MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. CL1 chromosome

Total Repeats: 36405

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_018015	CCT	2	6	1130623	1130628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961329
21002	NC_018015	GGC	2	6	1130752	1130757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961329
21003	NC_018015	CTC	2	6	1130768	1130773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961329
21004	NC_018015	GC	3	6	1130784	1130789	0 %	0 %	50 %	50 %	390961329
21005	NC_018015	CCTC	2	8	1130826	1130833	0 %	25 %	0 %	75 %	390961329
21006	NC_018015	TCG	2	6	1130880	1130885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961329
21007	NC_018015	TCG	2	6	1130898	1130903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961329
21008	NC_018015	CTC	2	6	1130918	1130923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961329
21009	NC_018015	GC	3	6	1130950	1130955	0 %	0 %	50 %	50 %	390961329
21010	NC_018015	TCC	2	6	1131000	1131005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961329
21011	NC_018015	TCG	2	6	1131048	1131053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961329
21012	NC_018015	CTT	2	6	1131085	1131090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961329
21013	NC_018015	TCT	2	6	1131168	1131173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961329
21014	NC_018015	CTT	2	6	1131205	1131210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961329
21015	NC_018015	TCC	2	6	1131213	1131218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961329
21016	NC_018015	CCT	2	6	1131229	1131234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961329
21017	NC_018015	GGC	2	6	1131260	1131265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961329
21018	NC_018015	GGAA	2	8	1131280	1131287	50 %	0 %	50 %	0 %	390961330
21019	NC_018015	CTG	2	6	1131309	1131314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961330
21020	NC_018015	CTC	2	6	1131321	1131326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961330
21021	NC_018015	GCC	2	6	1131366	1131371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961330
21022	NC_018015	CTTC	2	8	1131429	1131436	0 %	50 %	0 %	50 %	390961330
21023	NC_018015	TGA	2	6	1131514	1131519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961330
21024	NC_018015	GGA	2	6	1131601	1131606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961330
21025	NC_018015	CGC	2	6	1131632	1131637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961330
21026	NC_018015	CCCA	2	8	1131699	1131706	25 %	0 %	0 %	75 %	390961330
21027	NC_018015	CTC	2	6	1131708	1131713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961330
21028	NC_018015	CGG	2	6	1131725	1131730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961330
21029	NC_018015	TGGG	2	8	1131846	1131853	0 %	25 %	75 %	0 %	390961330
21030	NC_018015	TGA	2	6	1131910	1131915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961330
21031	NC_018015	CTC	2	6	1131927	1131932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961330
21032	NC_018015	TTC	2	6	1131970	1131975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961330
21033	NC_018015	CTG	2	6	1131984	1131989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961330
21034	NC_018015	TGA	2	6	1132030	1132035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961330
21035	NC_018015	ATTCTC	2	12	1132037	1132048	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	390961330
21036	NC_018015	ACG	2	6	1132050	1132055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961330
21037	NC_018015	CCT	2	6	1132109	1132114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961330
21038	NC_018015	TCG	2	6	1132150	1132155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961330
21039	NC_018015	AGG	2	6	1132224	1132229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961330
21040	NC_018015	CCT	2	6	1132274	1132279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961330
21041	NC_018015	GGT	2	6	1132289	1132294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961330
21042	NC_018015	TGG	3	9	1132398	1132406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961330
21043	NC_018015	GTC	2	6	1132419	1132424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961330
21044	NC_018015	GAT	2	6	1132467	1132472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961330
21045	NC_018015	ATC	2	6	1132534	1132539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961331
21046	NC_018015	TCT	2	6	1132574	1132579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961331
21047	NC_018015	TGA	2	6	1132583	1132588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961331
21048	NC_018015	ACA	2	6	1132627	1132632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961331
21049	NC_018015	CCT	2	6	1132661	1132666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961331
21050	NC_018015	CTTTC	2	10	1132705	1132714	0 %	60 %	0 %	40 %	390961331
21051	NC_018015	ACC	2	6	1132811	1132816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961332
21052	NC_018015	A	7	7	1132934	1132940	100 %	0 %	0 %	0 %	390961332
21053	NC_018015	GAGG	2	8	1132989	1132996	25 %	0 %	75 %	0 %	390961332
21054	NC_018015	ATA	2	6	1133002	1133007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390961332
21055	NC_018015	CGC	2	6	1133033	1133038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961332
21056	NC_018015	G	6	6	1133202	1133207	0 %	0 %	100 %	0 %	390961332
21057	NC_018015	ATC	2	6	1133218	1133223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961332
21058	NC_018015	GAA	2	6	1133274	1133279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961332
21059	NC_018015	GGCGAT	2	12	1133289	1133300	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	390961332
21060	NC_018015	CGC	2	6	1133329	1133334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961332
21061	NC_018015	AGG	3	9	1133338	1133346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961332
21062	NC_018015	GGA	2	6	1133358	1133363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961332
21063	NC_018015	GAGG	2	8	1133379	1133386	25 %	0 %	75 %	0 %	390961332
21064	NC_018015	CTT	2	6	1133434	1133439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961332
21065	NC_018015	ACC	2	6	1133543	1133548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961333
21066	NC_018015	GCTATC	2	12	1133552	1133563	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390961333
21067	NC_018015	CGCTAT	2	12	1133656	1133667	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	390961333
21068	NC_018015	GCA	2	6	1133934	1133939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961334
21069	NC_018015	ACA	2	6	1133976	1133981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961334
21070	NC_018015	TCG	2	6	1133997	1134002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961334
21071	NC_018015	CT	3	6	1134059	1134064	0 %	50 %	0 %	50 %	390961334
21072	NC_018015	GGAA	2	8	1134071	1134078	50 %	0 %	50 %	0 %	390961334
21073	NC_018015	GAG	2	6	1134101	1134106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961334
