MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_018015	TCCT	2	8	1258043	1258050	0 %	50 %	0 %	50 %	390961464
23502	NC_018015	AGG	2	6	1258053	1258058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961464
23503	NC_018015	TCT	2	6	1258117	1258122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961464
23504	NC_018015	CCT	2	6	1258123	1258128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961464
23505	NC_018015	CAG	2	6	1258139	1258144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961464
23506	NC_018015	TCG	2	6	1258183	1258188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961464
23507	NC_018015	TCG	2	6	1258191	1258196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961464
23508	NC_018015	CGC	3	9	1258255	1258263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961464
23509	NC_018015	CTCC	2	8	1258280	1258287	0 %	25 %	0 %	75 %	390961464
23510	NC_018015	CTC	2	6	1258364	1258369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961464
23511	NC_018015	CTG	2	6	1258432	1258437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961464
23512	NC_018015	CGA	2	6	1258498	1258503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961464
23513	NC_018015	GAAA	2	8	1258616	1258623	75 %	0 %	25 %	0 %	390961464
23514	NC_018015	C	6	6	1258653	1258658	0 %	0 %	0 %	100 %	390961465
23515	NC_018015	AGG	2	6	1258673	1258678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961465
23516	NC_018015	AGAA	2	8	1258682	1258689	75 %	0 %	25 %	0 %	390961465
23517	NC_018015	GC	3	6	1258692	1258697	0 %	0 %	50 %	50 %	390961465
23518	NC_018015	AGG	2	6	1258757	1258762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961465
23519	NC_018015	ACG	2	6	1258769	1258774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961465
23520	NC_018015	CCG	2	6	1258784	1258789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961465
23521	NC_018015	GC	3	6	1258794	1258799	0 %	0 %	50 %	50 %	390961465
23522	NC_018015	GGT	2	6	1258818	1258823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961465
23523	NC_018015	GAG	3	9	1258831	1258839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961465
23524	NC_018015	TAT	2	6	1258876	1258881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961465
23525	NC_018015	GAG	2	6	1258984	1258989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961465
23526	NC_018015	GAG	2	6	1259035	1259040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961465
23527	NC_018015	TC	3	6	1259066	1259071	0 %	50 %	0 %	50 %	390961465
23528	NC_018015	TGA	3	9	1259136	1259144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961465
23529	NC_018015	CAG	2	6	1259191	1259196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961465
23530	NC_018015	GGCCAG	2	12	1259269	1259280	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	390961465
23531	NC_018015	GCC	2	6	1259281	1259286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961465
23532	NC_018015	GCCC	2	8	1259329	1259336	0 %	0 %	25 %	75 %	390961465
23533	NC_018015	CGCCA	2	10	1259395	1259404	20 %	0 %	20 %	60 %	390961465
23534	NC_018015	GAA	2	6	1259512	1259517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961465
23535	NC_018015	TGCC	2	8	1259550	1259557	0 %	25 %	25 %	50 %	390961465
23536	NC_018015	GGA	2	6	1259756	1259761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961466
23537	NC_018015	TGC	3	9	1259783	1259791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961466
23538	NC_018015	CGC	2	6	1259808	1259813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961466
23539	NC_018015	GTG	3	9	1259824	1259832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961466
23540	NC_018015	ATC	2	6	1259854	1259859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961466
23541	NC_018015	C	6	6	1259869	1259874	0 %	0 %	0 %	100 %	390961466
23542	NC_018015	CAC	2	6	1259943	1259948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961466
23543	NC_018015	CTA	2	6	1259970	1259975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961466
23544	NC_018015	CGG	2	6	1259985	1259990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961466
23545	NC_018015	AGG	2	6	1259999	1260004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961466
23546	NC_018015	ACC	2	6	1260016	1260021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961466
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23548	NC_018015	TCT	2	6	1260086	1260091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961466
23549	NC_018015	TCC	2	6	1260117	1260122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961466
23550	NC_018015	CTA	2	6	1260195	1260200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961466
23551	NC_018015	CGT	2	6	1260201	1260206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961466
23552	NC_018015	CTTC	2	8	1260261	1260268	0 %	50 %	0 %	50 %	390961466
23553	NC_018015	TAC	2	6	1260313	1260318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961466
23554	NC_018015	CTGG	2	8	1260406	1260413	0 %	25 %	50 %	25 %	390961466
23555	NC_018015	ACA	2	6	1260419	1260424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961466
23556	NC_018015	CGT	2	6	1260429	1260434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961466
23557	NC_018015	CT	3	6	1260490	1260495	0 %	50 %	0 %	50 %	390961466
23558	NC_018015	GGGC	2	8	1260569	1260576	0 %	0 %	75 %	25 %	390961466
23559	NC_018015	CTC	2	6	1260598	1260603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961466
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23564	NC_018015	TAC	2	6	1260835	1260840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961466
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23584	NC_018015	CTGAT	2	10	1261672	1261681	20 %	40 %	20 %	20 %	390961466
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23602	NC_018015	TATTGA	2	12	1262546	1262557	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	390961467
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23604	NC_018015	AG	3	6	1262631	1262636	50 %	0 %	50 %	0 %	390961467
23605	NC_018015	AC	3	6	1262749	1262754	50 %	0 %	0 %	50 %	390961467
23606	NC_018015	G	7	7	1262757	1262763	0 %	0 %	100 %	0 %	390961467
23607	NC_018015	ATG	2	6	1262800	1262805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961467
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23611	NC_018015	AT	3	6	1262915	1262920	50 %	50 %	0 %	0 %	390961467
23612	NC_018015	CCAG	2	8	1262930	1262937	25 %	0 %	25 %	50 %	390961467
23613	NC_018015	TGG	2	6	1262999	1263004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961467
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