MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_018015	GAG	2	6	1232253	1232258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961435
23003	NC_018015	TCA	2	6	1232326	1232331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961435
23004	NC_018015	CG	3	6	1232368	1232373	0 %	0 %	50 %	50 %	390961435
23005	NC_018015	CTC	2	6	1232412	1232417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961435
23006	NC_018015	GAG	2	6	1232442	1232447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961435
23007	NC_018015	CCT	3	9	1232498	1232506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961435
23008	NC_018015	TCC	2	6	1232507	1232512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961435
23009	NC_018015	GCC	3	9	1232514	1232522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961435
23010	NC_018015	GCC	2	6	1232544	1232549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961435
23011	NC_018015	CTT	2	6	1232728	1232733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961436
23012	NC_018015	CTC	2	6	1232749	1232754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961436
23013	NC_018015	CTT	2	6	1232791	1232796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961436
23014	NC_018015	CTTC	2	8	1232814	1232821	0 %	50 %	0 %	50 %	390961436
23015	NC_018015	GGT	2	6	1232848	1232853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961436
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23017	NC_018015	CTT	2	6	1232923	1232928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961436
23018	NC_018015	TC	3	6	1232993	1232998	0 %	50 %	0 %	50 %	390961436
23019	NC_018015	CCT	2	6	1233093	1233098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961436
23020	NC_018015	TCC	2	6	1233165	1233170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961436
23021	NC_018015	TCT	2	6	1233210	1233215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961436
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23025	NC_018015	CAT	2	6	1233408	1233413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961437
23026	NC_018015	TC	3	6	1233439	1233444	0 %	50 %	0 %	50 %	390961437
23027	NC_018015	GGA	2	6	1233487	1233492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961437
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23029	NC_018015	C	6	6	1233518	1233523	0 %	0 %	0 %	100 %	390961437
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23032	NC_018015	CGA	2	6	1233604	1233609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961437
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23051	NC_018015	TC	3	6	1234317	1234322	0 %	50 %	0 %	50 %	390961438
23052	NC_018015	TGG	2	6	1234349	1234354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961438
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23055	NC_018015	CAT	2	6	1234485	1234490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961438
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23101	NC_018015	CT	3	6	1236607	1236612	0 %	50 %	0 %	50 %	390961440
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23117	NC_018015	TCC	2	6	1237396	1237401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961440
23118	NC_018015	CCTG	2	8	1237417	1237424	0 %	25 %	25 %	50 %	390961440
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23348	NC_018015	GGA	2	6	1249307	1249312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961454
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23464	NC_018015	CTC	2	6	1255918	1255923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961461
23465	NC_018015	GCG	2	6	1255944	1255949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961461
23466	NC_018015	AAGCTC	2	12	1255969	1255980	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390961461
23467	NC_018015	CGC	2	6	1256070	1256075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961461
23468	NC_018015	TCG	2	6	1256096	1256101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961461
23469	NC_018015	CTCC	2	8	1256141	1256148	0 %	25 %	0 %	75 %	390961462
23470	NC_018015	AGG	2	6	1256283	1256288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961462
23471	NC_018015	AGG	2	6	1256388	1256393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961462
23472	NC_018015	ACGTAG	2	12	1256394	1256405	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	390961462
23473	NC_018015	TC	3	6	1256424	1256429	0 %	50 %	0 %	50 %	390961462
23474	NC_018015	CGG	2	6	1256443	1256448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961462
23475	NC_018015	TCA	2	6	1256503	1256508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961462
23476	NC_018015	CGA	2	6	1256698	1256703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961462
23477	NC_018015	GCC	2	6	1256733	1256738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961462
23478	NC_018015	TCC	2	6	1256919	1256924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961462
23479	NC_018015	GAG	2	6	1256948	1256953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961462
23480	NC_018015	TC	3	6	1256990	1256995	0 %	50 %	0 %	50 %	390961462
23481	NC_018015	GCG	2	6	1257162	1257167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961462
23482	NC_018015	AAG	2	6	1257185	1257190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961462
23483	NC_018015	CCG	2	6	1257202	1257207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961462
23484	NC_018015	TTC	2	6	1257217	1257222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961462
23485	NC_018015	TGG	2	6	1257235	1257240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961462
23486	NC_018015	CTC	2	6	1257295	1257300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961463
23487	NC_018015	TGA	2	6	1257318	1257323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961463
23488	NC_018015	CGA	2	6	1257324	1257329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961463
23489	NC_018015	CTG	2	6	1257341	1257346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961463
23490	NC_018015	CCT	2	6	1257405	1257410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961463
23491	NC_018015	CTT	2	6	1257424	1257429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961463
23492	NC_018015	GTC	2	6	1257487	1257492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961463
23493	NC_018015	CTC	2	6	1257535	1257540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961463
23494	NC_018015	GTA	2	6	1257658	1257663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961463
23495	NC_018015	CGCCTC	2	12	1257667	1257678	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	390961463
23496	NC_018015	GGT	2	6	1257721	1257726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961463
23497	NC_018015	GGT	3	9	1257847	1257855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961463
23498	NC_018015	TTC	2	6	1257863	1257868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961463
23499	NC_018015	GAA	2	6	1257937	1257942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961464
23500	NC_018015	ATA	2	6	1257996	1258001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961464

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