MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_018015	TTC	2	6	1155410	1155415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961355
21503	NC_018015	CGT	2	6	1155438	1155443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961355
21504	NC_018015	CGCC	2	8	1155465	1155472	0 %	0 %	25 %	75 %	390961355
21505	NC_018015	TCT	2	6	1155480	1155485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961355
21506	NC_018015	CTT	2	6	1155646	1155651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961355
21507	NC_018015	CAT	2	6	1155664	1155669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961355
21508	NC_018015	CCT	2	6	1155708	1155713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961355
21509	NC_018015	AGA	2	6	1155720	1155725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961355
21510	NC_018015	CAG	2	6	1155734	1155739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961355
21511	NC_018015	GTA	2	6	1155892	1155897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961355
21512	NC_018015	GTA	2	6	1155913	1155918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961355
21513	NC_018015	GCC	2	6	1155967	1155972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961355
21514	NC_018015	CTC	2	6	1156001	1156006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961355
21515	NC_018015	ATG	2	6	1156115	1156120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961355
21516	NC_018015	TTCT	2	8	1156150	1156157	0 %	75 %	0 %	25 %	390961355
21517	NC_018015	CGC	2	6	1156158	1156163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961355
21518	NC_018015	GA	3	6	1156369	1156374	50 %	0 %	50 %	0 %	390961356
21519	NC_018015	CTC	2	6	1156403	1156408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961356
21520	NC_018015	TCA	2	6	1156557	1156562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961356
21521	NC_018015	GAA	2	6	1156576	1156581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961356
21522	NC_018015	GAC	2	6	1156634	1156639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961356
21523	NC_018015	CTA	2	6	1156651	1156656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961356
21524	NC_018015	AGA	2	6	1156695	1156700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961356
21525	NC_018015	GAA	2	6	1156737	1156742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961357
21526	NC_018015	GAG	2	6	1156747	1156752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961357
21527	NC_018015	ACG	2	6	1156823	1156828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961357
21528	NC_018015	GGA	2	6	1156866	1156871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961357
21529	NC_018015	TCG	2	6	1156889	1156894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961357
21530	NC_018015	CGA	2	6	1156914	1156919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961357
21531	NC_018015	GAG	2	6	1156948	1156953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961357
21532	NC_018015	AACA	2	8	1156962	1156969	75 %	0 %	0 %	25 %	390961357
21533	NC_018015	GCC	2	6	1156979	1156984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961357
21534	NC_018015	CGACC	2	10	1156998	1157007	20 %	0 %	20 %	60 %	390961357
21535	NC_018015	GAG	2	6	1157008	1157013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961357
21536	NC_018015	GGCA	2	8	1157086	1157093	25 %	0 %	50 %	25 %	390961357
21537	NC_018015	ACC	2	6	1157210	1157215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961357
21538	NC_018015	GCC	2	6	1157235	1157240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961357
21539	NC_018015	GAG	2	6	1157248	1157253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961357
21540	NC_018015	AGGA	2	8	1157257	1157264	50 %	0 %	50 %	0 %	390961357
21541	NC_018015	TCT	2	6	1157293	1157298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961357
21542	NC_018015	ACC	2	6	1157758	1157763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961358
21543	NC_018015	GGCT	2	8	1157938	1157945	0 %	25 %	50 %	25 %	390961358
21544	NC_018015	TCT	2	6	1157960	1157965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961358
21545	NC_018015	CGA	2	6	1157967	1157972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961358
21546	NC_018015	ACACCA	2	12	1157975	1157986	50 %	0 %	0 %	50 %	390961358
21547	NC_018015	TCG	2	6	1157990	1157995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961358
21548	NC_018015	CG	3	6	1158026	1158031	0 %	0 %	50 %	50 %	390961358
21549	NC_018015	GAC	2	6	1158058	1158063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961358
21550	NC_018015	CCG	2	6	1158068	1158073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961358
21551	NC_018015	CTGGC	2	10	1158083	1158092	0 %	20 %	40 %	40 %	390961358
21552	NC_018015	ATA	2	6	1158223	1158228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961358
21553	NC_018015	GC	3	6	1158288	1158293	0 %	0 %	50 %	50 %	390961358
21554	NC_018015	AGGA	2	8	1158295	1158302	50 %	0 %	50 %	0 %	390961358
21555	NC_018015	ACC	2	6	1158340	1158345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961358
21556	NC_018015	TGG	2	6	1158487	1158492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961358
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21558	NC_018015	TCG	2	6	1158605	1158610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961358
21559	NC_018015	CTC	2	6	1158622	1158627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961358
21560	NC_018015	GAA	2	6	1158633	1158638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961358
21561	NC_018015	GAA	2	6	1158649	1158654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961358
21562	NC_018015	GGA	2	6	1158657	1158662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961358
21563	NC_018015	CGG	2	6	1158734	1158739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961358
21564	NC_018015	ATA	2	6	1158766	1158771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961358
21565	NC_018015	CAC	2	6	1158852	1158857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961358
21566	NC_018015	GGTCA	2	10	1158928	1158937	20 %	20 %	40 %	20 %	390961358
21567	NC_018015	CAT	2	6	1159020	1159025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961358
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21569	NC_018015	TCC	2	6	1159175	1159180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961358
21570	NC_018015	GGC	2	6	1159185	1159190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961358
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21587	NC_018015	GA	3	6	1159995	1160000	50 %	0 %	50 %	0 %	390961359
21588	NC_018015	GA	3	6	1160028	1160033	50 %	0 %	50 %	0 %	390961359
21589	NC_018015	CCT	2	6	1160039	1160044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961359
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21592	NC_018015	GGTG	2	8	1160239	1160246	0 %	25 %	75 %	0 %	390961359
21593	NC_018015	GA	3	6	1160291	1160296	50 %	0 %	50 %	0 %	390961360
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21597	NC_018015	GCCCTG	2	12	1160578	1160589	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	390961360
21598	NC_018015	AAAAAG	2	12	1160590	1160601	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	390961360
21599	NC_018015	CTT	2	6	1160610	1160615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961360
21600	NC_018015	CAGGA	2	10	1160689	1160698	40 %	0 %	40 %	20 %	390961360
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21602	NC_018015	GCGAT	2	10	1160810	1160819	20 %	20 %	40 %	20 %	390961360
21603	NC_018015	TTG	2	6	1160849	1160854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390961360
21604	NC_018015	GAAG	2	8	1160994	1161001	50 %	0 %	50 %	0 %	390961360
21605	NC_018015	TGGG	2	8	1161014	1161021	0 %	25 %	75 %	0 %	390961360
21606	NC_018015	GGC	2	6	1161024	1161029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961360
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21613	NC_018015	AAG	2	6	1161541	1161546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961360
21614	NC_018015	GGA	2	6	1161570	1161575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961360
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21616	NC_018015	TCCT	2	8	1161637	1161644	0 %	50 %	0 %	50 %	390961360
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