093	50 %	0 %	0 %	50 %	390960294
2105	NC_018015	AGG	2	6	113131	113136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960294
2106	NC_018015	TAC	2	6	113226	113231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960294
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2111	NC_018015	GAGC	2	8	113384	113391	25 %	0 %	50 %	25 %	390960294
2112	NC_018015	GGC	2	6	113399	113404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390960294
2113	NC_018015	CGA	2	6	113423	113428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960294
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2118	NC_018015	GGA	2	6	113537	113542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960294
2119	NC_018015	TAC	2	6	113604	113609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960294
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2121	NC_018015	CGA	2	6	113756	113761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960294
2122	NC_018015	GAG	2	6	113832	113837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960294
2123	NC_018015	GAG	2	6	113895	113900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960294
2124	NC_018015	GGA	2	6	113915	113920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960294
2125	NC_018015	AAG	2	6	113971	113976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390960294
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2239	NC_018015	CGAGGT	2	12	119787	119798	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390960300
2240	NC_018015	TCC	2	6	119882	119887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960300
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2242	NC_018015	CGTTCT	2	12	119931	119942	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	390960300
2243	NC_018015	CGA	2	6	119955	119960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960300
2244	NC_018015	CT	3	6	120018	120023	0 %	50 %	0 %	50 %	390960300
2245	NC_018015	GAC	2	6	120064	120069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390960300
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2255	NC_018015	TCG	2	6	120854	120859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960301
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2351	NC_018015	GAG	2	6	126176	126181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960307
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2354	NC_018015	CGTCA	2	10	126269	126278	20 %	20 %	20 %	40 %	390960307
2355	NC_018015	CTC	2	6	126322	126327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390960307
2356	NC_018015	GTA	2	6	126501	126506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390960308
2357	NC_018015	TAC	2	6	126603	126608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390960308
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2359	NC_018015	GTG	2	6	126657	126662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390960308
2360	NC_018015	GGA	2	6	126686	126691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390960308
2361	NC_018015	TCG	2	6	126715	126720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390960308
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