MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22502	NC_018015	CGC	2	6	1208312	1208317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961409
22503	NC_018015	GTTCG	2	10	1208321	1208330	0 %	40 %	40 %	20 %	390961409
22504	NC_018015	CTT	2	6	1208354	1208359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961409
22505	NC_018015	CGC	2	6	1208479	1208484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961409
22506	NC_018015	CT	3	6	1208548	1208553	0 %	50 %	0 %	50 %	390961410
22507	NC_018015	CGAC	2	8	1208633	1208640	25 %	0 %	25 %	50 %	390961410
22508	NC_018015	CCT	2	6	1208744	1208749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961410
22509	NC_018015	GAC	2	6	1208799	1208804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961410
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22511	NC_018015	TCC	2	6	1208866	1208871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961410
22512	NC_018015	TTG	2	6	1208890	1208895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961410
22513	NC_018015	TAT	2	6	1208904	1208909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961410
22514	NC_018015	TCC	2	6	1208963	1208968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961410
22515	NC_018015	TCC	2	6	1209031	1209036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961410
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22517	NC_018015	CGT	2	6	1209153	1209158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961410
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22520	NC_018015	CTTC	2	8	1209428	1209435	0 %	50 %	0 %	50 %	390961410
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22543	NC_018015	TTA	2	6	1210474	1210479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390961412
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22551	NC_018015	GAAG	2	8	1211144	1211151	50 %	0 %	50 %	0 %	390961413
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22554	NC_018015	CGA	2	6	1211449	1211454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961414
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22559	NC_018015	TC	4	8	1211562	1211569	0 %	50 %	0 %	50 %	390961415
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22600	NC_018015	TC	3	6	1213222	1213227	0 %	50 %	0 %	50 %	390961417
22601	NC_018015	TC	3	6	1213261	1213266	0 %	50 %	0 %	50 %	390961417
22602	NC_018015	CTC	2	6	1213282	1213287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961417
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22607	NC_018015	CCTC	2	8	1213561	1213568	0 %	25 %	0 %	75 %	390961417
22608	NC_018015	GTT	2	6	1213580	1213585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961417
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22615	NC_018015	GGGC	2	8	1213910	1213917	0 %	0 %	75 %	25 %	390961418
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22849	NC_018015	T	7	7	1225075	1225081	0 %	100 %	0 %	0 %	390961429
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22954	NC_018015	ACC	2	6	1230433	1230438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961434
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22959	NC_018015	GA	3	6	1230547	1230552	50 %	0 %	50 %	0 %	390961434
22960	NC_018015	G	6	6	1230626	1230631	0 %	0 %	100 %	0 %	390961434
22961	NC_018015	CTCG	2	8	1230690	1230697	0 %	25 %	25 %	50 %	390961434
22962	NC_018015	GGGC	2	8	1230812	1230819	0 %	0 %	75 %	25 %	390961434
22963	NC_018015	CTC	2	6	1230825	1230830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961434
22964	NC_018015	ATC	2	6	1230841	1230846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961434
22965	NC_018015	GGC	2	6	1230847	1230852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961434
22966	NC_018015	CGAGG	2	10	1230855	1230864	20 %	0 %	60 %	20 %	390961434
22967	NC_018015	TCG	2	6	1230893	1230898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961434
22968	NC_018015	CGT	2	6	1230936	1230941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961434
22969	NC_018015	CTA	2	6	1230984	1230989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961434
22970	NC_018015	ACG	2	6	1230998	1231003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961434
22971	NC_018015	GCTG	2	8	1231074	1231081	0 %	25 %	50 %	25 %	390961434
22972	NC_018015	ATC	2	6	1231101	1231106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961434
22973	NC_018015	ACT	2	6	1231115	1231120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961434
22974	NC_018015	CGT	2	6	1231125	1231130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961434
22975	NC_018015	GGT	2	6	1231236	1231241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961434
22976	NC_018015	ACG	2	6	1231270	1231275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961434
22977	NC_018015	A	6	6	1231283	1231288	100 %	0 %	0 %	0 %	390961434
22978	NC_018015	GCCG	2	8	1231296	1231303	0 %	0 %	50 %	50 %	390961434
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22980	NC_018015	GCCG	2	8	1231353	1231360	0 %	0 %	50 %	50 %	390961434
22981	NC_018015	T	6	6	1231379	1231384	0 %	100 %	0 %	0 %	390961435
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22983	NC_018015	GTA	2	6	1231452	1231457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961435
22984	NC_018015	CAT	2	6	1231503	1231508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961435
22985	NC_018015	TC	3	6	1231563	1231568	0 %	50 %	0 %	50 %	390961435
22986	NC_018015	CAC	2	6	1231569	1231574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961435
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22988	NC_018015	CGA	2	6	1231619	1231624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961435
22989	NC_018015	GAA	2	6	1231625	1231630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961435
22990	NC_018015	GAC	2	6	1231650	1231655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961435
22991	NC_018015	CTT	2	6	1231674	1231679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961435
22992	NC_018015	CGTC	2	8	1231793	1231800	0 %	25 %	25 %	50 %	390961435
22993	NC_018015	CTCG	2	8	1231854	1231861	0 %	25 %	25 %	50 %	390961435
22994	NC_018015	GAG	2	6	1231863	1231868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961435
22995	NC_018015	CGT	2	6	1231913	1231918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961435
22996	NC_018015	CG	3	6	1231954	1231959	0 %	0 %	50 %	50 %	390961435
22997	NC_018015	CTT	2	6	1232058	1232063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961435
22998	NC_018015	CCT	2	6	1232102	1232107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961435
22999	NC_018015	TCT	2	6	1232114	1232119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961435
23000	NC_018015	GAG	2	6	1232157	1232162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961435

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