21074	NC_018015	AAG	2	6	1134107	1134112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961334
21075	NC_018015	TC	3	6	1134163	1134168	0 %	50 %	0 %	50 %	390961334
21076	NC_018015	AGG	2	6	1134236	1134241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961334
21077	NC_018015	GGA	2	6	1134358	1134363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961334
21078	NC_018015	GAG	2	6	1134494	1134499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961334
21079	NC_018015	CGTTT	2	10	1134514	1134523	0 %	60 %	20 %	20 %	390961334
21080	NC_018015	GAGC	2	8	1134586	1134593	25 %	0 %	50 %	25 %	390961334
21081	NC_018015	CTCTGG	2	12	1134719	1134730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961334
21082	NC_018015	CTCTAC	2	12	1134839	1134850	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	390961334
21083	NC_018015	CGG	2	6	1135021	1135026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961334
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21085	NC_018015	CGT	2	6	1135093	1135098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961334
21086	NC_018015	CG	3	6	1135110	1135115	0 %	0 %	50 %	50 %	390961334
21087	NC_018015	AGA	2	6	1135171	1135176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961334
21088	NC_018015	GAG	2	6	1135202	1135207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961334
21089	NC_018015	TTC	2	6	1135208	1135213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961334
21090	NC_018015	CGG	2	6	1135267	1135272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961334
21091	NC_018015	ACG	2	6	1135386	1135391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961334
21092	NC_018015	CTG	2	6	1135481	1135486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961334
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21097	NC_018015	GAA	2	6	1135940	1135945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961335
21098	NC_018015	GGT	2	6	1135975	1135980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961335
21099	NC_018015	GAG	2	6	1135997	1136002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961335
21100	NC_018015	ATG	2	6	1136139	1136144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961335
21101	NC_018015	CTC	2	6	1136177	1136182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390961335
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21103	NC_018015	GAG	2	6	1136228	1136233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961335
21104	NC_018015	AAG	2	6	1136577	1136582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961336
21105	NC_018015	GAA	2	6	1136588	1136593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961336
21106	NC_018015	CTA	2	6	1136597	1136602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961336
21107	NC_018015	AGA	2	6	1136620	1136625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390961336
21108	NC_018015	TTC	2	6	1136686	1136691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961336
21109	NC_018015	GCC	2	6	1136697	1136702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961336
21110	NC_018015	TGA	2	6	1136755	1136760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961336
21111	NC_018015	CGT	2	6	1136768	1136773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961336
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21113	NC_018015	CGG	2	6	1136819	1136824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390961336
21114	NC_018015	CGA	2	6	1136849	1136854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961336
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21116	NC_018015	AGG	2	6	1136910	1136915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961336
21117	NC_018015	TTCCC	2	10	1136923	1136932	0 %	40 %	0 %	60 %	390961336
21118	NC_018015	CGA	2	6	1136936	1136941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961336
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21231	NC_018015	GAG	2	6	1141457	1141462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961338
21232	NC_018015	GA	3	6	1141478	1141483	50 %	0 %	50 %	0 %	390961338
21233	NC_018015	ACA	2	6	1141497	1141502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390961338
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21337	NC_018015	GCCTGG	2	12	1146229	1146240	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	390961343
21338	NC_018015	GAT	2	6	1146241	1146246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390961343
21339	NC_018015	CCCGA	2	10	1146923	1146932	20 %	0 %	20 %	60 %	390961344
21340	NC_018015	ACG	2	6	1147058	1147063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961344
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21342	NC_018015	GTC	2	6	1147099	1147104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961344
21343	NC_018015	TGG	2	6	1147116	1147121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390961344
21344	NC_018015	ACG	2	6	1147136	1147141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961344
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21347	NC_018015	ACGCG	2	10	1147376	1147385	20 %	0 %	40 %	40 %	390961344
21348	NC_018015	CAAAG	2	10	1147419	1147428	60 %	0 %	20 %	20 %	390961344
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21463	NC_018015	A	6	6	1153752	1153757	100 %	0 %	0 %	0 %	390961353
21464	NC_018015	GCC	2	6	1153771	1153776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961353
21465	NC_018015	GGA	2	6	1153844	1153849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961353
21466	NC_018015	TCCACC	2	12	1153887	1153898	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	390961353
21467	NC_018015	CTG	2	6	1153907	1153912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961353
21468	NC_018015	GCC	2	6	1153939	1153944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390961353
21469	NC_018015	TGAGG	2	10	1153969	1153978	20 %	20 %	60 %	0 %	390961353
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21481	NC_018015	TCG	2	6	1154352	1154357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961354
21482	NC_018015	AGG	2	6	1154391	1154396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390961354
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21485	NC_018015	TCT	2	6	1154493	1154498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390961355
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21490	NC_018015	CAT	2	6	1154728	1154733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390961355
21491	NC_018015	GTC	2	6	1154842	1154847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390961355
21492	NC_018015	GAGCTT	2	12	1154884	1154895	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390961355
21493	NC_018015	CAC	2	6	1154992	1154997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390961355
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21498	NC_018015	TCCT	2	8	1155212	1155219	0 %	50 %	0 %	50 %	390961355
21499	NC_018015	CGA	2	6	1155231	1155236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390961355
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