MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_018015	GGA	2	6	1182583	1182588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961380
22003	NC_018015	CGGTTA	2	12	1182622	1182633	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390961380
22004	NC_018015	GTG	2	6	1182690	1182695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961380
22005	NC_018015	CGA	2	6	1182739	1182744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961380
22006	NC_018015	GGA	2	6	1182792	1182797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961380
22007	NC_018015	CCT	2	6	1182856	1182861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961381
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22009	NC_018015	GAA	2	6	1182907	1182912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961381
22010	NC_018015	CCA	2	6	1182997	1183002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961381
22011	NC_018015	GCCCT	2	10	1183013	1183022	0 %	20 %	20 %	60 %	390961381
22012	NC_018015	T	6	6	1183041	1183046	0 %	100 %	0 %	0 %	390961381
22013	NC_018015	TGG	2	6	1183122	1183127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961381
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22015	NC_018015	GACCA	2	10	1183202	1183211	40 %	0 %	20 %	40 %	390961381
22016	NC_018015	GTA	2	6	1183261	1183266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961381
22017	NC_018015	T	7	7	1183278	1183284	0 %	100 %	0 %	0 %	390961381
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22347	NC_018015	CTC	2	6	1201436	1201441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961401
22348	NC_018015	CCA	2	6	1201543	1201548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961401
22349	NC_018015	CTC	2	6	1201725	1201730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961402
22350	NC_018015	GCT	2	6	1201811	1201816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961402
22351	NC_018015	CCTGC	2	10	1201833	1201842	0 %	20 %	20 %	60 %	390961402
22352	NC_018015	CTC	2	6	1201854	1201859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961402
22353	NC_018015	CTT	2	6	1201866	1201871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961402
22354	NC_018015	TGT	2	6	1201943	1201948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961402
22355	NC_018015	TCTCGA	2	12	1201961	1201972	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390961402
22356	NC_018015	GGCG	2	8	1202003	1202010	0 %	0 %	75 %	25 %	390961402
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22374	NC_018015	CCTCA	2	10	1202721	1202730	20 %	20 %	0 %	60 %	390961403
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22458	NC_018015	GCC	2	6	1206133	1206138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961406
22459	NC_018015	CGCT	2	8	1206209	1206216	0 %	25 %	25 %	50 %	390961406
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22461	NC_018015	GCTC	2	8	1206242	1206249	0 %	25 %	25 %	50 %	390961406
22462	NC_018015	GTAC	2	8	1206257	1206264	25 %	25 %	25 %	25 %	390961406
22463	NC_018015	TC	3	6	1206278	1206283	0 %	50 %	0 %	50 %	390961406
22464	NC_018015	TCT	2	6	1206305	1206310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961406
22465	NC_018015	GAT	2	6	1206312	1206317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961406
22466	NC_018015	G	6	6	1206326	1206331	0 %	0 %	100 %	0 %	390961406
22467	NC_018015	CGA	2	6	1206347	1206352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961406
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22470	NC_018015	CAG	2	6	1206581	1206586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961407
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22481	NC_018015	TGG	3	9	1206994	1207002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961408
22482	NC_018015	CGA	2	6	1207006	1207011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961408
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22489	NC_018015	GGC	2	6	1207307	1207312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961408
22490	NC_018015	ATC	2	6	1207356	1207361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961408
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22492	NC_018015	CTG	2	6	1207672	1207677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961409
22493	NC_018015	CTC	2	6	1207833	1207838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961409
22494	NC_018015	CCAC	2	8	1207933	1207940	25 %	0 %	0 %	75 %	390961409
22495	NC_018015	GCC	3	9	1207974	1207982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961409
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22500	NC_018015	ACGA	2	8	1208139	1208146	50 %	0 %	25 %	25 %	390961409

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